转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 30 / 149 下载 TSV

上一页 30 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000882 Chr04 NC_080390.1:11232530-11232540promoter 内 939-949 bp + 3052 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 11228638-11229478(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr02G002378 Chr02 NC_080388.1:41681160-41681170promoter 内 936-946 bp + 3055 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 41675976-41678105(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr04G002579 Chr04 NC_080390.1:41154333-41154343promoter 内 889-899 bp - 3102 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 41157445-41162504(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr01G001036 Chr01 NC_080387.1:21548293-21548303promoter 内 879-889 bp + 3112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 21551415-21557729(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCA
SmilChr05G002932 Chr05 NC_080391.1:35355531-35355541promoter 内 878-888 bp + 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 35358654-35364484(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr07G002116 Chr07 NC_080393.1:19264783-19264793promoter 内 832-842 bp + 3159 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 19267952-19273337(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr04G002666 Chr04 NC_080390.1:42066480-42066490promoter 内 802-812 bp - 3189 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 42061272-42063291(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCA
SmilChr05G002400 Chr05 NC_080391.1:26488883-26488893promoter 内 781-791 bp - 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 26492103-26496935(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr07G002960 Chr07 NC_080393.1:30077449-30077459promoter 内 749-759 bp + 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 30080701-30084357(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr02G001424 Chr02 NC_080388.1:26891845-26891855promoter 内 698-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 26884547-26888552(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr02G002344 Chr02 NC_080388.1:41177126-41177136promoter 内 684-694 bp - 3307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 41180443-41183329(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr03G003789 Chr03 NC_080389.1:56993877-56993887promoter 内 588-598 bp + 3403 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56987902-56990474(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr02G001362 Chr02 NC_080388.1:25536237-25536247promoter 内 576-586 bp - 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 25531465-25532822(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr06G003009 Chr06 NC_080392.1:42977293-42977303promoter 内 522-532 bp - 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 42953956-42973824(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr04G002180 Chr04 NC_080390.1:35225959-35225969promoter 内 487-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 35215561-35222455(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr03G000801 Chr03 NC_080389.1:9179680-9179690promoter 内 481-491 bp + 3510 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 9176064-9176170(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr02G000353 Chr02 NC_080388.1:4576955-4576965promoter 内 480-490 bp + 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 4558223-4573444(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr03G000445 Chr03 NC_080389.1:4786347-4786357promoter 内 454-464 bp - 3537 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 4778237-4782810(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr01G003238 Chr01 NC_080387.1:51133541-51133551promoter 内 441-451 bp - 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 51127601-51129991(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr06G001412 Chr06 NC_080392.1:14811441-14811451promoter 内 386-396 bp + 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 14815056-14815812(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr03G003214 Chr03 NC_080389.1:49749226-49749236promoter 内 351-361 bp + 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 49752876-49754132(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr01G000698 Chr01 NC_080387.1:15670239-15670249promoter 内 299-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 15673941-15675703(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr03G000883 Chr03 NC_080389.1:10027495-10027505promoter 内 258-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 10022162-10023762(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr05G003975 Chr05 NC_080391.1:53545399-53545409promoter 内 254-264 bp - 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 53538751-53541662(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr01G001864 Chr01 NC_080387.1:33583895-33583905promoter 内 237-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33587659-33589279(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr01G000442 Chr01 NC_080387.1:8989666-8989676promoter 内 202-212 bp - 3789 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 8993465-8995763(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr04G004145 Chr04 NC_080390.1:56196703-56196713promoter 内 185-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56200519-56201929(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr07G001689 Chr07 NC_080393.1:14303902-14303912promoter 内 176-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 14307727-14315705(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTC
SmilChr05G003264 Chr05 NC_080391.1:42227397-42227407promoter 内 155-165 bp - 3836 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 42222539-42223561(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr02G000416 Chr02 NC_080388.1:5297878-5297888promoter 内 152-162 bp - 3839 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 5301727-5303520(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr01G006025 Chr01 NC_080387.1:75821341-75821351promoter 内 148-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 75825194-75830311(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr02G004062 Chr02 NC_080388.1:62918718-62918728promoter 内 145-155 bp - 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 62911482-62914872(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr03G004287 Chr03 NC_080389.1:61283865-61283875promoter 内 134-144 bp - 3857 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 61278212-61280008(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr05G003252 Chr05 NC_080391.1:41920575-41920585promoter 内 124-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 41914380-41916708(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr06G000163 Chr06 NC_080392.1:1134070-1134080promoter 内 122-132 bp + 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 1137949-1142389(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr06G002633 Chr06 NC_080392.1:37896600-37896610promoter 内 118-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 37891791-37892727(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr01G006024 Chr01 NC_080387.1:75821341-75821351promoter 内 78-88 bp - 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 75812618-75817428(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCA
SmilChr01G001907 Chr01 NC_080387.1:34150001-34150011promoter 内 60-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 34153942-34154646(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTTTG
SmilChr07G002349 Chr07 NC_080393.1:21815388-21815398promoter 内 3265-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 21813473-21814662(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr03G004167 Chr03 NC_080389.1:60432397-60432407promoter 内 2632-2642 bp + 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 60429488-60431038(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr06G002006 Chr06 NC_080392.1:25750630-25750640promoter 内 2608-2618 bp + 1383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 25752023-25752652(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr07G002350 Chr07 NC_080393.1:21815388-21815398promoter 内 2355-2365 bp + 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 21817034-21822704(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr01G001092 Chr01 NC_080387.1:22375914-22375924promoter 内 2271-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 22371515-22374194(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr03G001706 Chr03 NC_080389.1:22650275-22650285promoter 内 1638-1648 bp - 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 22652638-22657573(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG
SmilChr07G000524 Chr07 NC_080393.1:3657666-3657676promoter 内 720-730 bp + 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 3660947-3662349(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCGGCTGTCA
SmilChr01G001093 Chr01 NC_080387.1:22375914-22375924promoter 内 192-202 bp + 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 3 22379723-22397006(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr05G002057 Chr05 NC_080391.1:21421907-21421917promoter 内 3493-3503 bp - 498 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 21419188-21421409(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr02G002051 Chr02 NC_080388.1:36927097-36927107promoter 内 3151-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 36927947-36929065(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTGTT
SmilChr06G001693 Chr06 NC_080392.1:19353024-19353034promoter 内 2864-2874 bp + 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 19354161-19354634(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAGAGCTGTCA
SmilChr04G001205 Chr04 NC_080390.1:18637521-18637531promoter 内 2824-2834 bp - 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 18638698-18649252(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTCTG