转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 134 / 149 下载 TSV

上一页 134 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000677 Chr06 NC_080392.1:5984640-5984650promoter 内 2972-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5985669-5986220(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGTG
SmilChr03G002704 Chr03 NC_080389.1:42984329-42984339promoter 内 2512-2522 bp - 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42985818-42986925(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGTG
SmilChr05G001722 Chr05 NC_080391.1:16486048-16486058promoter 内 2477-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16487572-16490204(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAG
SmilChr05G000499 Chr05 NC_080391.1:3898270-3898280promoter 内 2166-2176 bp - 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3900105-4820659(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAG
SmilChr07G002219 Chr07 NC_080393.1:20448013-20448023promoter 内 1911-1921 bp + 2080 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20445553-20445933(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGA
SmilChr01G002437 Chr01 NC_080387.1:41965442-41965452promoter 内 1884-1894 bp + 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41959720-41963335(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGTG
SmilChr02G002272 Chr02 NC_080388.1:40189120-40189130promoter 内 1416-1426 bp - 2575 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40185049-40186545(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTTAGCTGTCC
SmilChr03G001025 Chr03 NC_080389.1:11914572-11914582promoter 内 1234-1244 bp - 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 11910604-11911815(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCCGCTGTCA
SmilChr01G005139 Chr01 NC_080387.1:69191293-69191303promoter 内 1122-1132 bp + 2869 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 69171462-69188424(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAG
SmilChr07G002222 Chr07 NC_080393.1:20448013-20448023promoter 内 799-809 bp + 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 20451215-20451918(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCCGCTGTCA
SmilChr01G001768 Chr01 NC_080387.1:32510066-32510076promoter 内 746-756 bp - 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32513321-32516105(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATACAGCTGTG
SmilChr02G003072 Chr02 NC_080388.1:51564271-51564281promoter 内 708-718 bp - 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 51567564-51569717(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAG
SmilChr03G000169 Chr03 NC_080389.1:1861605-1861615promoter 内 707-717 bp - 3284 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 1864899-1867457(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGA
SmilChr06G002802 Chr06 NC_080392.1:40732190-40732200promoter 内 563-573 bp - 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40735628-40741086(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAG
SmilChr04G001539 Chr04 NC_080390.1:25352710-25352720promoter 内 506-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 25346518-25349225(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAT
SmilChr03G003204 Chr03 NC_080389.1:49588414-49588424promoter 内 141-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 49583985-49584564(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCGGGA
SmilChr03G002702 Chr03 NC_080389.1:42984329-42984339promoter 内 77-87 bp - 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42980343-42980415(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CACAGCTGTAT
SmilChr01G001465 Chr01 NC_080387.1:28455642-28455652promoter 内 552-562 bp + 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 28450022-28452203(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr02G002106 Chr02 NC_080388.1:37759867-37759877promoter 内 3885-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37759983-37770656(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr02G001285 Chr02 NC_080388.1:23681261-23681271promoter 内 3860-3870 bp + 131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 23679351-23681130(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr01G004050 Chr01 NC_080387.1:58957514-58957524promoter 内 2685-2695 bp + 1306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 58955005-58956208(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr07G003030 Chr07 NC_080393.1:31344517-31344527promoter 内 2166-2176 bp + 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 31346352-31352262(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCT
SmilChr02G001284 Chr02 NC_080388.1:23681261-23681271promoter 内 2061-2071 bp + 1930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 23677852-23679331(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr07G002931 Chr07 NC_080393.1:29667699-29667709promoter 内 1944-1954 bp - 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 29664468-29665652(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCT
SmilChr07G000385 Chr07 NC_080393.1:2583470-2583480promoter 内 1878-1888 bp - 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2585593-2586724(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr04G003109 Chr04 NC_080390.1:47641826-47641836promoter 内 1665-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47644162-47646786(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCT
SmilChr02G002886 Chr02 NC_080388.1:49158864-49158874promoter 内 1489-1499 bp - 2502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 49161376-49163067(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr02G002974 Chr02 NC_080388.1:50276809-50276819promoter 内 1470-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 50272572-50274288(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr05G003215 Chr05 NC_080391.1:41253505-41253515promoter 内 967-977 bp - 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 41256539-41257356(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr01G005785 Chr01 NC_080387.1:73946560-73946570promoter 内 933-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 73940626-73943502(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr04G000863 Chr04 NC_080390.1:10936876-10936886promoter 内 849-859 bp + 3142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10926879-10933734(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTAA
SmilChr06G000046 Chr06 NC_080392.1:380347-380357promoter 内 377-387 bp - 3614 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 374824-376733(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCT
SmilChr02G001286 Chr02 NC_080388.1:23681261-23681271promoter 内 38-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 23685224-23686315(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTAAGCTGTCT
SmilChr06G000869 Chr06 NC_080392.1:8231871-8231881promoter 内 2428-2438 bp - 1563 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 8230236-8230308(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCAGCTGTAG
SmilChr06G000871 Chr06 NC_080392.1:8231871-8231881promoter 内 1733-1743 bp - 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 8234139-8237204(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAT
SmilChr03G004078 Chr03 NC_080389.1:59715489-59715499promoter 内 1509-1519 bp - 2482 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 2 59712399-59713007(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCT
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SmilChr07G001736 Chr07 NC_080393.1:14751921-14751931promoter 内 3910-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 14752012-14752611(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAA
SmilChr07G001563 Chr07 NC_080393.1:12801993-12802003promoter 内 3794-3804 bp + 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 12802200-12803344(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCT
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SmilChr07G001562 Chr07 NC_080393.1:12792464-12792474promoter 内 3735-3745 bp + 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 12792730-12793785(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCT
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SmilChr01G004439 Chr01 NC_080387.1:62475467-62475477promoter 内 3666-3676 bp - 325 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 62475802-62476465(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAA
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SmilChr03G002210 Chr03 NC_080389.1:34857111-34857121promoter 内 3498-3508 bp - 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 34857614-34858137(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCAA
SmilChr04G003980 Chr04 NC_080390.1:55247092-55247102promoter 内 3451-3461 bp + 540 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 55247642-55254934(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTGAGCTGTCT
SmilChr02G000656 Chr02 NC_080388.1:9969873-9969883promoter 内 3419-3429 bp + 572 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 9968660-9969301(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAT
SmilChr03G002827 Chr03 NC_080389.1:44759613-44759623promoter 内 3314-3324 bp + 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.4/ 100 1 44751241-44758936(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAT