转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 119 / 149 下载 TSV

上一页 119 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005195 Chr02 NC_080388.1:73209350-73209360promoter 内 1489-1499 bp - 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73211862-73215804(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr05G002643 Chr05 NC_080391.1:29821117-29821127promoter 内 1484-1494 bp + 2507 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 29823634-29826274(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCCGCTGTCA
SmilChr04G003505 Chr04 NC_080390.1:51445518-51445528promoter 内 1460-1470 bp - 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 51448059-51449794(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr04G002982 Chr04 NC_080390.1:46240758-46240768promoter 内 1394-1404 bp - 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 46243365-46254252(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr04G002554 Chr04 NC_080390.1:40836675-40836685promoter 内 1373-1383 bp + 2618 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 40831681-40834057(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr01G002681 Chr01 NC_080387.1:45030325-45030335promoter 内 1363-1373 bp - 2628 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 45025964-45027697(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr02G005193 Chr02 NC_080388.1:73209350-73209360promoter 内 1359-1369 bp - 2632 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73203421-73206718(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr05G002674 Chr05 NC_080391.1:30220324-30220334promoter 内 1329-1339 bp + 2662 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30216484-30217662(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGC
SmilChr01G004708 Chr01 NC_080387.1:65188056-65188066promoter 内 1318-1328 bp - 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 65183708-65185383(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr01G000610 Chr01 NC_080387.1:13495812-13495822promoter 内 1242-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13489710-13493063(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr01G006037 Chr01 NC_080387.1:75872314-75872324promoter 内 1230-1240 bp + 2761 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 75875085-75878965(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr04G003189 Chr04 NC_080390.1:48592567-48592577promoter 内 1115-1125 bp - 2876 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 48580804-48589691(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCC
SmilChr04G001623 Chr04 NC_080390.1:27001694-27001704promoter 内 977-987 bp + 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 26994654-26998680(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGA
SmilChr05G000032 Chr05 NC_080391.1:158134-158144promoter 内 863-873 bp + 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 154081-155006(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr06G001866 Chr06 NC_080392.1:22074420-22074430promoter 内 857-867 bp + 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22068029-22071286(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr01G006035 Chr01 NC_080387.1:75872314-75872324promoter 内 850-860 bp + 3141 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 75867731-75869173(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr06G001859 Chr06 NC_080392.1:22022937-22022947promoter 内 830-840 bp + 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22026108-22028609(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr05G003739 Chr05 NC_080391.1:50463829-50463839promoter 内 827-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50457361-50460665(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr06G001853 Chr06 NC_080392.1:21908982-21908992promoter 内 827-837 bp + 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21912156-21914649(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAT
SmilChr04G000071 Chr04 NC_080390.1:669557-669567promoter 内 814-824 bp + 3177 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 662723-666380(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr01G001515 Chr01 NC_080387.1:28995113-28995123promoter 内 810-820 bp - 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 28998304-29000650(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr02G000011 Chr02 NC_080388.1:85576-85586promoter 内 809-819 bp + 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 88768-90515(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCG
SmilChr03G004622 Chr03 NC_080389.1:63895963-63895973promoter 内 798-808 bp - 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 63899166-63902492(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr04G001624 Chr04 NC_080390.1:27001694-27001704promoter 内 791-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 27004904-27011019(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAC
SmilChr03G004511 Chr03 NC_080389.1:63190840-63190850promoter 内 790-800 bp - 3201 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 63186729-63187639(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGTAC
SmilChr07G000730 Chr07 NC_080393.1:5092513-5092523promoter 内 787-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5083408-5089309(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr05G000803 Chr05 NC_080391.1:6279578-6279588promoter 内 773-783 bp - 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 6282806-6285049(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr07G000821 Chr07 NC_080393.1:5790284-5790294promoter 内 704-714 bp + 3287 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 5793581-5795278(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG
SmilChr02G000484 Chr02 NC_080388.1:6600565-6600575promoter 内 667-677 bp - 3324 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 6603899-6605266(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAA
SmilChr04G002653 Chr04 NC_080390.1:41946187-41946197promoter 内 591-601 bp - 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 41941658-41942787(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCCGCTGTCA
SmilChr05G000778 Chr05 NC_080391.1:6083425-6083435promoter 内 567-577 bp - 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 6078851-6080001(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCG
SmilChr05G002150 Chr05 NC_080391.1:22716613-22716623promoter 内 540-550 bp - 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 22707872-22713162(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCC
SmilChr07G002363 Chr07 NC_080393.1:21945281-21945291promoter 内 515-525 bp + 3476 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21939340-21941805(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGGT
SmilChr02G000704 Chr02 NC_080388.1:11323845-11323855promoter 内 274-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 11317401-11320128(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr01G000166 Chr01 NC_080387.1:2740934-2740944promoter 内 263-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 2736844-2737206(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr03G002814 Chr03 NC_080389.1:44601459-44601469promoter 内 257-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 44605203-44609089(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCTAGCTGTCT
SmilChr02G001860 Chr02 NC_080388.1:33830519-33830529promoter 内 210-220 bp - 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 33825683-33826738(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAG
SmilChr06G001637 Chr06 NC_080392.1:18428374-18428384promoter 内 173-183 bp - 3818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 18432202-18434438(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr02G005230 Chr02 NC_080388.1:73506851-73506861promoter 内 126-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 73497171-73502986(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr02G000709 Chr02 NC_080388.1:11433085-11433095promoter 内 113-123 bp - 3878 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 11436973-11442426(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGC
SmilChr02G003111 Chr02 NC_080388.1:52090509-52090519promoter 内 20-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 52085105-52086538(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTAGA
SmilChr06G001810 Chr06 NC_080392.1:21276993-21277003promoter 内 2607-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 21273324-21275609(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCCGCTGTCA
SmilChr03G003890 Chr03 NC_080389.1:57967117-57967127promoter 内 2190-2200 bp - 1801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 57964221-57965316(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTAA
SmilChr02G004566 Chr02 NC_080388.1:68180856-68180866promoter 内 1631-1641 bp + 2360 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 68183226-68185283(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCC
SmilChr02G004602 Chr02 NC_080388.1:68541410-68541420promoter 内 902-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 68537309-68538321(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CATAGCTGTCC
SmilChr07G000882 Chr07 NC_080393.1:6298041-6298051promoter 内 26-36 bp - 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 6302016-6302086(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAA
SmilChr04G003143 Chr04 NC_080390.1:48008753-48008763promoter 内 3956-3966 bp + 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 48008798-48014797(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCCGCTGTCA
SmilChr03G002698 Chr03 NC_080389.1:42955640-42955650promoter 内 3954-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 42955507-42955603(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAA
SmilChr07G000330 Chr07 NC_080393.1:2248918-2248928promoter 内 3941-3951 bp + 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2244615-2248868(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAA
SmilChr05G003750 Chr05 NC_080391.1:50633317-50633327promoter 内 3925-3935 bp + 66 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 50628230-50633251(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGAA