转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 37 / 136 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002685 Chr04 NC_080390.1:42292968-42292978promoter 内 1406-1416 bp + 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 42288245-42290383(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCA
SmilChr05G000427 Chr05 NC_080391.1:3220261-3220271promoter 内 1400-1410 bp - 2591 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 3212662-3217670(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGG
SmilChr01G003323 Chr01 NC_080387.1:51933144-51933154promoter 内 1394-1404 bp + 2597 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 51929249-51930547(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTC
SmilChr05G004035 Chr05 NC_080391.1:54323489-54323499promoter 内 1343-1353 bp + 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54319682-54320841(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr02G005474 Chr02 NC_080388.1:74988007-74988017promoter 内 1340-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 74990668-74992966(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCC
SmilChr02G003562 Chr02 NC_080388.1:56797635-56797645promoter 内 1247-1257 bp + 2744 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56800389-56800970(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr06G001196 Chr06 NC_080392.1:12241457-12241467promoter 内 1131-1141 bp - 2860 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12234292-12238597(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACG
SmilChr02G004483 Chr02 NC_080388.1:67300099-67300109promoter 内 1123-1133 bp + 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 67302977-67307054(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACG
SmilChr04G002929 Chr04 NC_080390.1:45561654-45561664promoter 内 1105-1115 bp - 2886 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45564550-45565728(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr05G002867 Chr05 NC_080391.1:34275779-34275789promoter 内 1097-1107 bp + 2894 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 34266991-34272885(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr02G003062 Chr02 NC_080388.1:51454783-51454793promoter 内 1080-1090 bp - 2911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 51457704-51459502(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTG
SmilChr05G003435 Chr05 NC_080391.1:45678441-45678451promoter 内 997-1007 bp - 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45674089-45675447(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr04G000755 Chr04 NC_080390.1:9239150-9239160promoter 内 984-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 9242167-9242768(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCC
SmilChr01G000390 Chr01 NC_080387.1:8042746-8042756promoter 内 926-936 bp + 3065 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8037282-8039681(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGGA
SmilChr03G001297 Chr03 NC_080389.1:15168810-15168820promoter 内 906-916 bp + 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15161753-15165725(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCC
SmilChr08G001386 Chr08 NC_080394.1:11075660-11075670promoter 内 864-874 bp - 3127 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 11071176-11072533(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGA
SmilChr02G003125 Chr02 NC_080388.1:52250846-52250856promoter 内 860-870 bp + 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 52244355-52247715(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTG
SmilChr05G004034 Chr05 NC_080391.1:54319763-54319773promoter 内 820-830 bp + 3171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54311911-54316592(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr05G001776 Chr05 NC_080391.1:17468616-17468626promoter 内 810-820 bp - 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 17471807-17476271(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCC
SmilChr08G003717 Chr08 NC_080394.1:41815166-41815176promoter 内 784-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 41818383-41823889(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr06G002805 Chr06 NC_080392.1:40750637-40750647promoter 内 676-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40753962-40756231(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCC
SmilChr02G001653 Chr02 NC_080388.1:30691850-30691860promoter 内 600-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 30686091-30688459(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr08G000143 Chr08 NC_080394.1:918205-918215promoter 内 594-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 921612-958452(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr01G002294 Chr01 NC_080387.1:39780369-39780379promoter 内 590-600 bp - 3401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 39776189-39776968(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCA
SmilChr04G003256 Chr04 NC_080390.1:49304249-49304259promoter 内 565-575 bp - 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 49299723-49300823(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGA
SmilChr02G002479 Chr02 NC_080388.1:43171165-43171175promoter 内 550-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43174616-43177389(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr04G002762 Chr04 NC_080390.1:43373303-43373313promoter 内 514-524 bp - 3477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 43368473-43369826(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr01G000117 Chr01 NC_080387.1:2035656-2035666promoter 内 401-411 bp - 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2031059-2032066(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGA
SmilChr08G000585 Chr08 NC_080394.1:4339873-4339883promoter 内 374-384 bp + 3617 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4334943-4336256(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGTC
SmilChr03G002385 Chr03 NC_080389.1:37776528-37776538promoter 内 304-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 37770658-37772841(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAACC
SmilChr03G001065 Chr03 NC_080389.1:12371735-12371745promoter 内 298-308 bp + 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 12365522-12368042(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCGCTGAGCA
SmilChr05G001165 Chr05 NC_080391.1:9791888-9791898promoter 内 297-307 bp - 3694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 9774259-9788194(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCGTT
SmilChr04G004145 Chr04 NC_080390.1:56196782-56196792promoter 内 264-274 bp - 3727 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56200519-56201929(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGGCTGAGCC
SmilChr04G002991 Chr04 NC_080390.1:46337483-46337493promoter 内 253-263 bp - 3738 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 46341231-46342816(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAGTG
SmilChr01G001243 Chr01 NC_080387.1:24938043-24938053promoter 内 249-259 bp - 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 24933517-24934301(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGA
SmilChr07G004423 Chr07 NC_080393.1:56833140-56833150promoter 内 249-259 bp + 3742 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56836892-56837676(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGA
SmilChr07G004251 Chr07 NC_080393.1:54958162-54958172promoter 内 190-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 54951126-54954361(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr01G000248 Chr01 NC_080387.1:4674515-4674525promoter 内 169-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 4670000-4670693(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr06G000041 Chr06 NC_080392.1:345301-345311promoter 内 141-151 bp + 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 349161-350093(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr06G002295 Chr06 NC_080392.1:33120306-33120316promoter 内 138-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 33112541-33116453(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTGCTGAGCC
SmilChr05G000458 Chr05 NC_080391.1:3460859-3460869promoter 内 123-133 bp + 3868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 3464737-3470105(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACG
SmilChr05G003457 Chr05 NC_080391.1:46005784-46005794promoter 内 87-97 bp + 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 45999310-46001880(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCGGCTGAGCC
SmilChr02G001057 Chr02 NC_080388.1:18821945-18821955promoter 内 84-94 bp + 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 18825862-18827670(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGG
SmilChr05G002432 Chr05 NC_080391.1:26813190-26813200promoter 内 38-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 26817153-26822829(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCC
SmilChr07G003411 Chr07 NC_080393.1:37157615-37157625promoter 内 37-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 37150900-37153661(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGG
SmilChr07G000757 Chr07 NC_080393.1:5323520-5323530promoter 内 24-34 bp + 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 5327497-5328980(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACG
SmilChr05G002686 Chr05 NC_080391.1:30486023-30486033promoter 内 17-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 30490007-30495337(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCA
SmilChr05G000379 Chr05 NC_080391.1:2852469-2852479promoter 内 3262-3272 bp - 729 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 2849224-2851740(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCACAGCGCG
SmilChr03G002699 Chr03 NC_080389.1:42966339-42966349promoter 内 2075-2085 bp + 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 42956058-42964423(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGACGC
SmilChr03G003882 Chr03 NC_080389.1:57901054-57901064promoter 内 1722-1732 bp + 2269 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 2 57903333-57906932(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGTCAGCGCG