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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。

预计算阈值必须与当前索引一致。非法、未支持或需四舍五入的输入会报错；页面与下载均不会自动切换阈值。

257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 136 / 148 下载 TSV

上一页 136 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002973 Chr03 NC_080389.1:46527477-46527490promoter 内 2888-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 46524990-46526377(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr02G000712 Chr02 NC_080388.1:11481171-11481184promoter 内 2878-2891 bp - 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 11478624-11480061(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAAAAATCACGTGG
SmilChr03G003949 Chr03 NC_080389.1:58551220-58551233promoter 内 2779-2792 bp + 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 58552442-58553992(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGCCAACACGTGG
SmilChr06G000853 Chr06 NC_080392.1:8074693-8074706promoter 内 2729-2742 bp - 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8075965-8079046(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCGCTG
SmilChr03G004458 Chr03 NC_080389.1:62681695-62681708promoter 内 2722-2735 bp - 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 62675581-62680429(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr08G001664 Chr08 NC_080394.1:13863816-13863829promoter 内 2697-2710 bp + 1291 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 13865120-13868982(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACTAAACACGTGG
SmilChr05G001910 Chr05 NC_080391.1:19368602-19368615promoter 内 2687-2700 bp - 1301 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 19369916-19371708(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCGTAA
SmilChr01G002845 Chr01 NC_080387.1:47021372-47021385promoter 内 2685-2698 bp - 1303 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 47019019-47020069(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr02G003189 Chr02 NC_080388.1:53048953-53048966promoter 内 2677-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 53050277-53053110(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr03G001103 Chr03 NC_080389.1:12695000-12695013promoter 内 2640-2653 bp - 1348 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 12691818-12693652(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTTTGTCACGTGT
SmilChr07G003653 Chr07 NC_080393.1:43448207-43448220promoter 内 2630-2643 bp - 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 43449578-43450054(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATATATT
SmilChr02G001355 Chr02 NC_080388.1:25316447-25316460promoter 内 2597-2610 bp + 1391 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 25306259-25315056(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATATATT
SmilChr07G003271 Chr07 NC_080393.1:34479333-34479346promoter 内 2579-2592 bp - 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 34472958-34477924(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAATAACACGTGG
SmilChr04G003130 Chr04 NC_080390.1:47903997-47904010promoter 内 2567-2580 bp - 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 47902505-47902576(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGCGTTCACGTGC
SmilChr05G000754 Chr05 NC_080391.1:5830570-5830583promoter 内 2559-2572 bp - 1429 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 5832012-5842242(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGATGTACG
SmilChr02G002463 Chr02 NC_080388.1:42972109-42972122promoter 内 2549-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 42965984-42970670(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr04G001160 Chr04 NC_080390.1:17166202-17166215promoter 内 2544-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 17161589-17164758(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCATTTCACGTGA
SmilChr07G000368 Chr07 NC_080393.1:2519842-2519855promoter 内 2540-2553 bp - 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2517872-2518394(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATATGTTCACGTGC
SmilChr01G003557 Chr01 NC_080387.1:54192519-54192532promoter 内 2535-2548 bp + 1453 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 54188417-54191066(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTATTTA
SmilChr07G000370 Chr07 NC_080393.1:2519842-2519855promoter 内 2498-2511 bp - 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 2521345-2525958(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACATAT
SmilChr01G005339 Chr01 NC_080387.1:70622404-70622417promoter 内 2496-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 70623909-70625403(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACATAT
SmilChr02G005289 Chr02 NC_080388.1:73898997-73899010promoter 内 2479-2492 bp - 1509 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 73895707-73897488(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTACATCACGTGC
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SmilChr05G002345 Chr05 NC_080391.1:25430266-25430279promoter 内 2391-2404 bp + 1597 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 25431876-25433783(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr02G002185 Chr02 NC_080388.1:39064693-39064706promoter 内 2386-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 39059722-39063091(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGATTA
SmilChr07G001166 Chr07 NC_080393.1:8731643-8731656promoter 内 2384-2397 bp - 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8724721-8730039(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
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SmilChr03G004287 Chr03 NC_080389.1:61281617-61281630promoter 内 2379-2392 bp - 1609 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 61278212-61280008(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAATAGCACGTGG
SmilChr05G004331 Chr05 NC_080391.1:57009394-57009407promoter 内 2377-2390 bp + 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 57011018-57013672(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr04G000101 Chr04 NC_080390.1:913477-913490promoter 内 2375-2388 bp + 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 911003-911864(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTATT
SmilChr03G001501 Chr03 NC_080389.1:18357472-18357485promoter 内 2306-2319 bp + 1682 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 18355401-18355790(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGAATATCC
SmilChr03G004459 Chr03 NC_080389.1:62681695-62681708promoter 内 2292-2305 bp - 1696 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 62679200-62679999(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr03G002748 Chr03 NC_080389.1:43670267-43670280promoter 内 2263-2276 bp + 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 43672005-43674888(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr08G001693 Chr08 NC_080394.1:14177151-14177164promoter 内 2249-2262 bp + 1739 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 14178903-14179933(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr04G003985 Chr04 NC_080390.1:55289050-55289063promoter 内 2198-2211 bp + 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 55285365-55287260(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAAACTAA
SmilChr02G003831 Chr02 NC_080388.1:59951350-59951363promoter 内 2151-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 59953200-59954266(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
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SmilChr05G001088 Chr05 NC_080391.1:9066025-9066038promoter 内 2024-2037 bp - 1964 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 9062438-9064061(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTAAAATCACGTGA
SmilChr07G001177 Chr07 NC_080393.1:8902101-8902114promoter 内 1938-1951 bp - 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 8899949-8900051(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr02G001094 Chr02 NC_080388.1:19739776-19739789promoter 内 1906-1919 bp + 2082 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 19735577-19737694(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTCAACG
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SmilChr07G003639 Chr07 NC_080393.1:43103262-43103275promoter 内 1824-1837 bp - 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 43105439-43106584(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAATGACT
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SmilChr01G001886 Chr01 NC_080387.1:33965784-33965797promoter 内 1464-1477 bp - 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 33959204-33963260(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG
SmilChr01G005052 Chr01 NC_080387.1:68467388-68467401promoter 内 1454-1467 bp + 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.5/ 100 1 68469935-68470707(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACCTGCACGTGG