转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 37 / 139 下载 TSV

上一页 37 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000939 Chr01 NC_080387.1:19891575-19891586promoter 内 3740-3751 bp - 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 19891836-19895713(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAACT
SmilChr02G003081 Chr02 NC_080388.1:51734172-51734183promoter 内 3654-3665 bp + 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 51733764-51733836(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGCT
SmilChr03G002497 Chr03 NC_080389.1:39760696-39760707promoter 内 3586-3597 bp + 404 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39758229-39760292(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGCC
SmilChr01G003485 Chr01 NC_080387.1:53417676-53417687promoter 内 3306-3317 bp + 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 53414664-53416992(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGGAA
SmilChr03G004386 Chr03 NC_080389.1:62066430-62066441promoter 内 3217-3228 bp - 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 62067214-62071808(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGCC
SmilChr02G004169 Chr02 NC_080388.1:63997370-63997381promoter 内 3173-3184 bp + 817 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 63990485-63996553(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGA
SmilChr02G004799 Chr02 NC_080388.1:70196644-70196655promoter 内 3135-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70188690-70195789(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGCT
SmilChr04G003559 Chr04 NC_080390.1:51967780-51967791promoter 内 3115-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 51968666-51970301(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TTCCGACGTGGG
SmilChr01G005132 Chr01 NC_080387.1:69113837-69113848promoter 内 3088-3099 bp + 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 69112292-69112935(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTCGC
SmilChr02G000021 Chr02 NC_080388.1:167676-167687promoter 内 2907-2918 bp + 1083 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 162502-166593(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGCT
SmilChr01G005306 Chr01 NC_080387.1:70323519-70323530promoter 内 2737-2748 bp + 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70324783-70325698(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGAC
SmilChr04G002642 Chr04 NC_080390.1:41803390-41803401promoter 内 2679-2690 bp + 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 41804712-41806406(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGAGACGTGGC
SmilChr03G003725 Chr03 NC_080389.1:56267849-56267860promoter 内 2627-2638 bp + 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 56269223-56269672(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATCACGTGGC
SmilChr04G004079 Chr04 NC_080390.1:55856105-55856116promoter 内 2551-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 55848981-55854666(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGATCACGTGGC
SmilChr01G002479 Chr01 NC_080387.1:42531406-42531417promoter 内 2441-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 42529408-42529857(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGA
SmilChr04G003558 Chr04 NC_080390.1:51967780-51967791promoter 内 2407-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 51959817-51966197(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGGAA
SmilChr04G001975 Chr04 NC_080390.1:32005368-32005379promoter 内 2390-2401 bp + 1600 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32002398-32003768(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGATCT
SmilChr05G000160 Chr05 NC_080391.1:1315339-1315350promoter 内 2373-2384 bp + 1617 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 1277552-1313722(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGACGTCAGCC
SmilChr01G001580 Chr01 NC_080387.1:29816994-29817005promoter 内 2324-2335 bp + 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 29813831-29815328(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr02G001927 Chr02 NC_080388.1:34681489-34681500promoter 内 2323-2334 bp - 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34683167-34686374(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGACGTCAGCC
SmilChr02G001926 Chr02 NC_080388.1:34681489-34681500promoter 内 2223-2234 bp - 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 34678675-34679722(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGTCGT
SmilChr03G004042 Chr03 NC_080389.1:59424176-59424187promoter 内 1958-1969 bp - 2032 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 59419441-59422144(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCTGACGTGTC
SmilChr04G003589 Chr04 NC_080390.1:52324505-52324516promoter 内 1936-1947 bp - 2054 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 52321623-52322451(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTCGA
SmilChr02G002542 Chr02 NC_080388.1:44278089-44278100promoter 内 1868-1879 bp + 2122 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 44280222-44282103(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCCGACGTGGC
SmilChr01G005505 Chr01 NC_080387.1:71910679-71910690promoter 内 1785-1796 bp + 2205 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 71906613-71908474(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr03G001834 Chr03 NC_080389.1:25180032-25180043promoter 内 1725-1736 bp + 2265 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 25176699-25177767(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTCACGTCAGCT
SmilChr03G002496 Chr03 NC_080389.1:39760696-39760707promoter 内 1515-1526 bp + 2475 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39757655-39758221(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCGACGTCAGCC
SmilChr03G002572 Chr03 NC_080389.1:40901834-40901845promoter 内 1479-1490 bp - 2511 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 40904356-40905561(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTCGC
SmilChr02G003119 Chr02 NC_080388.1:52214696-52214707promoter 内 1296-1307 bp + 2694 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 52210869-52212002(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTCGC
SmilChr04G002640 Chr04 NC_080390.1:41803390-41803401promoter 内 1176-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 41799818-41800576(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTCGC
SmilChr03G003294 Chr03 NC_080389.1:51041932-51041943promoter 内 1172-1183 bp - 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 51044761-51045769(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCTCGC
SmilChr01G001778 Chr01 NC_080387.1:32663789-32663800promoter 内 1118-1129 bp + 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32666672-32668220(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCCGACGTGGA
SmilChr03G004007 Chr03 NC_080389.1:59081648-59081659promoter 内 1117-1128 bp + 2873 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 59084532-59085631(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTCGA
SmilChr02G002541 Chr02 NC_080388.1:44278089-44278100promoter 内 781-792 bp + 3209 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 44263095-44274880(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr03G001038 Chr03 NC_080389.1:12103053-12103064promoter 内 695-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 12106359-12111740(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCCGACGTGGC
SmilChr01G001776 Chr01 NC_080387.1:32663789-32663800promoter 内 679-690 bp + 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 32659813-32660478(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGGGA
SmilChr04G002505 Chr04 NC_080390.1:40006321-40006332promoter 内 571-582 bp - 3419 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 40009751-40009831(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr04G002478 Chr04 NC_080390.1:39615130-39615141promoter 内 534-545 bp - 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 39618597-39618677(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr02G003703 Chr02 NC_080388.1:58494652-58494663promoter 内 216-227 bp - 3774 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 58498437-58502230(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAACT
SmilChr01G005307 Chr01 NC_080387.1:70323519-70323530promoter 内 200-211 bp + 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 1 70327320-70334092(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGAC
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SmilChr04G001600 Chr04 NC_080390.1:26683276-26683287promoter 内 1449-1460 bp + 2541 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 5 26676919-26680735(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
SmilChr05G000114 Chr05 NC_080391.1:802887-802898promoter 内 3626-3637 bp + 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 803262-807079(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AAGTGACGTGGC
SmilChr02G004842 Chr02 NC_080388.1:70546031-70546042promoter 内 3194-3205 bp - 796 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 70546838-70550264(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCATTG
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SmilChr02G004914 Chr02 NC_080388.1:71125206-71125217promoter 内 2900-2911 bp - 1090 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 71126307-71126386(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACGA
SmilChr03G004107 Chr03 NC_080389.1:59967138-59967149promoter 内 2621-2632 bp - 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 59968518-59972315(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCAATG
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SmilChr02G004915 Chr02 NC_080388.1:71125206-71125217promoter 内 1920-1931 bp - 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 4 71127287-71131478(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCACGA