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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 27 / 149 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004215 Chr03 NC_080389.1:60725460-60725474promoter 内 2654-2668 bp + 1333 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 60726807-60730533(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATCTTATCCTTTTC
SmilChr03G004600 Chr03 NC_080389.1:63795215-63795229promoter 内 2524-2538 bp - 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63791313-63793752(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCGTTATCCAATTT
SmilChr02G005540 Chr02 NC_080388.1:75417162-75417176promoter 内 2499-2513 bp + 1488 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 75418664-75420406(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCACAAA
SmilChr01G004574 Chr01 NC_080387.1:63792912-63792926promoter 内 2311-2325 bp + 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63789701-63791236(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTAAGGATAAGATA
SmilChr03G003239 Chr03 NC_080389.1:50285165-50285179promoter 内 2276-2290 bp + 1711 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 50286890-50290839(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACATTATCCAGAAT
SmilChr03G004610 Chr03 NC_080389.1:63833182-63833196promoter 内 2253-2267 bp - 1734 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63829153-63831448(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCGTTATCCAATTT
SmilChr04G001999 Chr04 NC_080390.1:32340206-32340220promoter 内 2234-2248 bp - 1753 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 32335424-32338453(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACTCTTATCCATATA
SmilChr02G005373 Chr02 NC_080388.1:74414881-74414895promoter 内 2102-2116 bp + 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 74416780-74419529(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACATTATCCAAACT
SmilChr03G004606 Chr03 NC_080389.1:63820353-63820367promoter 内 2093-2107 bp - 1894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63815932-63818459(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCGTTATCCAATTT
SmilChr01G006170 Chr01 NC_080387.1:77210907-77210921promoter 内 2034-2048 bp - 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 77205882-77208954(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCATTATCCAATAT
SmilChr01G004528 Chr01 NC_080387.1:63475907-63475921promoter 内 1990-2004 bp + 1997 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 63467710-63473910(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAATTGGATAAGACG
SmilChr01G001160 Chr01 NC_080387.1:23562754-23562768promoter 内 1748-1762 bp - 2239 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 23565007-23582155(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTGGATAAGATC
SmilChr03G001323 Chr03 NC_080389.1:15467465-15467479promoter 内 1712-1726 bp + 2275 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 15469754-15470548(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGTCTTATCCAATAC
SmilChr03G001321 Chr03 NC_080389.1:15467465-15467479promoter 内 1678-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 15463229-15465156(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTATTGGATAAGACG
SmilChr01G002821 Chr01 NC_080387.1:46771770-46771784promoter 内 1626-1640 bp + 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 46765440-46769409(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATAAGGATAAGATA
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SmilChr04G002476 Chr04 NC_080390.1:39594678-39594692promoter 内 1252-1266 bp - 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 39597427-39606981(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTATTAGATAAGGTG
SmilChr03G004213 Chr03 NC_080389.1:60725460-60725474promoter 内 1086-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 60720102-60722559(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAAAAGGATAAGATC
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SmilChr01G003161 Chr01 NC_080387.1:50430265-50430279promoter 内 940-954 bp + 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 50424449-50427218(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAAGAAA
SmilChr01G002638 Chr01 NC_080387.1:44668681-44668695promoter 内 830-844 bp + 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 44671852-44672502(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAGCTTATCCACATT
SmilChr01G000978 Chr01 NC_080387.1:20683960-20683974promoter 内 601-615 bp - 3386 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 20678587-20680574(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACCTTATCCGTTCA
SmilChr01G000609 Chr01 NC_080387.1:13466699-13466713promoter 内 387-401 bp + 3600 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 13460631-13463099(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAAGCTG
SmilChr03G004641 Chr03 NC_080389.1:63997177-63997191promoter 内 258-272 bp + 3729 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 64000920-64004225(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAACTTATCCACTTT
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SmilChr02G002634 Chr02 NC_080388.1:45714117-45714131promoter 内 30-44 bp + 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 45705858-45710160(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTTGGATAAGTAT
SmilChr01G003086 Chr01 NC_080387.1:49692554-49692568promoter 内 3-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 1 49696552-49699537(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATCTCATCCATAAC
SmilChr01G004936 Chr01 NC_080387.1:67460927-67460941promoter 内 3930-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 67459992-67460870(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCATTATCCACAAC
SmilChr01G004568 Chr01 NC_080387.1:63739711-63739725promoter 内 2635-2649 bp + 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 63735680-63738359(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GCAAAGGATAAGGTA
SmilChr01G005969 Chr01 NC_080387.1:75379308-75379322promoter 内 2338-2352 bp + 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 75380971-75383380(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CCCCTTATCCAATTC
SmilChr03G000043 Chr03 NC_080389.1:485071-485085promoter 内 2264-2278 bp + 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 486808-487809(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCCTTATCCTCAAC
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SmilChr03G002595 Chr03 NC_080389.1:41246618-41246632promoter 内 1491-1505 bp - 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 41249128-41252082(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAATATT
SmilChr01G005967 Chr01 NC_080387.1:75379308-75379322promoter 内 1244-1258 bp + 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 75373607-75376565(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAATTGGATAAGGGG
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SmilChr03G002594 Chr03 NC_080389.1:41246618-41246632promoter 内 530-544 bp - 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 3 41242315-41243161(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTAT
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SmilChr01G005336 Chr01 NC_080387.1:70572069-70572083promoter 内 3627-3641 bp + 360 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 70567561-70571709(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATAATGGATAATATT
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SmilChr03G003465 Chr03 NC_080389.1:53066124-53066138promoter 内 3428-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 53064268-53065565(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATCTTATCCAGAAT
SmilChr02G001538 Chr02 NC_080388.1:28618334-28618348promoter 内 3216-3230 bp - 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 28607906-28617563(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTTT
SmilChr03G001248 Chr03 NC_080389.1:14376832-14376846promoter 内 2882-2896 bp + 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 14377951-14385049(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTCTTATCCATAAT
SmilChr02G001494 Chr02 NC_080388.1:27888742-27888756promoter 内 2541-2555 bp + 1446 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 27886473-27887296(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGAGGATAAGGCG
SmilChr04G001175 Chr04 NC_080390.1:17642017-17642031promoter 内 2479-2493 bp - 1508 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 17643539-17643883(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTGTGGATAAGATG
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SmilChr03G001735 Chr03 NC_080389.1:23320798-23320812promoter 内 1519-1533 bp - 2468 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 23323280-23324585(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr01G002914 Chr01 NC_080387.1:47870818-47870832promoter 内 1301-1315 bp + 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 47865928-47868132(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAATGCA
SmilChr04G000398 Chr04 NC_080390.1:4119800-4119814promoter 内 1266-1280 bp + 2721 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 4111781-4117079(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAATATT
SmilChr02G003465 Chr02 NC_080388.1:55937374-55937388promoter 内 1063-1077 bp - 2924 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.9/ 100 2 55940312-55951864(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATGGATAAAGTA