转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 23 / 143 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002070 Chr06 NC_080392.1:27311447-27311458promoter 内 209-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 27315239-27318545(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr07G003304 Chr07 NC_080393.1:35052327-35052338promoter 内 205-216 bp + 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 35046134-35048542(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCCAGCTGTCTT
SmilChr03G002015 Chr03 NC_080389.1:30099488-30099499promoter 内 182-193 bp - 3808 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 30094670-30095680(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGGA
SmilChr05G003273 Chr05 NC_080391.1:42525562-42525573promoter 内 3622-3633 bp + 368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 42524850-42525194(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAT
SmilChr08G001706 Chr08 NC_080394.1:14274691-14274702promoter 内 3551-3562 bp - 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14275141-14276903(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAT
SmilChr01G002017 Chr01 NC_080387.1:35746805-35746816promoter 内 3409-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35745559-35746224(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAT
SmilChr08G002191 Chr08 NC_080394.1:19788851-19788862promoter 内 3366-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 19787523-19788227(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr03G000607 Chr03 NC_080389.1:6707837-6707848promoter 内 3185-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 6706463-6707032(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr02G002006 Chr02 NC_080388.1:36195014-36195025promoter 内 3176-3187 bp - 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36195839-36196471(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr07G001559 Chr07 NC_080393.1:12739325-12739336promoter 内 3156-3167 bp - 834 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 12740170-12742662(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr07G003003 Chr07 NC_080393.1:30837086-30837097promoter 内 3049-3060 bp - 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 30838038-30838700(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr08G003402 Chr08 NC_080394.1:35877698-35877709promoter 内 3038-3049 bp + 952 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35878661-35880653(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr07G001367 Chr07 NC_080393.1:10606772-10606783promoter 内 3022-3033 bp - 968 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 10607751-10608560(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr04G002226 Chr04 NC_080390.1:35989711-35989722promoter 内 3007-3018 bp + 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35988241-35988728(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr04G002228 Chr04 NC_080390.1:36000630-36000641promoter 内 3007-3018 bp + 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35999160-35999647(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr02G004386 Chr02 NC_080388.1:66201310-66201321promoter 内 2997-3008 bp - 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 66202314-66205202(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr04G001450 Chr04 NC_080390.1:23827749-23827760promoter 内 2927-2938 bp - 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 23828823-23830991(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr08G003740 Chr08 NC_080394.1:42345925-42345936promoter 内 2913-2924 bp + 1077 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 42347013-42349132(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr02G000843 Chr02 NC_080388.1:14326915-14326926promoter 内 2880-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14328036-14329067(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr02G005502 Chr02 NC_080388.1:75155035-75155046promoter 内 2876-2887 bp + 1114 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 75156160-75159521(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGTG
SmilChr06G001693 Chr06 NC_080392.1:19353024-19353035promoter 内 2864-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 19354161-19354634(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr08G003392 Chr08 NC_080394.1:35701714-35701725promoter 内 2641-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35703074-35705513(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr06G002006 Chr06 NC_080392.1:25750630-25750641promoter 内 2608-2619 bp - 1382 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 25752023-25752652(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr07G004409 Chr07 NC_080393.1:56704275-56704286promoter 内 2497-2508 bp + 1493 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 56705779-56708376(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr08G000101 Chr08 NC_080394.1:623744-623755promoter 内 2483-2494 bp + 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 625262-627529(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr08G000077 Chr08 NC_080394.1:446331-446342promoter 内 2479-2490 bp + 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 447853-450177(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr08G001084 Chr08 NC_080394.1:8358926-8358937promoter 内 2455-2466 bp + 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 8355099-8357391(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCGA
SmilChr08G000085 Chr08 NC_080394.1:487212-487223promoter 内 2420-2431 bp + 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 488793-491689(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr02G000842 Chr02 NC_080388.1:14326915-14326926promoter 内 2288-2299 bp + 1702 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14322299-14325213(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAT
SmilChr02G000083 Chr02 NC_080388.1:1093083-1093094promoter 内 2219-2230 bp - 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 1094865-1096786(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCAG
SmilChr04G003723 Chr04 NC_080390.1:53569764-53569775promoter 内 2215-2226 bp - 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 53571550-53574743(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCTC
SmilChr01G000630 Chr01 NC_080387.1:14082265-14082276promoter 内 2160-2171 bp + 1830 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 14084106-14086762(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr05G002935 Chr05 NC_080391.1:35382514-35382525promoter 内 2127-2138 bp + 1863 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 35384388-35385793(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr02G003149 Chr02 NC_080388.1:52521167-52521178promoter 内 2049-2060 bp + 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 52517472-52519226(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCAC
SmilChr07G003231 Chr07 NC_080393.1:34312089-34312100promoter 内 1928-1939 bp - 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34302185-34310027(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr08G000102 Chr08 NC_080394.1:626785-626796promoter 内 1923-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 628863-631243(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr03G002148 Chr03 NC_080389.1:33415303-33415314promoter 内 1851-1862 bp + 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 33417453-33418998(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr08G000078 Chr08 NC_080394.1:449438-449449promoter 内 1846-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 451593-470408(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCTA
SmilChr01G002279 Chr01 NC_080387.1:39580267-39580278promoter 内 1765-1776 bp - 2225 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 39582503-39591376(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTAGCTGTCAC
SmilChr01G004276 Chr01 NC_080387.1:60993131-60993142promoter 内 1572-1583 bp + 2418 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 60986629-60990713(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCAT
SmilChr04G001587 Chr04 NC_080390.1:26377046-26377057promoter 内 1523-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 26379524-26382320(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr05G002081 Chr05 NC_080391.1:21742106-21742117promoter 内 1487-1498 bp - 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 21744620-21746183(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTCTC
SmilChr02G004017 Chr02 NC_080388.1:62468987-62468998promoter 内 1466-1477 bp - 2524 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 62458265-62466463(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCGT
SmilChr06G001999 Chr06 NC_080392.1:25524036-25524047promoter 内 1444-1455 bp + 2546 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 25526593-25529411(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr05G002121 Chr05 NC_080391.1:22287852-22287863promoter 内 1342-1353 bp - 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 22284437-22285204(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr02G000811 Chr02 NC_080388.1:13601701-13601712promoter 内 1304-1315 bp + 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 13604398-13606703(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr08G003635 Chr08 NC_080394.1:39673417-39673428promoter 内 1303-1314 bp + 2687 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 39676115-39676858(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCTG
SmilChr06G000240 Chr06 NC_080392.1:1608558-1608569promoter 内 1192-1203 bp + 2798 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 1611367-1611861(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAGC
SmilChr01G000121 Chr01 NC_080387.1:2047512-2047523promoter 内 1106-1117 bp - 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 2050407-2050513(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC
SmilChr07G001368 Chr07 NC_080393.1:10606772-10606783promoter 内 934-945 bp - 3056 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 10609839-10612787(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCAC