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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 13 / 164 下载 TSV

上一页 13 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001024 Chr02 NC_080388.1:18150162-18150176promoter 内 952-966 bp - 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 18153211-18157450(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G001143 Chr05 NC_080391.1:9547652-9547666promoter 内 944-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 9550709-9559534(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G001328 Chr05 NC_080391.1:11553867-11553881promoter 内 910-924 bp - 3077 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 11556958-11564678(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr06G000410 Chr06 NC_080392.1:3384711-3384725promoter 内 906-920 bp + 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3387806-3390540(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G000599 Chr02 NC_080388.1:8639357-8639371promoter 内 905-919 bp + 3082 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 8642453-8644900(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G002692 Chr05 NC_080391.1:30648227-30648241promoter 内 898-912 bp - 3089 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 30643519-30645138(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G002210 Chr08 NC_080394.1:20073051-20073065promoter 内 896-910 bp - 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 20076156-20079410(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr07G002071 Chr07 NC_080393.1:18853556-18853570promoter 内 885-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 18843047-18850454(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G004272 Chr02 NC_080388.1:64926025-64926039promoter 内 880-894 bp - 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 64921711-64922918(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr03G003795 Chr03 NC_080389.1:57047406-57047420promoter 内 854-868 bp + 3133 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 57043157-57044273(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr08G002400 Chr08 NC_080394.1:22793092-22793106promoter 内 853-867 bp - 3134 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22783831-22789958(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G001853 Chr08 NC_080394.1:15924926-15924940promoter 内 851-865 bp - 3136 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 15928076-15931215(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G002935 Chr01 NC_080387.1:48112306-48112320promoter 内 827-841 bp + 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 48106910-48109146(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G001419 Chr01 NC_080387.1:27771931-27771945promoter 内 826-840 bp + 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 27775106-27775179(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
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SmilChr08G000471 Chr08 NC_080394.1:3350763-3350777promoter 内 794-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 3353970-3354995(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
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SmilChr05G003993 Chr05 NC_080391.1:53770377-53770391promoter 内 745-759 bp + 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 53763692-53767135(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr08G002214 Chr08 NC_080394.1:20125473-20125487promoter 内 732-746 bp - 3255 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 20128742-20131032(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G000864 Chr05 NC_080391.1:6859873-6859887promoter 内 731-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 6851903-6856617(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
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SmilChr05G001140 Chr05 NC_080391.1:9534962-9534976promoter 内 714-728 bp - 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 9529481-9531689(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G001205 Chr02 NC_080388.1:22220061-22220075promoter 内 688-702 bp + 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22223374-22227993(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr07G003083 Chr07 NC_080393.1:32479220-32479234promoter 内 682-696 bp + 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 32482539-32484284(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G003329 Chr01 NC_080387.1:51984591-51984605promoter 内 679-693 bp - 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 51979530-51981283(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G005117 Chr01 NC_080387.1:68946156-68946170promoter 内 669-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 68949488-68952268(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
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SmilChr07G001969 Chr07 NC_080393.1:17240463-17240477promoter 内 625-639 bp + 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 17222280-17237101(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr06G000239 Chr06 NC_080392.1:1607143-1607157promoter 内 622-636 bp - 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 1601068-1603778(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G004009 Chr02 NC_080388.1:62409603-62409617promoter 内 609-623 bp - 3378 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 62412995-62417878(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr03G003816 Chr03 NC_080389.1:57196282-57196296promoter 内 604-618 bp - 3383 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 57181844-57192899(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
SmilChr08G001609 Chr08 NC_080394.1:13323092-13323106promoter 内 535-549 bp + 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 13319559-13319640(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G001740 Chr05 NC_080391.1:16827552-16827566promoter 内 524-538 bp + 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 16815950-16824089(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
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SmilChr04G000048 Chr04 NC_080390.1:436066-436080promoter 内 507-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 439560-443844(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G002067 Chr01 NC_080387.1:36527866-36527880promoter 内 504-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 36522430-36524383(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr01G002762 Chr01 NC_080387.1:46023988-46024002promoter 内 497-511 bp + 3490 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46027492-46030826(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTGTGGTAGGTGAA
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SmilChr07G002952 Chr07 NC_080393.1:29940139-29940153promoter 内 475-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 29928157-29936627(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
SmilChr05G002959 Chr05 NC_080391.1:35782735-35782749promoter 内 469-483 bp - 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35786267-35787433(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACACT
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