转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007215-RA_Salv SmilChr01G003955 WRKY XP_057779712.1 MP00450 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 19 / 161 下载 TSV

上一页 19 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001200 Chr01 NC_080387.1:24170069-24170082promoter 内 3523-3536 bp + 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 24160292-24169604(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGAAAGTCAACCAT
SmilChr03G000828 Chr03 NC_080389.1:9507166-9507179promoter 内 3359-3372 bp + 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 9481327-9506537(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TATAAGTCAACGCT
SmilChr07G002775 Chr07 NC_080393.1:27623841-27623854promoter 内 3064-3077 bp + 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 27618695-27622917(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAACCTT
SmilChr03G003734 Chr03 NC_080389.1:56372133-56372146promoter 内 2986-2999 bp - 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 56370270-56371131(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CTAGTTGACTTTGT
SmilChr05G002608 Chr05 NC_080391.1:29324018-29324031promoter 内 2888-2901 bp - 1100 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 29325131-29327694(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAAGAC
SmilChr02G004228 Chr02 NC_080388.1:64491231-64491244promoter 内 2572-2585 bp - 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 64489743-64489815(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGTGTTGACTTTTT
SmilChr04G003488 Chr04 NC_080390.1:51327705-51327718promoter 内 1489-1502 bp + 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 51330217-51341610(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GACGTTGACTTCTA
SmilChr03G004123 Chr03 NC_080389.1:60089386-60089399promoter 内 802-815 bp - 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 60084723-60086200(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGGTTGACTTTTA
SmilChr04G001144 Chr04 NC_080390.1:16857560-16857573promoter 内 596-609 bp + 3392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 16860965-16865244(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGAGTTGACTTTAT
SmilChr05G003676 Chr05 NC_080391.1:49749891-49749904promoter 内 3787-3800 bp - 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 49750105-49750792(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAAGAC
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73488821-73488834promoter 内 3597-3610 bp + 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73489225-73490124(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCCGTTGACTTCTC
SmilChr06G002611 Chr06 NC_080392.1:37545820-37545833promoter 内 3568-3581 bp + 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 37546253-37547565(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTCTTTGACTTTTG
SmilChr03G004127 Chr03 NC_080389.1:60101000-60101013promoter 内 2817-2830 bp + 1171 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 60102184-60105719(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGGTTGACTTTTA
SmilChr04G001228 Chr04 NC_080390.1:19289146-19289159promoter 内 2661-2674 bp + 1327 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 19290486-19296661(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTCTTTGACTTTTG
SmilChr04G003480 Chr04 NC_080390.1:51252962-51252975promoter 内 2468-2481 bp - 1520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51247623-51251442(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCGGTTGACTTTCG
SmilChr05G000464 Chr05 NC_080391.1:3513435-3513448promoter 内 2434-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3509127-3511881(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGAAAGTCAACTAC
SmilChr02G001365 Chr02 NC_080388.1:25721583-25721596promoter 内 2384-2397 bp + 1604 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 25723200-25723790(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGCTTTGACTTTGT
SmilChr05G000648 Chr05 NC_080391.1:4901343-4901356promoter 内 2242-2255 bp + 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4903102-4904866(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAGTTGACTTTTA
SmilChr03G002355 Chr03 NC_080389.1:37179338-37179351promoter 内 2168-2181 bp - 1820 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 37173624-37177518(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACCTTTGACTTTTT
SmilChr07G002217 Chr07 NC_080393.1:20409175-20409188promoter 内 2078-2091 bp - 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 20411098-20417709(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAACTTT
SmilChr01G001834 Chr01 NC_080387.1:33278774-33278787promoter 内 1597-1610 bp + 2391 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33281178-33283356(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGTGTTGACTTTTT
SmilChr02G004227 Chr02 NC_080388.1:64491231-64491244promoter 内 1455-1468 bp - 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 64488626-64488698(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGTGTTGACTTTTT
SmilChr05G001159 Chr05 NC_080391.1:9731552-9731565promoter 内 1403-1416 bp - 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9734150-9735607(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTAAAGTCAACGTG
SmilChr01G005738 Chr01 NC_080387.1:73504289-73504302promoter 内 1063-1076 bp + 2925 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73507227-73507982(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCCGTTGACTTCTC
SmilChr07G003064 Chr07 NC_080393.1:32137190-32137203promoter 内 827-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 32140364-32148729(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAAGGT
SmilChr01G001831 Chr01 NC_080387.1:33278774-33278787promoter 内 419-432 bp + 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 33268420-33275205(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAACACA
SmilChr07G002739 Chr07 NC_080393.1:26899903-26899916promoter 内 397-410 bp + 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26895394-26896312(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAACTCG
SmilChr01G003155 Chr01 NC_080387.1:50334699-50334712promoter 内 130-143 bp + 3858 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 50338570-50344717(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACCTTTGACTTTTT
SmilChr07G003652 Chr07 NC_080393.1:43439721-43439734promoter 内 2400-2413 bp + 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 43441322-43442038(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGGGTTGACTTTAG
SmilChr05G003980 Chr05 NC_080391.1:53583288-53583301promoter 内 2330-2343 bp + 1658 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 53580388-53581630(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACAAAGTCAACTTT
SmilChr07G002046 Chr07 NC_080393.1:18576175-18576188promoter 内 3878-3891 bp + 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 18573459-18576065(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAAGGT
SmilChr01G002194 Chr01 NC_080387.1:38105866-38105879promoter 内 3862-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 38103707-38105740(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGGTTGACTTTGT
SmilChr04G002937 Chr04 NC_080390.1:45600171-45600184promoter 内 3792-3805 bp + 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 45600380-45602789(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GACGTTGACTTATG
SmilChr03G001407 Chr03 NC_080389.1:16670358-16670371promoter 内 3738-3751 bp - 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 16670621-16674981(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAAAGCT
SmilChr01G002694 Chr01 NC_080387.1:45195190-45195203promoter 内 2734-2747 bp + 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 45196457-45199085(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGTGTTGACTTTTG
SmilChr04G002936 Chr04 NC_080390.1:45600171-45600184promoter 内 2660-2673 bp + 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 45597702-45598843(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CATAAGTCAACGTC
SmilChr02G001811 Chr02 NC_080388.1:32932238-32932251promoter 内 2473-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 32925959-32930723(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGTGTTGACTTTTG
SmilChr05G001105 Chr05 NC_080391.1:9179906-9179919promoter 内 2442-2455 bp + 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 9177029-9178360(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAGGTCAACGAT
SmilChr01G004931 Chr01 NC_080387.1:67364897-67364910promoter 内 2246-2259 bp + 1742 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 67366652-67368209(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAGTTGACTTTGT
SmilChr05G001376 Chr05 NC_080391.1:12275323-12275336promoter 内 2092-2105 bp - 1896 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 12277232-12280200(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACAAAGTCAACTTT
SmilChr05G002641 Chr05 NC_080391.1:29824182-29824195promoter 内 1880-1893 bp - 2108 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 29819624-29822074(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGGTTGACTTTGT
SmilChr07G001830 Chr07 NC_080393.1:15781572-15781585promoter 内 1275-1288 bp - 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 15784298-15792016(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CCAAAGTCAACACC
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SmilChr06G001745 Chr06 NC_080392.1:20202659-20202672promoter 内 3317-3330 bp - 671 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 20203343-20209404(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATAGTCAACGGC
SmilChr01G002520 Chr01 NC_080387.1:43155145-43155158promoter 内 3216-3229 bp - 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 43155930-43159761(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAACCAA
SmilChr04G002592 Chr04 NC_080390.1:41333905-41333918promoter 内 3214-3227 bp + 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 41334692-41339669(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTCGTTGACTTATC
SmilChr03G001341 Chr03 NC_080389.1:15654897-15654910promoter 内 3116-3129 bp + 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 15649684-15654025(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAAAGCT
SmilChr02G000053 Chr02 NC_080388.1:707872-707885promoter 内 3056-3069 bp + 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 700214-706940(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACAAAGTCAACTTT
SmilChr01G002513 Chr01 NC_080387.1:43053308-43053321promoter 内 2937-2950 bp + 1051 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 1 43054372-43064125(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGCGTTGACTTCCC