转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 2 / 136 下载 TSV

上一页 2 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003078 Chr07 NC_080393.1:32416152-32416162promoter 内 3040-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 32417113-32418853(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGC
SmilChr01G004939 Chr01 NC_080387.1:67500401-67500411promoter 内 666-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 2 67503736-67512271(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGC
SmilChr03G004725 Chr03 NC_080389.1:64445010-64445020promoter 内 3135-3145 bp + 856 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.9/ 100 1 64445876-64448146(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGCG
SmilChr07G003881 Chr07 NC_080393.1:48442127-48442137promoter 内 3133-3143 bp + 858 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 6 48440398-48441269(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr08G000211 Chr08 NC_080394.1:1435429-1435439promoter 内 629-639 bp - 3362 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 1438801-1438881(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr02G001759 Chr02 NC_080388.1:32343913-32343923promoter 内 3837-3847 bp + 154 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 32344077-32354199(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr02G005466 Chr02 NC_080388.1:74947971-74947981promoter 内 2410-2420 bp + 1581 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 74949562-74959898(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr02G003037 Chr02 NC_080388.1:51077463-51077473promoter 内 2195-2205 bp - 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 51079269-51080318(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr01G000789 Chr01 NC_080387.1:17179311-17179321promoter 内 1724-1734 bp - 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 17175442-17177044(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr01G000790 Chr01 NC_080387.1:17176375-17176385promoter 内 1685-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 17178691-17181537(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr07G003880 Chr07 NC_080393.1:48442127-48442137promoter 内 363-373 bp + 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 48435729-48438499(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr03G000744 Chr03 NC_080389.1:8483255-8483265promoter 内 3558-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 8480356-8482822(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr08G000140 Chr08 NC_080394.1:892287-892297promoter 内 2687-2697 bp + 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 893601-907715(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr04G004015 Chr04 NC_080390.1:55431725-55431735promoter 内 2523-2533 bp + 1468 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 55430097-55430257(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr03G002269 Chr03 NC_080389.1:35822692-35822702promoter 内 2516-2526 bp - 1475 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 35819285-35821217(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr03G003869 Chr03 NC_080389.1:57802280-57802290promoter 内 2327-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 57798026-57800616(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr04G004017 Chr04 NC_080390.1:55431725-55431735promoter 内 1460-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 55434266-55434417(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr01G001106 Chr01 NC_080387.1:22652649-22652659promoter 内 1401-1411 bp + 2590 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 22647103-22650059(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr03G003691 Chr03 NC_080389.1:55849170-55849180promoter 内 831-841 bp - 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 55852340-55858688(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr04G004014 Chr04 NC_080390.1:55431725-55431735promoter 内 734-744 bp + 3257 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 55426993-55428468(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGCT
SmilChr04G004019 Chr04 NC_080390.1:55431725-55431735promoter 内 686-696 bp + 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 55435040-55437416(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr05G000493 Chr05 NC_080391.1:3847689-3847699promoter 内 488-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 3851202-3851645(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGCG
SmilChr07G000291 Chr07 NC_080393.1:1881936-1881946promoter 内 2020-2030 bp + 1971 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 4 1883917-1884622(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCC
SmilChr04G003395 Chr04 NC_080390.1:50501115-50501125promoter 内 2293-2303 bp - 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 50492490-50499417(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCC
SmilChr03G000754 Chr03 NC_080389.1:8629352-8629362promoter 内 220-230 bp + 3771 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 2 8622387-8625581(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCG
SmilChr07G004246 Chr07 NC_080393.1:54901645-54901655promoter 内 2900-2910 bp + 1091 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 54896553-54900554(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCG
SmilChr03G002364 Chr03 NC_080389.1:37276857-37276867promoter 内 2888-2898 bp + 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 37274302-37275754(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCG
SmilChr01G005591 Chr01 NC_080387.1:72565787-72565797promoter 内 2711-2721 bp + 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 72563606-72564507(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCG
SmilChr01G000728 Chr01 NC_080387.1:16193083-16193093promoter 内 1340-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 16188523-16190432(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCC
SmilChr05G004285 Chr05 NC_080391.1:56644840-56644850promoter 内 1150-1160 bp - 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 56638403-56641999(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCC
SmilChr08G004017 Chr08 NC_080394.1:48586192-48586202promoter 内 1143-1153 bp - 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 48576747-48583344(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGGG
SmilChr03G000755 Chr03 NC_080389.1:8635320-8635330promoter 内 646-656 bp + 3345 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 8638675-8640067(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCC
SmilChr01G005592 Chr01 NC_080387.1:72565787-72565797promoter 内 580-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 72569208-72572399(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCC
SmilChr07G001671 Chr07 NC_080393.1:14177481-14177491promoter 内 557-567 bp - 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 14180925-14186035(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCG
SmilChr01G005590 Chr01 NC_080387.1:72565787-72565797promoter 内 508-518 bp + 3483 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 72558686-72562304(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGCG
SmilChr07G000068 Chr07 NC_080393.1:319653-319663promoter 内 321-331 bp + 3670 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.6/ 100 1 312051-315983(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCG
SmilChr04G002519 Chr04 NC_080390.1:40226542-40226552promoter 内 2573-2583 bp + 1418 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 40223644-40225124(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGG
SmilChr08G004916 Chr08 NC_080394.1:58108081-58108091promoter 内 2341-2351 bp - 1650 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 58109741-58112122(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGG
SmilChr04G002892 Chr04 NC_080390.1:45141827-45141837promoter 内 1200-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 45137951-45139036(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCG
SmilChr06G002920 Chr06 NC_080392.1:42074272-42074282promoter 内 941-951 bp + 3050 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 2 42068908-42071222(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGG
SmilChr01G004387 Chr01 NC_080387.1:62043717-62043727promoter 内 3603-3613 bp - 388 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 62044115-62047497(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGG
SmilChr01G003581 Chr01 NC_080387.1:54379771-54379781promoter 内 2892-2902 bp - 1099 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 54376761-54378672(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCG
SmilChr08G000533 Chr08 NC_080394.1:3882210-3882220promoter 内 2743-2753 bp + 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 3883468-3883541(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCG
SmilChr04G002261 Chr04 NC_080390.1:36579377-36579387promoter 内 2458-2468 bp - 1533 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 36576393-36577844(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCG
SmilChr01G003453 Chr01 NC_080387.1:53103745-53103755promoter 内 852-862 bp - 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 53106894-53106967(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGG
SmilChr05G001147 Chr05 NC_080391.1:9607981-9607991promoter 内 670-680 bp - 3321 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 9600850-9604660(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCG
SmilChr07G002888 Chr07 NC_080393.1:29169660-29169670promoter 内 548-558 bp - 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 29162196-29166217(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGCG
SmilChr05G003568 Chr05 NC_080391.1:47639719-47639729promoter 内 261-271 bp + 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.5/ 100 1 47634452-47635989(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGG
SmilChr01G003176 Chr01 NC_080387.1:50562090-50562100promoter 内 421-431 bp + 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 3 50558092-50558520(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGC
SmilChr03G001969 Chr03 NC_080389.1:28369257-28369267promoter 内 3929-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.0/ 100 2 28369329-28369772(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCC