Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003805; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020790-RA_Salv SmilChr04G003805 MIKC_MADS XP_057805691.1 MP00315 TTTCCAAAAAAGGAAAAAA

可能结合的靶基因

9567 个结合位点 7291 个候选靶基因 第 21 / 146 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004614 Chr03 NC_080389.1:63856313-63856331promoter 内 2392-2410 bp - 1591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 63851854-63854722(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr05G000850 Chr05 NC_080391.1:6708358-6708376promoter 内 2143-2161 bp - 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 6697779-6706518(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G002474 Chr01 NC_080387.1:42482397-42482415promoter 内 1952-1970 bp + 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 42484446-42486418(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr06G000020 Chr06 NC_080392.1:256448-256466promoter 内 1429-1447 bp + 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 259020-259612(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr02G003811 Chr02 NC_080388.1:59739278-59739296promoter 内 781-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 59735596-59736076(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGTTTCCTTTTTTGGCTA
SmilChr02G005050 Chr02 NC_080388.1:72224335-72224353promoter 内 777-795 bp + 3206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 72227559-72227661(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr02G005051 Chr02 NC_080388.1:72224335-72224353promoter 内 635-653 bp + 3348 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 72227701-72227787(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr05G000851 Chr05 NC_080391.1:6708358-6708376promoter 内 470-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 6711889-6720735(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr01G005534 Chr01 NC_080387.1:72177853-72177871promoter 内 3816-3834 bp + 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 72178038-72180187(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr06G002086 Chr06 NC_080392.1:27519434-27519452promoter 内 3782-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 27519653-27525872(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G004975 Chr01 NC_080387.1:67826078-67826096promoter 内 3768-3786 bp - 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 67826311-67826811(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr07G002054 Chr07 NC_080393.1:18651350-18651368promoter 内 3694-3712 bp - 289 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 18647059-18651061(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr02G004425 Chr02 NC_080388.1:66585903-66585921promoter 内 3684-3702 bp + 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 66586220-66589870(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr04G003674 Chr04 NC_080390.1:53202094-53202112promoter 内 3678-3696 bp + 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 53200836-53201789(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr07G003409 Chr07 NC_080393.1:37123958-37123976promoter 内 3592-3610 bp + 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 37121888-37123567(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr02G001707 Chr02 NC_080388.1:31394274-31394292promoter 内 3580-3598 bp + 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 31389619-31393871(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr05G004241 Chr05 NC_080391.1:56227217-56227235promoter 内 3555-3573 bp + 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56227663-56233013(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr02G002892 Chr02 NC_080388.1:49211015-49211033promoter 内 3547-3565 bp - 436 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 49211469-49213739(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr08G001872 Chr08 NC_080394.1:16209803-16209821promoter 内 3332-3350 bp - 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 16210472-16211627(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr08G004432 Chr08 NC_080394.1:54022121-54022139promoter 内 3311-3329 bp + 672 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 54014391-54021449(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATGTTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr05G004280 Chr05 NC_080391.1:56600159-56600177promoter 内 3248-3266 bp + 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56600912-56605655(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr06G002013 Chr06 NC_080392.1:25838985-25839003promoter 内 3063-3081 bp - 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 25836285-25838065(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr05G003574 Chr05 NC_080391.1:47738810-47738828promoter 内 2919-2937 bp + 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 47739892-47740701(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G002309 Chr01 NC_080387.1:40065006-40065024promoter 内 2840-2858 bp + 1143 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 40066167-40066763(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr01G002629 Chr01 NC_080387.1:44594017-44594035promoter 内 2792-2810 bp - 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 44595226-44600028(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr02G002159 Chr02 NC_080388.1:38820916-38820934promoter 内 2669-2687 bp + 1314 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 38816497-38819602(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 CCTTTTCCTTTTTGGGTAA
SmilChr05G002489 Chr05 NC_080391.1:27557458-27557476promoter 内 2585-2603 bp - 1398 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 27553040-27556060(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAAAAGAAAGGA
SmilChr02G001548 Chr02 NC_080388.1:28773631-28773649promoter 内 2539-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 28775093-28778230(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATGTTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr04G002993 Chr04 NC_080390.1:46347114-46347132promoter 内 2411-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 46348704-46355265(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 GTATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr02G002330 Chr02 NC_080388.1:41000492-41000510promoter 内 2314-2332 bp - 1669 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 41002179-41007005(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr03G000580 Chr03 NC_080389.1:6433276-6433294promoter 内 2058-2076 bp - 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 6435219-6437864(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr01G002286 Chr01 NC_080387.1:39669618-39669636promoter 内 2014-2032 bp + 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 39664252-39667649(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATGTTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr03G004447 Chr03 NC_080389.1:62607678-62607696promoter 内 1968-1986 bp - 2015 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 62609711-62615303(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr02G002078 Chr02 NC_080388.1:37366951-37366969promoter 内 1876-1894 bp - 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 37361705-37364844(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCATAAAGGGAAAAAT
SmilChr06G003165 Chr06 NC_080392.1:44603758-44603776promoter 内 1858-1876 bp + 2125 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 44605901-44613237(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr02G002077 Chr02 NC_080388.1:37358785-37358803promoter 内 1633-1651 bp + 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 37352739-37356435(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr06G001321 Chr06 NC_080392.1:13732818-13732836promoter 内 1521-1539 bp + 2462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 13729617-13730356(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr01G004023 Chr01 NC_080387.1:58643496-58643514promoter 内 1475-1493 bp - 2508 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 58638171-58640988(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTTCCAAAATTGGAAAGTT
SmilChr03G003516 Chr03 NC_080389.1:53753077-53753095promoter 内 1432-1450 bp + 2551 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 53755646-53756038(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr07G003588 Chr07 NC_080393.1:41886947-41886965promoter 内 1250-1268 bp + 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 41889698-41895367(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr02G001684 Chr02 NC_080388.1:31076023-31076041promoter 内 1034-1052 bp - 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 31070324-31073074(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATTCCAAAAATGGAAACTA
SmilChr02G002381 Chr02 NC_080388.1:41715328-41715346promoter 内 984-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 41718345-41719333(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr08G002624 Chr08 NC_080394.1:25611116-25611134promoter 内 897-915 bp - 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 25614220-25617207(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATATTTCCCTTTTTGGTAA
SmilChr04G002462 Chr04 NC_080390.1:39448755-39448773promoter 内 831-849 bp - 3152 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 39443057-39445603(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr03G003503 Chr03 NC_080389.1:53642345-53642363promoter 内 742-760 bp - 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 53645604-53647041(+) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr06G000018 Chr06 NC_080392.1:256448-256466promoter 内 734-752 bp + 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 250254-253199(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 ATGTTTCTATTTTTGGTAA
SmilChr03G000891 Chr03 NC_080389.1:10175672-10175690promoter 内 609-627 bp + 3374 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 10171108-10172298(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TCATTTCCTTTTTTGGCAA
SmilChr04G000172 Chr04 NC_080390.1:1545095-1545113promoter 内 464-482 bp - 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 1539963-1541576(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTACCAAAAATAGAAACAT
SmilChr06G002012 Chr06 NC_080392.1:25838985-25839003promoter 内 336-354 bp - 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 25833595-25835338(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 TTGCCAAAAAAGGAAATGA
SmilChr01G003841 Chr01 NC_080387.1:56752044-56752062promoter 内 175-193 bp + 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 56746216-56748236(-) SMil_00020790-RA_Salv MP00315 GTTTTTCCATTTTTGGATA