转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 27 / 148 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003454 Chr04 NC_080390.1:51028104-51028117promoter 内 933-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 51021581-51025049(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTGTT
SmilChr01G005759 Chr01 NC_080387.1:73701209-73701222promoter 内 770-783 bp + 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 73682109-73697991(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCTGCA
SmilChr04G000427 Chr04 NC_080390.1:4533320-4533333promoter 内 419-432 bp - 3569 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 4528979-4529751(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGGCCTCACGTGC
SmilChr02G001882 Chr02 NC_080388.1:34142803-34142816promoter 内 409-422 bp + 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 34137767-34139224(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGCCCT
SmilChr03G003765 Chr03 NC_080389.1:56786610-56786623promoter 内 379-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56790232-56794537(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAGCGACACGTGG
SmilChr04G003892 Chr04 NC_080390.1:54712515-54712528promoter 内 279-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 54716237-54718448(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGCCCA
SmilChr06G000508 Chr06 NC_080392.1:4214022-4214035promoter 内 3763-3776 bp - 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 4213033-4213797(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAGATCACGTGG
SmilChr03G000248 Chr03 NC_080389.1:2939980-2939993promoter 内 641-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 2933852-2936633(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACGGCTC
SmilChr02G003197 Chr02 NC_080388.1:53134671-53134684promoter 内 3919-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 53134753-53138329(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACGCGCCACGTGG
SmilChr08G000778 Chr08 NC_080394.1:5733841-5733854promoter 内 3855-3868 bp - 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 5733113-5733708(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGGAGCCACGTGG
SmilChr02G003286 Chr02 NC_080388.1:54152918-54152931promoter 内 2852-2865 bp + 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 54149753-54151782(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTACG
SmilChr05G004194 Chr05 NC_080391.1:55819173-55819186promoter 内 2842-2855 bp + 1146 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 55820332-55821366(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAGTCCACGTGG
SmilChr04G003319 Chr04 NC_080390.1:49938272-49938285promoter 内 2426-2439 bp + 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 49935395-49936710(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTACG
SmilChr08G000779 Chr08 NC_080394.1:5733841-5733854promoter 内 2307-2320 bp - 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 5735535-5742123(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTCCAT
SmilChr05G002605 Chr05 NC_080391.1:29248595-29248608promoter 内 2153-2166 bp + 1835 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 29250443-29250949(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTACGGCACGTGG
SmilChr07G003758 Chr07 NC_080393.1:45862488-45862501promoter 内 1157-1170 bp + 2831 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 45857706-45859657(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACGAT
SmilChr01G001658 Chr01 NC_080387.1:30645464-30645477promoter 内 1137-1150 bp - 2851 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 30648328-30650655(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTCCAT
SmilChr05G004193 Chr05 NC_080391.1:55819173-55819186promoter 内 235-248 bp + 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 55808395-55815420(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGACTCCC
SmilChr01G000179 Chr01 NC_080387.1:2944730-2944743promoter 内 211-224 bp - 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 2940477-2940953(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCGTGCCACGTGG
SmilChr01G005752 Chr01 NC_080387.1:73595897-73595910promoter 内 3899-3912 bp - 89 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 73593282-73595808(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCACGTCACGTGA
SmilChr04G003671 Chr04 NC_080390.1:53167262-53167275promoter 内 3859-3872 bp + 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 53167404-53170482(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGTCGACACGTGG
SmilChr05G003336 Chr05 NC_080391.1:43804834-43804847promoter 内 3531-3544 bp + 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 43804306-43804377(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACCAT
SmilChr06G000811 Chr06 NC_080392.1:7629999-7630012promoter 内 3334-3347 bp - 654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7625645-7629345(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr05G001762 Chr05 NC_080391.1:17334718-17334731promoter 内 3311-3324 bp - 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 17332551-17334041(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAAGACACGTGG
SmilChr07G004338 Chr07 NC_080393.1:55938049-55938062promoter 内 3241-3254 bp - 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 55938809-55944954(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTCGTC
SmilChr01G005194 Chr01 NC_080387.1:69632824-69632837promoter 内 3116-3129 bp + 872 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 69627145-69631952(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCGTAAC
SmilChr03G000318 Chr03 NC_080389.1:3637596-3637609promoter 内 2899-2912 bp + 1089 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 3638698-3641891(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr03G000128 Chr03 NC_080389.1:1409773-1409786promoter 内 2671-2684 bp - 1317 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 1405567-1408456(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr07G003173 Chr07 NC_080393.1:33777571-33777584promoter 内 2610-2623 bp + 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 33778962-33781907(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr03G000672 Chr03 NC_080389.1:7525246-7525259promoter 内 2575-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7520940-7523833(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr02G001758 Chr02 NC_080388.1:32324132-32324145promoter 内 2554-2567 bp + 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 32325579-32328119(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr06G000776 Chr06 NC_080392.1:7270313-7270326promoter 内 2553-2566 bp + 1435 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 7271761-7274401(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr03G000312 Chr03 NC_080389.1:3553880-3553893promoter 内 2540-2553 bp + 1448 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 3555341-3558022(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr05G001774 Chr05 NC_080391.1:17448249-17448262promoter 内 2487-2500 bp - 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 17443923-17446748(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr04G001686 Chr04 NC_080390.1:27886205-27886218promoter 内 2444-2457 bp + 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 27887762-27890697(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATGACACGTGG
SmilChr03G001244 Chr03 NC_080389.1:14346392-14346405promoter 内 2404-2417 bp - 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14342323-14344808(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr02G001517 Chr02 NC_080388.1:28280545-28280558promoter 内 2241-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 28277010-28278798(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCGACCT
SmilChr01G005473 Chr01 NC_080387.1:71714841-71714854promoter 内 2181-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 71716661-71719500(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACGTGAT
SmilChr01G000620 Chr01 NC_080387.1:13723048-13723061promoter 内 1957-1970 bp - 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 13725092-13726006(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATCGCC
SmilChr05G000647 Chr05 NC_080391.1:4893824-4893837promoter 内 1811-1824 bp - 2177 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 4896014-4900275(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACTGGCT
SmilChr01G001211 Chr01 NC_080387.1:24340554-24340567promoter 内 1240-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24343315-24345554(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACGAGTCACGTGC
SmilChr02G003094 Chr02 NC_080388.1:51817290-51817303promoter 内 1110-1123 bp + 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 51820181-51822612(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTGCGACACGTGG
SmilChr07G003784 Chr07 NC_080393.1:46431472-46431485promoter 内 934-947 bp - 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 46427057-46428418(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTCGGCACGTGG
SmilChr01G005195 Chr01 NC_080387.1:69632824-69632837promoter 内 808-821 bp + 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 69636017-69645047(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTACGGCACGTGG
SmilChr04G003765 Chr04 NC_080390.1:53886541-53886554promoter 内 783-796 bp - 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 53889759-53893102(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACCCATC
SmilChr02G001499 Chr02 NC_080388.1:28034360-28034373promoter 内 550-563 bp - 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 28037811-28041256(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTCCAA
SmilChr06G001603 Chr06 NC_080392.1:17808778-17808791promoter 内 400-413 bp - 3588 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 17812379-17815194(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCACCAT
SmilChr03G001280 Chr03 NC_080389.1:14989123-14989136promoter 内 48-61 bp - 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 14981267-14985183(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGGCGCACGTGG
SmilChr01G002038 Chr01 NC_080387.1:36005687-36005700promoter 内 1436-1449 bp - 2552 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 4 36008252-36008563(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCCAAT
SmilChr06G002551 Chr06 NC_080392.1:36649591-36649604promoter 内 3849-3862 bp + 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.7/ 100 3 36649743-36651784(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAGAGGACACGTGG