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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001365; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010780-RA_Salv SmilChr06G001365 SBP XP_057768799.1 MP00307 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9755 个结合位点 6893 个候选靶基因 第 21 / 138 下载 TSV

上一页 21 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005159 Chr01 NC_080387.1:69352053-69352063promoter 内 1294-1304 bp + 2697 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 69354760-69355445(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GATGTACGGTT
SmilChr01G001530 Chr01 NC_080387.1:29295241-29295251promoter 内 1123-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 29290857-29292373(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr03G000573 Chr03 NC_080389.1:6236370-6236380promoter 内 950-960 bp + 3041 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 6232208-6233329(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G005079 Chr01 NC_080387.1:68673003-68673013promoter 内 946-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 68666714-68669958(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TATGTACGGAC
SmilChr02G000331 Chr02 NC_080388.1:4212442-4212452promoter 内 866-876 bp - 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 4207634-4209317(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGCGTACGGAT
SmilChr02G005323 Chr02 NC_080388.1:74116197-74116207promoter 内 834-844 bp - 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 74110219-74113040(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTGGTACGGAT
SmilChr02G002195 Chr02 NC_080388.1:39165912-39165922promoter 内 830-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 39161798-39162751(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTGGTACGGAT
SmilChr03G000744 Chr03 NC_080389.1:8486050-8486060promoter 内 763-773 bp - 3228 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 8480356-8482822(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr02G003576 Chr02 NC_080388.1:56933457-56933467promoter 内 732-742 bp + 3259 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 56936726-56938115(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGTAC
SmilChr02G005551 Chr02 NC_080388.1:75486614-75486624promoter 内 663-673 bp + 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 75489952-75493024(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGGCG
SmilChr01G004687 Chr01 NC_080387.1:64933965-64933975promoter 内 654-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 64930269-64930628(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACAGC
SmilChr02G002215 Chr02 NC_080388.1:39387116-39387126promoter 内 602-612 bp + 3389 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 39381185-39383727(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G002343 Chr01 NC_080387.1:40574061-40574071promoter 内 590-600 bp + 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 40577472-40582546(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGGCG
SmilChr01G002083 Chr01 NC_080387.1:36778592-36778602promoter 内 569-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 36770893-36775170(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGCCGTACATT
SmilChr03G002188 Chr03 NC_080389.1:34177415-34177425promoter 内 518-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 34180898-34182773(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
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SmilChr02G004535 Chr02 NC_080388.1:67905803-67905813promoter 内 185-195 bp + 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 67909619-67911240(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTGGTACGGAT
SmilChr01G004686 Chr01 NC_080387.1:64933965-64933975promoter 内 50-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 64926181-64930024(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACAGC
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SmilChr02G004010 Chr02 NC_080388.1:62420754-62420764promoter 内 1938-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 5 62422817-62427184(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGTTC
SmilChr01G004472 Chr01 NC_080387.1:62821607-62821617promoter 内 3768-3778 bp - 223 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 62821840-62825865(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TGCCGTACAAT
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SmilChr01G004326 Chr01 NC_080387.1:61416318-61416328promoter 内 2631-2641 bp - 1360 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 61412236-61414958(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGGTA
SmilChr01G004327 Chr01 NC_080387.1:61416430-61416440promoter 内 2045-2055 bp + 1946 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 61418386-61421464(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGGTA
SmilChr02G004396 Chr02 NC_080388.1:66298704-66298714promoter 内 898-908 bp - 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 4 66301807-66304825(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAC
SmilChr01G000425 Chr01 NC_080387.1:8522883-8522893promoter 内 3418-3428 bp + 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 8514196-8522310(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAC
SmilChr03G002747 Chr03 NC_080389.1:43664191-43664201promoter 内 3310-3320 bp - 681 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 43660956-43663510(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGTGTACGGAG
SmilChr03G002759 Chr03 NC_080389.1:43875726-43875736promoter 内 3308-3318 bp - 683 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 43872477-43875043(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGTGTACGGAG
SmilChr03G000757 Chr03 NC_080389.1:8643769-8643779promoter 内 3104-3114 bp - 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 8644666-8646235(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAC
SmilChr01G003044 Chr01 NC_080387.1:49425888-49425898promoter 内 3008-3018 bp - 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 49421625-49424905(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGGTA
SmilChr02G002786 Chr02 NC_080388.1:47935054-47935064promoter 内 2720-2730 bp - 1271 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 47930341-47933783(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTTGTACGGTA
SmilChr01G004943 Chr01 NC_080387.1:67543253-67543263promoter 内 2635-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 67544619-67546930(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAC
SmilChr03G003739 Chr03 NC_080389.1:56452815-56452825promoter 内 2409-2419 bp + 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 56454407-56458435(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AGTGTACGGAA
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SmilChr02G005142 Chr02 NC_080388.1:72835650-72835660promoter 内 631-641 bp + 3360 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 72830020-72832290(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTCCGTACACT
SmilChr01G005180 Chr01 NC_080387.1:69520111-69520121promoter 内 575-585 bp + 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 69523537-69526664(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGTC
SmilChr02G003436 Chr02 NC_080388.1:55600100-55600110promoter 内 506-516 bp + 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 3 55589245-55596615(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTCCGTACCTG
SmilChr03G003660 Chr03 NC_080389.1:55426256-55426266promoter 内 3901-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 55426356-55427793(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TGCCGTACAAT
SmilChr03G002515 Chr03 NC_080389.1:40029311-40029321promoter 内 3809-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.6/ 100 2 40029503-40030220(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAC