转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004408; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011278-RA_Salv SmilChr08G004408 MYB XP_057780613.1 MP00114 AAGTTGGTAGGTGAG

可能结合的靶基因

9897 个结合位点 8151 个候选靶基因 第 18 / 164 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003856 Chr07 NC_080393.1:47869647-47869661promoter 内 2096-2110 bp - 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 47871552-47921074(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCTCCCA
SmilChr05G002547 Chr05 NC_080391.1:28520631-28520645promoter 内 1604-1618 bp + 2383 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 28515688-28518248(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACAAT
SmilChr08G001172 Chr08 NC_080394.1:9371787-9371801promoter 内 1503-1517 bp + 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 9374285-9376736(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AATTTGGTAGGTGAA
SmilChr08G000064 Chr08 NC_080394.1:373621-373635promoter 内 891-905 bp - 3096 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 368394-370525(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGCGTGGTAGGTGAA
SmilChr01G004414 Chr01 NC_080387.1:62273079-62273093promoter 内 826-840 bp + 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 62267610-62269918(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACAAT
SmilChr05G002559 Chr05 NC_080391.1:28715351-28715365promoter 内 723-737 bp + 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 28718629-28719871(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G002572 Chr02 NC_080388.1:44725854-44725868promoter 内 720-734 bp - 3267 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 44729135-44729890(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCTCTTT
SmilChr03G004571 Chr03 NC_080389.1:63615133-63615147promoter 内 699-713 bp - 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 63618435-63621305(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCACATT
SmilChr04G003993 Chr04 NC_080390.1:55319052-55319066promoter 内 485-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 55322568-55324194(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCACGGC
SmilChr05G002558 Chr05 NC_080391.1:28715351-28715365promoter 内 421-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 28709105-28711785(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCACAAT
SmilChr02G000255 Chr02 NC_080388.1:3292455-3292469promoter 内 360-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 3285444-3288828(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACAGTGGTAGGTGGA
SmilChr02G005136 Chr02 NC_080388.1:72801968-72801982promoter 内 314-328 bp - 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 72795106-72798295(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATTGTGGTAGGTGAA
SmilChr07G003837 Chr07 NC_080393.1:47471899-47471913promoter 内 3218-3232 bp - 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 47469770-47471130(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAAGGGTAGGTGGG
SmilChr06G002488 Chr06 NC_080392.1:35765527-35765541promoter 内 3604-3618 bp - 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 35765924-35770133(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCCTTTT
SmilChr06G002493 Chr06 NC_080392.1:35816898-35816912promoter 内 3602-3616 bp - 385 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 35817297-35821493(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCCTTTT
SmilChr02G004840 Chr02 NC_080388.1:70534638-70534652promoter 内 3319-3333 bp + 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 70524776-70533970(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCAAACA
SmilChr04G001966 Chr04 NC_080390.1:31886560-31886574promoter 内 2371-2385 bp + 1616 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 31888190-31890819(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATAGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G002417 Chr02 NC_080388.1:42172398-42172412promoter 内 2284-2298 bp + 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 42158821-42170695(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCCACTT
SmilChr02G003998 Chr02 NC_080388.1:62312103-62312117promoter 内 1338-1352 bp + 2649 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 2 62303822-62309454(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCCTTTT
SmilChr02G002820 Chr02 NC_080388.1:48291753-48291767promoter 内 3973-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 48291014-48291739(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAATGGTAGGTGGA
SmilChr04G003395 Chr04 NC_080390.1:50499461-50499475promoter 内 3943-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 50492490-50499417(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TGGATGGTAGGTGTG
SmilChr04G002787 Chr04 NC_080390.1:43730601-43730615promoter 内 3579-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 43725659-43730193(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCAATGG
SmilChr08G002633 Chr08 NC_080394.1:25739500-25739514promoter 内 3455-3469 bp + 532 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 25732874-25738968(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCCACCAACTT
SmilChr02G001704 Chr02 NC_080388.1:31341995-31342009promoter 内 3037-3051 bp - 950 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 31342959-31346201(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCTACCTACCCCCCA
SmilChr08G000498 Chr08 NC_080394.1:3644315-3644329promoter 内 2794-2808 bp + 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 3641259-3643122(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCTATAT
SmilChr08G000367 Chr08 NC_080394.1:2527318-2527332promoter 内 2707-2721 bp + 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 2528612-2530158(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAATGGTAGGTGGA
SmilChr04G003396 Chr04 NC_080390.1:50499461-50499475promoter 内 2466-2480 bp - 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 50500996-50502099(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CACACCTACCATCCA
SmilChr03G000917 Chr03 NC_080389.1:10480468-10480482promoter 内 1947-1961 bp + 2040 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 10482522-10483574(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ATCTTGGTAGGTGGA
SmilChr08G000846 Chr08 NC_080394.1:6278303-6278317promoter 内 1893-1907 bp + 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 6280411-6283130(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTTATGGTAGGTGAG
SmilChr03G002707 Chr03 NC_080389.1:43045613-43045627promoter 内 1795-1809 bp + 2192 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 43042381-43043421(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CTCACCTACCTCTTA
SmilChr04G001918 Chr04 NC_080390.1:31285842-31285856promoter 内 1516-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 31275684-31283371(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GTGGAGGTAGGTGTG
SmilChr01G001091 Chr01 NC_080387.1:22360923-22360937promoter 内 1503-1517 bp + 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 22363421-22371155(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACGAGGTAGGTGAG
SmilChr01G001016 Chr01 NC_080387.1:21332409-21332423promoter 内 1434-1448 bp - 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 21322126-21329856(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AACGAGGTAGGTGAG
SmilChr05G003928 Chr05 NC_080391.1:53033722-53033736promoter 内 1357-1371 bp + 2630 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 53030224-53031092(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCTCCCA
SmilChr03G002709 Chr03 NC_080389.1:43045613-43045627promoter 内 1171-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 43048443-43049618(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TAAGAGGTAGGTGAG
SmilChr03G004323 Chr03 NC_080389.1:61595941-61595955promoter 内 747-761 bp + 3240 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 61599195-61606312(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 ACGTGGGTAGGTGGA
SmilChr07G002794 Chr07 NC_080393.1:27848034-27848048promoter 内 518-532 bp + 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 27840381-27844565(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCCACTT
SmilChr03G001145 Chr03 NC_080389.1:13199880-13199894promoter 内 353-367 bp - 3634 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 13203528-13208130(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCTTCAA
SmilChr06G002688 Chr06 NC_080392.1:38808095-38808109promoter 内 256-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 38811840-38813276(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAAATGGTAGGTGGA
SmilChr02G002419 Chr02 NC_080388.1:42172398-42172412promoter 内 248-262 bp + 3739 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 42176151-42180320(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAGTGGGTAGGTGAA
SmilChr01G000932 Chr01 NC_080387.1:19758123-19758137promoter 内 119-133 bp - 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 19762005-19765392(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCTACCTACCACCAC
SmilChr03G004458 Chr03 NC_080389.1:62680983-62680997promoter 内 3433-3447 bp + 554 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 4 62675581-62680429(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCAAACC
SmilChr03G004459 Chr03 NC_080389.1:62680983-62680997promoter 内 3003-3017 bp + 984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 4 62679200-62679999(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 GCCACCTACCAAACC
SmilChr02G001110 Chr02 NC_080388.1:19980740-19980754promoter 内 3229-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 3 19976745-19979982(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACTACCTA
SmilChr02G001849 Chr02 NC_080388.1:33709850-33709864promoter 内 3593-3607 bp + 394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 33710258-33717314(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AGTATGGTAGGTGAA
SmilChr06G002435 Chr06 NC_080392.1:35094440-35094454promoter 内 2766-2780 bp - 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 35095675-35095834(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TCCACCTACCAATGT
SmilChr02G005194 Chr02 NC_080388.1:73210647-73210661promoter 内 2507-2521 bp - 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 73208114-73209167(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 AAATAGGTAGGTGGA
SmilChr05G000079 Chr05 NC_080391.1:407030-407044promoter 内 1959-1973 bp + 2028 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 403881-405002(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 CCCACCTACCATTGA
SmilChr05G003695 Chr05 NC_080391.1:50067245-50067259promoter 内 560-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 50061296-50063818(-) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT
SmilChr07G003311 Chr07 NC_080393.1:35142781-35142795promoter 内 337-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 2 35146445-35153528(+) SMil_00011278-RA_Salv MP00114 TTCACCTACCATACT