转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 31 / 135 下载 TSV

上一页 31 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000829 Chr03 NC_080389.1:9518255-9518269promoter 内 162-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 9509952-9514430(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATACCTTATCTTT
SmilChr01G002038 Chr01 NC_080387.1:36004353-36004367promoter 内 102-116 bp + 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 36008252-36008563(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTTTTCTTATCCTT
SmilChr01G001192 Chr01 NC_080387.1:24058204-24058218promoter 内 3863-3877 bp + 124 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 24058342-24059483(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACTATCTTATCCCC
SmilChr02G004561 Chr02 NC_080388.1:68123111-68123125promoter 内 3846-3860 bp - 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 68123266-68124433(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGGAAAAA
SmilChr03G001222 Chr03 NC_080389.1:14082873-14082887promoter 内 3747-3761 bp - 240 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 14078360-14082633(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATCATCTTATCCTT
SmilChr03G001201 Chr03 NC_080389.1:13852182-13852196promoter 内 3734-3748 bp - 253 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 13852449-13853402(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGTATAA
SmilChr01G004364 Chr01 NC_080387.1:61839110-61839124promoter 内 3715-3729 bp + 272 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 61834267-61838838(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGATCTTG
SmilChr02G001055 Chr02 NC_080388.1:18819536-18819550promoter 内 3695-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18819842-18819997(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGAACCTTATCATT
SmilChr02G001058 Chr02 NC_080388.1:18827598-18827612promoter 内 3695-3709 bp + 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18827904-18828059(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGAACCTTATCATT
SmilChr01G005058 Chr01 NC_080387.1:68496941-68496955promoter 内 3687-3701 bp - 300 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 68497255-68498694(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAATCAA
SmilChr03G002773 Chr03 NC_080389.1:44136683-44136697promoter 内 3640-3654 bp + 347 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 44130448-44136336(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGATCGA
SmilChr01G005488 Chr01 NC_080387.1:71821317-71821331promoter 内 3554-3568 bp - 433 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 71821764-71825122(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGGATAAGATTAGA
SmilChr01G002732 Chr01 NC_080387.1:45676136-45676150promoter 内 3319-3333 bp - 668 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45676818-45680727(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAATCAA
SmilChr02G001056 Chr02 NC_080388.1:18819536-18819550promoter 内 3311-3325 bp + 676 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18820226-18823614(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGAACCTTATCATT
SmilChr02G000369 Chr02 NC_080388.1:4695375-4695389promoter 内 3113-3127 bp + 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4693613-4694501(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGATTAA
SmilChr01G003546 Chr01 NC_080387.1:54045308-54045322promoter 内 2961-2975 bp + 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54046348-54049957(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACTCACCTTATCAAC
SmilChr02G000751 Chr02 NC_080388.1:12264168-12264182promoter 内 2924-2938 bp + 1063 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12261593-12263105(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGAATTTA
SmilChr01G003463 Chr01 NC_080387.1:53208303-53208317promoter 内 2877-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 53209427-53212949(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGCATTCTTATCCTT
SmilChr02G001197 Chr02 NC_080388.1:22015760-22015774promoter 内 2818-2832 bp + 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 22016943-22017401(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCAGACCTTATCTCC
SmilChr01G002942 Chr01 NC_080387.1:48203414-48203428promoter 内 2798-2812 bp + 1189 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 48199708-48202225(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGATGCGG
SmilChr01G003693 Chr01 NC_080387.1:55296214-55296228promoter 内 2731-2745 bp + 1256 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 55297484-55299992(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACCTCCTTATCTGC
SmilChr03G002450 Chr03 NC_080389.1:38883676-38883690promoter 内 2629-2643 bp + 1358 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 38885048-38885557(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAACATCTTATCCAT
SmilChr01G004218 Chr01 NC_080387.1:60570550-60570564promoter 内 2599-2613 bp - 1388 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 60571952-60575509(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGAATTTA
SmilChr02G003494 Chr02 NC_080388.1:56170074-56170088promoter 内 2540-2554 bp - 1447 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56166008-56168627(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTATCATTATCCTT
SmilChr01G005002 Chr01 NC_080387.1:68069401-68069415promoter 内 2537-2551 bp - 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 68066131-68067951(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAAACATTATCCTC
SmilChr01G005394 Chr01 NC_080387.1:71212980-71212994promoter 内 2320-2334 bp + 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 71211241-71211313(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAGAAT
SmilChr01G003003 Chr01 NC_080387.1:49025942-49025956promoter 内 2317-2331 bp - 1670 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 49021629-49024272(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGATTCTTATCCTA
SmilChr01G004767 Chr01 NC_080387.1:65851469-65851483promoter 内 2253-2267 bp + 1734 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 65853217-65854059(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGTCCTTATCCAC
SmilChr01G004217 Chr01 NC_080387.1:60570550-60570564promoter 内 2102-2116 bp - 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 60565055-60568665(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAAATTCTTATCCAA
SmilChr01G003740 Chr01 NC_080387.1:55718961-55718975promoter 内 2079-2093 bp + 1908 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 55715353-55717053(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGATGATC
SmilChr01G004496 Chr01 NC_080387.1:63070611-63070625promoter 内 2015-2029 bp - 1972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 63072597-63075081(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGATGGCG
SmilChr02G004130 Chr02 NC_080388.1:63562508-63562522promoter 内 1934-1948 bp + 2053 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 63558436-63560455(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGATATAT
SmilChr01G001923 Chr01 NC_080387.1:34376038-34376052promoter 内 1889-1903 bp + 2098 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 34378150-34381522(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGATTCTTATCCTA
SmilChr03G002079 Chr03 NC_080389.1:31909797-31909811promoter 内 1865-1879 bp + 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31911933-31916492(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTGTCCTTATCCAT
SmilChr01G000390 Chr01 NC_080387.1:8041942-8041956promoter 内 1726-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8037282-8039681(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATACCTTATCTTT
SmilChr02G001731 Chr02 NC_080388.1:31802196-31802210promoter 内 1696-1710 bp - 2291 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31799366-31799905(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTTTGCTTATCCTC
SmilChr02G005033 Chr02 NC_080388.1:72048258-72048272promoter 内 1693-1707 bp + 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 72043132-72045964(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGGATAAGGTCAAC
SmilChr03G002553 Chr03 NC_080389.1:40708874-40708888promoter 内 1577-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40711298-40712479(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCTAACCTTATCAAA
SmilChr02G001977 Chr02 NC_080388.1:35727924-35727938promoter 内 1533-1547 bp - 2454 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 35730392-35731091(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGATTAA
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SmilChr03G002774 Chr03 NC_080389.1:44136683-44136697promoter 内 1025-1039 bp + 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 44139659-44140393(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGATCCTTATCTTT
SmilChr02G005224 Chr02 NC_080388.1:73450984-73450998promoter 内 955-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 73454030-73459418(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGCTTTTT
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SmilChr01G002356 Chr01 NC_080387.1:40746521-40746535promoter 内 632-646 bp - 3355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40740704-40743166(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTAGTCCTTATCCCC
SmilChr01G004073 Chr01 NC_080387.1:59137505-59137519promoter 内 622-636 bp - 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 59127187-59134140(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGGATCTTATCCTC