转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 118 / 136 下载 TSV

上一页 118 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002115 Chr06 NC_080392.1:28270048-28270058promoter 内 341-351 bp + 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 28273708-28273813(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ATCTCAGCGCA
SmilChr02G003184 Chr02 NC_080388.1:52982576-52982586promoter 内 330-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 52986247-52990483(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCA
SmilChr03G000378 Chr03 NC_080389.1:4226091-4226101promoter 内 312-322 bp + 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 4229780-4233095(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr01G003988 Chr01 NC_080387.1:58304662-58304672promoter 内 272-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 58308391-58311924(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAA
SmilChr07G003148 Chr07 NC_080393.1:33380192-33380202promoter 内 259-269 bp - 3732 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 33383934-33389391(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGCT
SmilChr07G004624 Chr07 NC_080393.1:59046687-59046697promoter 内 247-257 bp + 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 59050441-59051403(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr03G000034 Chr03 NC_080389.1:428174-428184promoter 内 235-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 417468-424418(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCA
SmilChr01G004021 Chr01 NC_080387.1:58602402-58602412promoter 内 227-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 58606176-58610147(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr01G000176 Chr01 NC_080387.1:2892869-2892879promoter 内 197-207 bp - 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 2896673-2900364(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGAT
SmilChr01G001837 Chr01 NC_080387.1:33310374-33310384promoter 内 196-206 bp + 3795 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 33314179-33315891(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTTCAGCGCA
SmilChr08G001041 Chr08 NC_080394.1:7932045-7932055promoter 内 140-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 7935906-7940189(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCA
SmilChr04G001212 Chr04 NC_080390.1:18842096-18842106promoter 内 132-142 bp - 3859 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 18845965-18849480(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACTT
SmilChr07G004323 Chr07 NC_080393.1:55780324-55780334promoter 内 112-122 bp + 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 55771957-55776445(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACTT
SmilChr03G002600 Chr03 NC_080389.1:41293132-41293142promoter 内 74-84 bp - 3917 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 41297059-41300263(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr03G000915 Chr03 NC_080389.1:10474773-10474783promoter 内 66-76 bp + 3925 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 10469068-10470848(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCA
SmilChr01G003916 Chr01 NC_080387.1:57441796-57441806promoter 内 49-59 bp - 3942 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 57435045-57437854(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AAGTCAGCGCC
SmilChr08G002257 Chr08 NC_080394.1:20804364-20804374promoter 内 47-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 20799770-20800420(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCA
SmilChr07G000720 Chr07 NC_080393.1:5011094-5011104promoter 内 39-49 bp - 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 5005896-5007142(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAA
SmilChr08G001440 Chr08 NC_080394.1:11546695-11546705promoter 内 37-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 11550659-11557114(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCA
SmilChr08G003872 Chr08 NC_080394.1:45817047-45817057promoter 内 30-40 bp - 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 45821018-45821091(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCTGAGCC
SmilChr05G002791 Chr05 NC_080391.1:32638221-32638231promoter 内 20-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 32642202-32646200(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACTT
SmilChr02G000120 Chr02 NC_080388.1:1608223-1608233promoter 内 10-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 1603431-1604242(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGACCA
SmilChr06G003188 Chr06 NC_080392.1:44787795-44787805promoter 内 8-18 bp - 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 44780598-44783812(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGAA
SmilChr02G003550 Chr02 NC_080388.1:56640349-56640359promoter 内 6-16 bp + 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 56631586-56636364(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAAGG
SmilChr01G002245 Chr01 NC_080387.1:39018595-39018605promoter 内 5-15 bp - 3986 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 39013202-39014609(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCT
SmilChr08G002545 Chr08 NC_080394.1:24727392-24727402promoter 内 2-12 bp + 3989 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.8/ 100 1 24731391-24735412(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCTG
SmilChr04G003359 Chr04 NC_080390.1:50188345-50188355promoter 内 1902-1912 bp - 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 3 50190444-50193928(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr05G004292 Chr05 NC_080391.1:56676935-56676945promoter 内 3714-3724 bp + 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 56674063-56676658(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr01G000444 Chr01 NC_080387.1:9019711-9019721promoter 内 3015-3025 bp - 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 9018391-9018735(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTT
SmilChr05G000542 Chr05 NC_080391.1:4145340-4145350promoter 内 2937-2947 bp - 1054 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 4146404-4153035(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGCCG
SmilChr05G004293 Chr05 NC_080391.1:56677900-56677910promoter 内 2936-2946 bp - 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 56678965-56680666(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr01G000461 Chr01 NC_080387.1:9453987-9453997promoter 内 1911-1921 bp - 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 9456077-9462670(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr06G001051 Chr06 NC_080392.1:10369121-10369131promoter 内 1738-1748 bp - 2253 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 10362673-10366868(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGT
SmilChr02G002218 Chr02 NC_080388.1:39428738-39428748promoter 内 1241-1251 bp - 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 39421720-39425988(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr01G001092 Chr01 NC_080387.1:22377285-22377295promoter 内 900-910 bp - 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 22371515-22374194(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTTCAGCGCT
SmilChr01G001333 Chr01 NC_080387.1:26524039-26524049promoter 内 325-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 26527715-26528434(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCT
SmilChr03G000532 Chr03 NC_080389.1:5737072-5737082promoter 内 140-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 2 5729640-5733221(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCT
SmilChr06G001186 Chr06 NC_080392.1:12074210-12074220promoter 内 3985-3995 bp + 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 12074226-12079903(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AATTCAGCGCG
SmilChr04G000858 Chr04 NC_080390.1:10888769-10888779promoter 内 3933-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 10887216-10888711(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr04G003366 Chr04 NC_080390.1:50243412-50243422promoter 内 3895-3905 bp - 96 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 50243518-50249100(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGGCTGAGCT
SmilChr07G004708 Chr07 NC_080393.1:59948111-59948121promoter 内 3859-3869 bp + 132 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 59947368-59947979(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGTT
SmilChr01G001160 Chr01 NC_080387.1:23564848-23564858promoter 内 3842-3852 bp + 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 23565007-23582155(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AATTCAGCGCG
SmilChr05G004207 Chr05 NC_080391.1:55962990-55963000promoter 内 3817-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 55961538-55962816(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGCCAGCGCG
SmilChr06G000633 Chr06 NC_080392.1:5596165-5596175promoter 内 3762-3772 bp - 229 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 5595075-5595936(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr03G004089 Chr03 NC_080389.1:59789278-59789288promoter 内 3761-3771 bp + 230 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 59786087-59789048(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGGCTGAGCT
SmilChr03G002746 Chr03 NC_080389.1:43643240-43643250promoter 内 3705-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 43643536-43646067(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACT
SmilChr06G002488 Chr06 NC_080392.1:35765613-35765623promoter 内 3690-3700 bp - 301 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 35765924-35770133(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATT
SmilChr01G001653 Chr01 NC_080387.1:30587117-30587127promoter 内 3668-3678 bp - 323 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 30587450-30600951(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACT
SmilChr05G001043 Chr05 NC_080391.1:8536528-8536538promoter 内 3660-3670 bp - 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 8536869-8538069(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGGCTGAGCT
SmilChr01G000093 Chr01 NC_080387.1:1664828-1664838promoter 内 3659-3669 bp + 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 1661439-1664496(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGCCG