Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G006187; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027306-RA_Salv SmilChr01G006187 GRAS XP_057798078.1 MP00611 AAGAAAAAGACAAAAAAAAA

可能结合的靶基因

9807 个结合位点 6232 个候选靶基因 第 22 / 125 下载 TSV

上一页 22 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005540 Chr02 NC_080388.1:75416381-75416400promoter 内 1718-1737 bp - 2264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 75418664-75420406(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TACCCGTTTCTCTTTTTCTC
SmilChr02G001454 Chr02 NC_080388.1:27214571-27214590promoter 内 1248-1267 bp - 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 27217324-27218875(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCGTCTTCGTCTTTTCCCT
SmilChr02G003840 Chr02 NC_080388.1:60119664-60119683promoter 内 1172-1191 bp - 2810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 60113846-60116854(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr02G000197 Chr02 NC_080388.1:2494705-2494724promoter 内 1045-1064 bp + 2937 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 2490229-2491768(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCCTTTCTCTCCTTTTCTT
SmilChr01G003278 Chr01 NC_080387.1:51481461-51481480promoter 内 756-775 bp + 3226 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 51484706-51486552(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr02G004343 Chr02 NC_080388.1:65690210-65690229promoter 内 734-753 bp + 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 65693477-65704341(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G002364 Chr01 NC_080387.1:40802807-40802826promoter 内 569-588 bp - 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 40806239-40815704(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCCTTTCTCTCCTTTTCTT
SmilChr01G001938 Chr01 NC_080387.1:34573402-34573421promoter 内 446-465 bp - 3536 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 34576957-34578623(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCTTTTTTTCTTTTTTCCTC
SmilChr03G000961 Chr03 NC_080389.1:10854305-10854324promoter 内 237-256 bp + 3745 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 10849459-10850560(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GCTTCTTGTGTCTTTGTCTG
SmilChr02G003413 Chr02 NC_080388.1:55308764-55308783promoter 内 125-144 bp + 3857 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 55292135-55304907(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCCTTTCTCTCCTTTTCTT
SmilChr01G003741 Chr01 NC_080387.1:55713858-55713877promoter 内 119-138 bp - 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 2 55717740-55721386(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTTTTCTCTCTTTTTTTG
SmilChr01G004128 Chr01 NC_080387.1:59804565-59804584promoter 内 3945-3964 bp - 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59803567-59804528(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TACAAAAAGAGAGAGGGGGG
SmilChr03G001407 Chr03 NC_080389.1:16670511-16670530promoter 内 3891-3910 bp - 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16670621-16674981(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTCTTTCTTTCTT
SmilChr01G000576 Chr01 NC_080387.1:11987099-11987118promoter 内 3802-3821 bp + 180 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 11987298-11989109(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGCAGAGAGACAAAGACCAG
SmilChr02G003181 Chr02 NC_080388.1:52968314-52968333promoter 内 3573-3592 bp + 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52968742-52974121(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAAAAAAGACAAACACAAG
SmilChr02G000360 Chr02 NC_080388.1:4643031-4643050promoter 内 3559-3578 bp + 423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 4643473-4647673(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGGGAAAGAGAAAAAAACA
SmilChr02G001967 Chr02 NC_080388.1:35611233-35611252promoter 内 3529-3548 bp - 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 35609110-35610780(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACGAAGAAGACAAAGGGCGC
SmilChr01G005612 Chr01 NC_080387.1:72655546-72655565promoter 内 3366-3385 bp - 616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72656181-72657800(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTCTCTTTGTCTCTGTTTT
SmilChr03G000782 Chr03 NC_080389.1:8905927-8905946promoter 内 2984-3003 bp - 998 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8902676-8904929(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G000198 Chr03 NC_080389.1:2259003-2259022promoter 内 2980-2999 bp + 1002 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2260024-2265235(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G005531 Chr01 NC_080387.1:72166736-72166755promoter 内 2975-2994 bp + 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72162633-72165729(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTTTTTTTCTCATTTTCTG
SmilChr02G000851 Chr02 NC_080388.1:14449302-14449321promoter 内 2957-2976 bp - 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14436538-14448277(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G002481 Chr03 NC_080389.1:39397556-39397575promoter 内 2944-2963 bp - 1038 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39393354-39396518(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G002935 Chr03 NC_080389.1:46088664-46088683promoter 内 2922-2941 bp + 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 46089743-46089829(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G003559 Chr03 NC_080389.1:54241015-54241034promoter 内 2897-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54242119-54246327(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G000379 Chr01 NC_080387.1:7811383-7811402promoter 内 2879-2898 bp - 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7806846-7810280(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 ACGAGGGAGACAAAGGCAAT
SmilChr02G004271 Chr02 NC_080388.1:64906758-64906777promoter 内 2817-2836 bp - 1165 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 64907942-64908500(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTTCTTTTTGTCTGTCTGCC
SmilChr02G004283 Chr02 NC_080388.1:65074216-65074235promoter 内 2778-2797 bp - 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 65071183-65073012(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr02G000033 Chr02 NC_080388.1:407942-407961promoter 内 2741-2760 bp - 1241 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 405610-406701(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G003675 Chr01 NC_080387.1:55181248-55181267promoter 内 2605-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 55177429-55179871(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GAGAGGAAGACAAACTTGGA
SmilChr02G004572 Chr02 NC_080388.1:68218855-68218874promoter 内 2565-2584 bp + 1417 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 68220291-68226607(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AGCAAAGAGACAAAAATCGA
SmilChr02G001414 Chr02 NC_080388.1:26765393-26765412promoter 内 2423-2442 bp - 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 26763248-26763834(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGAGAAAAACAAAAAAAAA
SmilChr01G003570 Chr01 NC_080387.1:54276090-54276109promoter 内 2362-2381 bp - 1620 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 54266905-54274470(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGAGAAAAACAAAAAAAAA
SmilChr02G004469 Chr02 NC_080388.1:67091769-67091788promoter 内 2358-2377 bp - 1624 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 67093412-67237173(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCCCGTTTTGTCGCCTTCGT
SmilChr03G003200 Chr03 NC_080389.1:49539392-49539411promoter 内 2318-2337 bp - 1664 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 49541075-49543951(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TTCTCTTTTGTCTCTCCTCC
SmilChr03G003783 Chr03 NC_080389.1:56949862-56949881promoter 内 2304-2323 bp - 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 56944762-56948184(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G003452 Chr03 NC_080389.1:52887456-52887475promoter 内 2157-2176 bp - 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52875517-52885631(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAGAATAAGACAAAAAAAAA
SmilChr02G001005 Chr02 NC_080388.1:17737909-17737928promoter 内 2072-2091 bp + 1910 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 17735893-17735999(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCGTCTTCGTCTTTTCCCT
SmilChr01G004850 Chr01 NC_080387.1:66650050-66650069promoter 内 2067-2086 bp + 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 66645360-66648135(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCTTTTTTTCTTTCTTTCTT
SmilChr01G005831 Chr01 NC_080387.1:74318484-74318503promoter 内 1993-2012 bp + 1989 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 74320492-74322068(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G003350 Chr01 NC_080387.1:52255451-52255470promoter 内 1926-1945 bp + 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52257526-52261602(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G001336 Chr03 NC_080389.1:15600990-15601009promoter 内 1919-1938 bp - 2063 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 15595801-15598927(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr03G001486 Chr03 NC_080389.1:17924692-17924711promoter 内 1766-1785 bp - 2216 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 17915486-17922476(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGAGAAAAACAAAAAAAAA
SmilChr03G002562 Chr03 NC_080389.1:40818300-40818319promoter 内 1663-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40820638-40821840(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CCGGTCCCTCTCTTTTTCTC
SmilChr02G003765 Chr02 NC_080388.1:59350067-59350086promoter 内 1559-1578 bp + 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59352509-59353943(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G002863 Chr01 NC_080387.1:47219618-47219637promoter 内 1531-1550 bp + 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47222088-47227943(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 GGGAAAAAGAAAAAAAAAGA
SmilChr03G003152 Chr03 NC_080389.1:48882673-48882692promoter 内 1467-1486 bp + 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48879391-48880158(-) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 CTTTGTTTCCTCTTTTTCTT
SmilChr01G002541 Chr01 NC_080387.1:43465182-43465201promoter 内 1440-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 43467743-43470353(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr02G004764 Chr02 NC_080388.1:69821287-69821306promoter 内 1433-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 69823855-69827544(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 AAAGAAACGACAAAAGTGGG
SmilChr01G002477 Chr01 NC_080387.1:42513400-42513419promoter 内 1376-1395 bp - 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 42516025-42518500(+) SMil_00027306-RA_Salv MP00611 TCCGTCTTCGTCTTTTCCCT