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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 118 / 135 下载 TSV

上一页 118 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001831 Chr03 NC_080389.1:25087553-25087567promoter 内 3009-3023 bp + 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 25088545-25089437(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACAGATGTTATCCTT
SmilChr02G001150 Chr02 NC_080388.1:20958614-20958628promoter 内 3008-3022 bp + 979 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 20959607-20961547(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCACCCCTTATCTTT
SmilChr01G000700 Chr01 NC_080387.1:15693152-15693166promoter 内 3005-3019 bp - 982 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 15690510-15692170(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAATAGCTTATCCCA
SmilChr02G001929 Chr02 NC_080388.1:34701862-34701876promoter 内 3005-3019 bp + 982 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 34697622-34700880(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAACCAAAAA
SmilChr02G002943 Chr02 NC_080388.1:49931039-49931053promoter 内 2894-2908 bp - 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 49932146-49933072(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAACCAAAAA
SmilChr03G002094 Chr03 NC_080389.1:32357782-32357796promoter 内 2855-2869 bp + 1132 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 32358928-32362842(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGCGACCATATCCTC
SmilChr03G002759 Chr03 NC_080389.1:43876178-43876192promoter 内 2852-2866 bp - 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 43872477-43875043(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCACCCCTTATCTTT
SmilChr03G002747 Chr03 NC_080389.1:43664646-43664660promoter 内 2851-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 43660956-43663510(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCACCCCTTATCTTT
SmilChr03G002004 Chr03 NC_080389.1:29860390-29860404promoter 内 2819-2833 bp + 1168 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 29858010-29859222(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAATATCATA
SmilChr03G000241 Chr03 NC_080389.1:2857988-2858002promoter 内 2806-2820 bp + 1181 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 2855374-2856807(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGTGATAAGGAAACT
SmilChr03G000104 Chr03 NC_080389.1:1159898-1159912promoter 内 2785-2799 bp + 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 1155514-1158696(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGTGATAAGGAAACT
SmilChr02G005056 Chr02 NC_080388.1:72267609-72267623promoter 内 2742-2756 bp - 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 72268868-72276167(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAATCATGTA
SmilChr01G000371 Chr01 NC_080387.1:7668016-7668030promoter 内 2723-2737 bp + 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 7664912-7666752(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGTTTTTT
SmilChr03G000289 Chr03 NC_080389.1:3282701-3282715promoter 内 2709-2723 bp + 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 3278701-3281423(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGGGTGA
SmilChr01G001328 Chr01 NC_080387.1:26438449-26438463promoter 内 2700-2714 bp - 1287 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 26434729-26437162(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAACCCTTATCTCT
SmilChr03G000076 Chr03 NC_080389.1:931339-931353promoter 内 2686-2700 bp + 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 927039-930038(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGTGATAAGGAAACT
SmilChr02G000841 Chr02 NC_080388.1:14257656-14257670promoter 内 2616-2630 bp + 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 14259041-14261920(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATATTATCCTT
SmilChr01G001854 Chr01 NC_080387.1:33475860-33475874promoter 内 2607-2621 bp + 1380 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 33471818-33474480(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTGATAAGGAGGGC
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SmilChr02G001697 Chr02 NC_080388.1:31278039-31278053promoter 内 2536-2550 bp - 1451 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 31271023-31276588(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTTAACTTATCCTT
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SmilChr02G003730 Chr02 NC_080388.1:58936533-58936547promoter 内 2352-2366 bp - 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 58929601-58934898(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGAAACTTATCCTT
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SmilChr02G001960 Chr02 NC_080388.1:35389235-35389249promoter 内 2178-2192 bp + 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 35386959-35387426(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCAGATAAGGTGTAT
SmilChr02G002258 Chr02 NC_080388.1:40014296-40014310promoter 内 2002-2016 bp + 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 40010445-40012311(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATAAGGCAATC
SmilChr02G005577 Chr02 NC_080388.1:75622126-75622140promoter 内 1974-1988 bp - 2013 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 75624153-75625917(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTGATAAGGCAAGA
SmilChr02G004599 Chr02 NC_080388.1:68517637-68517651promoter 内 1942-1956 bp + 2045 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 68511315-68515592(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAACCAAAAA
SmilChr02G005310 Chr02 NC_080388.1:73996666-73996680promoter 内 1939-1953 bp + 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 73998728-74000883(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATCGGCTTATCCAA
SmilChr01G001157 Chr01 NC_080387.1:23521921-23521935promoter 内 1920-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 23515547-23519854(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAAGATATT
SmilChr01G005801 Chr01 NC_080387.1:74085849-74085863promoter 内 1903-1917 bp - 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 74087947-74093377(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGGGTGA
SmilChr01G002265 Chr01 NC_080387.1:39442181-39442195promoter 内 1894-1908 bp - 2093 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 39444288-39446912(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATATGATAATT
SmilChr01G002479 Chr01 NC_080387.1:42531989-42532003promoter 内 1855-1869 bp - 2132 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 42529408-42529857(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTGGTTATCCTC
SmilChr01G001866 Chr01 NC_080387.1:33641200-33641214promoter 内 1773-1787 bp - 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 33643428-33644575(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTGATAAGGAGGGC
SmilChr01G000373 Chr01 NC_080387.1:7683990-7684004promoter 内 1764-1778 bp + 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 7686227-7698295(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAAAACTTATCCAT
SmilChr03G002703 Chr03 NC_080389.1:42978934-42978948promoter 内 1712-1726 bp + 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 42981223-42983855(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTGGTTATCCTC
SmilChr01G002578 Chr01 NC_080387.1:43926232-43926246promoter 内 1643-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 43922847-43923888(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGATCCTTATCACA
SmilChr01G002309 Chr01 NC_080387.1:40063799-40063813promoter 内 1633-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 40066167-40066763(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGCACCTTATCACA
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SmilChr01G004051 Chr01 NC_080387.1:58966365-58966379promoter 内 1572-1586 bp + 2415 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 58956726-58963950(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGTATGTT
SmilChr01G005828 Chr01 NC_080387.1:74275224-74275238promoter 内 1434-1448 bp + 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 74277791-74324746(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCACCCCTTATCTTT
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SmilChr01G003811 Chr01 NC_080387.1:56489967-56489981promoter 内 1350-1364 bp - 2637 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 56485183-56487330(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTTGGCTTATCCAC
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SmilChr01G000199 Chr01 NC_080387.1:3430977-3430991promoter 内 1261-1275 bp + 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 3433717-3434676(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTGCCTTATCAAT
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SmilChr01G006170 Chr01 NC_080387.1:77211861-77211875promoter 内 1080-1094 bp - 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 77205882-77208954(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGTTTCTTATCCCT
SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40265538-40265552promoter 内 1072-1086 bp + 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.9/ 100 1 40268467-40269588(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTATAACTTATCCAA