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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003973; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00011986-RA_Salv SmilChr04G003973 HD-ZIP XP_057805857.1 MP00013 TAATGATTGG

可能结合的靶基因

9712 个结合位点 5927 个候选靶基因 第 23 / 119 下载 TSV

上一页 23 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000155 Chr02 NC_080388.1:2015520-2015529promoter 内 619-628 bp + 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 2018902-2021942(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G004751 Chr01 NC_080387.1:65689805-65689814promoter 内 613-622 bp - 3379 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 65684443-65686426(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G001153 Chr01 NC_080387.1:23492419-23492428promoter 内 569-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 23483744-23488996(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G001918 Chr01 NC_080387.1:34326952-34326961promoter 内 499-508 bp - 3493 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 34317381-34323459(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr02G002155 Chr02 NC_080388.1:38779114-38779123promoter 内 495-504 bp - 3497 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 38775008-38775617(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G000742 Chr01 NC_080387.1:16419292-16419301promoter 内 494-503 bp + 3498 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 16422799-16423392(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G000751 Chr01 NC_080387.1:16595468-16595477promoter 内 472-481 bp - 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 16598997-16602119(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCA
SmilChr02G004157 Chr02 NC_080388.1:63896627-63896636promoter 内 439-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 63888779-63893074(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCA
SmilChr01G001874 Chr01 NC_080387.1:33770182-33770191promoter 内 370-379 bp - 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 33760644-33766560(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G003768 Chr01 NC_080387.1:56051326-56051335promoter 内 234-243 bp + 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 56045957-56047568(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCA
SmilChr02G000786 Chr02 NC_080388.1:12922075-12922084promoter 内 226-235 bp - 3766 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 12913989-12918309(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr02G001853 Chr02 NC_080388.1:33746908-33746917promoter 内 214-223 bp + 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 33750695-33751658(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr01G000163 Chr01 NC_080387.1:2710229-2710238promoter 内 177-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 2703580-2706414(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 TGATGATTGG
SmilChr02G001028 Chr02 NC_080388.1:18198721-18198730promoter 内 63-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 18191178-18194792(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCA
SmilChr01G005480 Chr01 NC_080387.1:71780073-71780082promoter 内 2550-2559 bp - 1442 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 71775356-71778631(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr01G004548 Chr01 NC_080387.1:63610520-63610529promoter 内 1559-1568 bp - 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 63605638-63608087(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr02G002770 Chr02 NC_080388.1:47752765-47752774promoter 内 3476-3485 bp - 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 47753290-47755958(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G002065 Chr01 NC_080387.1:36508858-36508867promoter 内 3115-3124 bp + 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 36504862-36507981(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
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SmilChr01G001239 Chr01 NC_080387.1:24810784-24810793promoter 内 3394-3403 bp + 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 24797033-24810186(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G002093 Chr01 NC_080387.1:36946410-36946419promoter 内 3053-3062 bp - 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 36947358-36950451(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G003602 Chr01 NC_080387.1:54569718-54569727promoter 内 2039-2048 bp - 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 54571680-54573014(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G004062 Chr01 NC_080387.1:59042848-59042857promoter 内 2037-2046 bp + 1955 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 59040510-59040893(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr02G003004 Chr02 NC_080388.1:50692640-50692649promoter 内 1901-1910 bp + 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 50689365-50690549(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
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SmilChr02G000891 Chr02 NC_080388.1:15332167-15332176promoter 内 1170-1179 bp - 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 15334998-15339992(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G004601 Chr01 NC_080387.1:63992525-63992534promoter 内 1099-1108 bp - 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 63995427-64002877(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr02G002423 Chr02 NC_080388.1:42195196-42195205promoter 内 936-945 bp - 3056 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 42198261-42199616(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G005483 Chr01 NC_080387.1:71789863-71789872promoter 内 911-920 bp - 3081 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 71792953-71796786(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G001157 Chr01 NC_080387.1:23520247-23520256promoter 内 3599-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 23515547-23519854(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr02G001156 Chr02 NC_080388.1:21110112-21110121promoter 内 3374-3383 bp + 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 21105216-21109494(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr02G003534 Chr02 NC_080388.1:56488940-56488949promoter 内 3358-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 56484043-56488306(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr02G001532 Chr02 NC_080388.1:28573830-28573839promoter 内 3308-3317 bp - 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28571974-28573146(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr01G004035 Chr01 NC_080387.1:58772980-58772989promoter 内 3097-3106 bp + 895 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 58773884-58775054(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr01G000937 Chr01 NC_080387.1:19846800-19846809promoter 内 2927-2936 bp - 1065 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 19844941-19845735(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
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SmilChr01G001781 Chr01 NC_080387.1:32689152-32689161promoter 内 1599-1608 bp + 2393 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 32691554-32693498(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr02G002461 Chr02 NC_080388.1:42917795-42917804promoter 内 1564-1573 bp - 2428 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 42920232-42921125(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr02G001002 Chr02 NC_080388.1:17655008-17655017promoter 内 1522-1531 bp + 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 17648870-17652538(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G006086 Chr01 NC_080387.1:76341326-76341335promoter 内 1464-1473 bp + 2528 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 76343863-76347883(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr02G002329 Chr02 NC_080388.1:40987675-40987684promoter 内 1457-1466 bp - 2535 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 40983990-40985140(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr01G002192 Chr01 NC_080387.1:38060008-38060017promoter 内 1304-1313 bp - 2688 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 38062705-38063397(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
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SmilChr02G002481 Chr02 NC_080388.1:43203420-43203429promoter 内 621-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 43206800-43209621(+) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCATCG
SmilChr01G005481 Chr01 NC_080387.1:71789863-71789872promoter 内 288-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 71780374-71786159(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CGATGATTGG
SmilChr01G003427 Chr01 NC_080387.1:52934598-52934607promoter 内 1746-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 52929091-52932352(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCAATG
SmilChr01G003495 Chr01 NC_080387.1:53556402-53556411promoter 内 1674-1683 bp + 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 5 53550772-53554084(-) SMil_00011986-RA_Salv MP00013 CCAATCAATG