转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 127 / 143 下载 TSV

上一页 127 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005252 Chr01 NC_080387.1:70033375-70033386promoter 内 3240-3251 bp - 750 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 70034136-70036176(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGT
SmilChr05G001688 Chr05 NC_080391.1:16022145-16022156promoter 内 2651-2662 bp - 1339 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 16019380-16020806(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr06G001929 Chr06 NC_080392.1:23477298-23477309promoter 内 2011-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 23479288-23481377(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGT
SmilChr01G005251 Chr01 NC_080387.1:70033375-70033386promoter 内 1964-1975 bp - 2026 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 70029323-70031349(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGTT
SmilChr06G002772 Chr06 NC_080392.1:40321972-40321983promoter 内 1178-1189 bp + 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 40307238-40319160(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGT
SmilChr01G002276 Chr01 NC_080387.1:39523196-39523207promoter 内 1150-1161 bp - 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 39526047-39527688(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGT
SmilChr02G003979 Chr02 NC_080388.1:62055398-62055409promoter 内 3882-3893 bp - 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 62055517-62057055(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr01G001164 Chr01 NC_080387.1:23639132-23639143promoter 内 3788-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 23637805-23638930(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr05G000731 Chr05 NC_080391.1:5578355-5578366promoter 内 3766-3777 bp - 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 5578590-5579614(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAA
SmilChr04G002925 Chr04 NC_080390.1:45519947-45519958promoter 内 3742-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 45518617-45519699(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr01G001938 Chr01 NC_080387.1:34576491-34576502promoter 内 3535-3546 bp - 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 34576957-34578623(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAACTGTCAA
SmilChr08G000619 Chr08 NC_080394.1:4630492-4630503promoter 内 3450-3461 bp - 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4631043-4633758(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr07G001878 Chr07 NC_080393.1:16252839-16252850promoter 内 3421-3432 bp - 569 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16249440-16252270(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAG
SmilChr01G004595 Chr01 NC_080387.1:63935459-63935470promoter 内 3269-3280 bp + 721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 63932171-63934738(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr07G002177 Chr07 NC_080393.1:19948255-19948266promoter 内 3238-3249 bp - 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 19944295-19947503(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr06G002786 Chr06 NC_080392.1:40530934-40530945promoter 内 2724-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 40525695-40529668(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr02G005435 Chr02 NC_080388.1:74770790-74770801promoter 内 2450-2461 bp - 1540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 74764283-74769250(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTAGC
SmilChr01G002933 Chr01 NC_080387.1:48099459-48099470promoter 内 2447-2458 bp - 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 48101013-48104429(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAA
SmilChr08G002983 Chr08 NC_080394.1:29940011-29940022promoter 内 2441-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 29935055-29938462(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr01G000792 Chr01 NC_080387.1:17214678-17214689promoter 内 2338-2349 bp - 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 17210660-17213026(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAG
SmilChr04G002867 Chr04 NC_080390.1:44785190-44785201promoter 内 2229-2240 bp - 1761 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 44781304-44783429(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAG
SmilChr02G001731 Chr02 NC_080388.1:31801746-31801757promoter 内 2149-2160 bp + 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 31799366-31799905(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAACTGTCAA
SmilChr03G001412 Chr03 NC_080389.1:16780905-16780916promoter 内 2141-2152 bp + 1849 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16782765-16785073(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTAGC
SmilChr08G002786 Chr08 NC_080394.1:27553677-27553688promoter 内 2126-2137 bp + 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 27547235-27551813(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr03G001429 Chr03 NC_080389.1:16955892-16955903promoter 内 1884-1895 bp - 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 16947341-16953786(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAG
SmilChr08G002406 Chr08 NC_080394.1:22863975-22863986promoter 内 1872-1883 bp - 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 22857697-22861857(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr04G000419 Chr04 NC_080390.1:4418942-4418953promoter 内 1681-1692 bp - 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 4421262-4424889(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAA
SmilChr03G002508 Chr03 NC_080389.1:39932444-39932455promoter 内 1659-1670 bp - 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 39934786-39936151(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGT
SmilChr04G000374 Chr04 NC_080390.1:3772369-3772380promoter 内 1567-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 3774803-3775632(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAT
SmilChr03G003643 Chr03 NC_080389.1:55103946-55103957promoter 内 1398-1409 bp - 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 55106549-55107037(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAACTGTCAA
SmilChr03G002792 Chr03 NC_080389.1:44408228-44408239promoter 内 1395-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 44410834-44411931(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr02G004585 Chr02 NC_080388.1:68341132-68341143promoter 内 1371-1382 bp - 2619 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 68343762-68346106(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr03G002423 Chr03 NC_080389.1:38479166-38479177promoter 内 1302-1313 bp + 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 38481865-38483587(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr08G002426 Chr08 NC_080394.1:23037680-23037691promoter 内 1279-1290 bp + 2711 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 23031041-23034969(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAACTGTCAA
SmilChr05G000785 Chr05 NC_080391.1:6130628-6130639promoter 内 1251-1262 bp + 2739 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 6126607-6127889(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr07G002259 Chr07 NC_080393.1:20796305-20796316promoter 内 934-945 bp - 3056 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 20792285-20793249(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAG
SmilChr04G001485 Chr04 NC_080390.1:24293354-24293365promoter 内 915-926 bp + 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 24289586-24290279(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAACTGTCAA
SmilChr02G005103 Chr02 NC_080388.1:72576819-72576830promoter 内 740-751 bp + 3250 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 72570454-72573569(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAACTGTCAA
SmilChr04G002282 Chr04 NC_080390.1:37062982-37062993promoter 内 587-598 bp + 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 37056328-37059579(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAT
SmilChr08G003043 Chr08 NC_080394.1:30590100-30590111promoter 内 436-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 30593665-30596196(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAA
SmilChr01G002693 Chr01 NC_080387.1:45174982-45174993promoter 内 413-424 bp + 3577 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 45178570-45190535(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr02G001820 Chr02 NC_080388.1:33075356-33075367promoter 内 227-238 bp - 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 33066570-33071593(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCGT
SmilChr01G002636 Chr01 NC_080387.1:44637000-44637011promoter 内 205-216 bp + 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 1 44640796-44644909(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTG
SmilChr06G000754 Chr06 NC_080392.1:6988515-6988526promoter 内 3372-3383 bp + 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 2 6989144-6989678(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC
SmilChr08G000212 Chr08 NC_080394.1:1439491-1439502promoter 内 3970-3981 bp + 20 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 1439522-1445120(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGAC
SmilChr03G000723 Chr03 NC_080389.1:8082804-8082815promoter 内 3902-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 8079517-8082716(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGG
SmilChr08G001607 Chr08 NC_080394.1:13308298-13308309promoter 内 3899-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 13308400-13312437(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAA
SmilChr07G001762 Chr07 NC_080393.1:14912257-14912268promoter 内 3786-3797 bp - 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 14912472-14919896(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGCAGCTGTCCC
SmilChr08G002653 Chr08 NC_080394.1:26021703-26021714promoter 内 3736-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 26018446-26021449(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTAAA
SmilChr08G000826 Chr08 NC_080394.1:6108322-6108333promoter 内 3728-3739 bp - 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.0/ 100 1 6106298-6108060(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTATC