转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 38 / 135 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005013 Chr01 NC_080387.1:68147290-68147304promoter 内 1472-1486 bp - 2515 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 68141937-68144775(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTCACCTTATCTTT
SmilChr02G004427 Chr02 NC_080388.1:66597602-66597616promoter 内 1416-1430 bp + 2571 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 66600187-66603106(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTTCCCTTATCTTC
SmilChr01G001268 Chr01 NC_080387.1:25353256-25353270promoter 内 1326-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 25355931-25363173(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGATCATT
SmilChr01G000102 Chr01 NC_080387.1:1824214-1824228promoter 内 1264-1278 bp + 2723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 1821385-1821491(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAATGTTTGG
SmilChr01G003614 Chr01 NC_080387.1:54679033-54679047promoter 内 1254-1268 bp + 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 54681780-54685540(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTTTCTTATCCTT
SmilChr02G003521 Chr02 NC_080388.1:56386981-56386995promoter 内 1152-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 56382676-56384146(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGATTCT
SmilChr02G002519 Chr02 NC_080388.1:43737452-43737466promoter 内 1030-1044 bp + 2957 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 43728294-43734495(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGATCGT
SmilChr02G002991 Chr02 NC_080388.1:50580544-50580558promoter 内 997-1011 bp - 2990 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 50574042-50577554(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTTTCTTATCCTT
SmilChr01G003459 Chr01 NC_080387.1:53163619-53163633promoter 内 920-934 bp - 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 53157546-53160552(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGTTGCCTTATCCAC
SmilChr03G001207 Chr03 NC_080389.1:13925403-13925417promoter 内 903-917 bp - 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 13919951-13922319(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACTTCCTTATCTTT
SmilChr02G002804 Chr02 NC_080388.1:48110822-48110836promoter 内 843-857 bp + 3144 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 48113980-48115436(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTTCTTATCCTT
SmilChr02G000512 Chr02 NC_080388.1:7082553-7082567promoter 内 824-838 bp - 3163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 7076226-7079390(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGTAGCCTTATCTAC
SmilChr03G000060 Chr03 NC_080389.1:666391-666405promoter 内 701-715 bp + 3286 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 669691-771622(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACGTTCTTATCCTT
SmilChr02G004392 Chr02 NC_080388.1:66269381-66269395promoter 内 676-690 bp - 3311 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 66261374-66266070(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATATCTTATCCAT
SmilChr02G002526 Chr02 NC_080388.1:43950337-43950351promoter 内 533-547 bp - 3454 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 43953805-43955960(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGGGTTTG
SmilChr02G000362 Chr02 NC_080388.1:4660250-4660264promoter 内 476-490 bp + 3511 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 4652574-4656739(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTGATAAGGTATAT
SmilChr01G004637 Chr01 NC_080387.1:64403447-64403461promoter 内 372-386 bp + 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 64397448-64399832(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATATTT
SmilChr03G000497 Chr03 NC_080389.1:5313000-5313014promoter 内 372-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 5316629-5320251(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAATGTTAAC
SmilChr01G004229 Chr01 NC_080387.1:60669820-60669834promoter 内 315-329 bp + 3672 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 60673506-60674711(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CGTCCCCTTATCCAC
SmilChr03G000495 Chr03 NC_080389.1:5313000-5313014promoter 内 283-297 bp - 3704 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 5308165-5309296(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTTAACATTATCCTT
SmilChr02G000846 Chr02 NC_080388.1:14373938-14373952promoter 内 230-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 14366159-14370181(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTTCCTTATCTGC
SmilChr02G000247 Chr02 NC_080388.1:3204206-3204220promoter 内 204-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 3198029-3200423(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAAGTT
SmilChr02G002253 Chr02 NC_080388.1:39972732-39972746promoter 内 200-214 bp + 3787 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 39965687-39968945(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGAAAAGA
SmilChr03G001193 Chr03 NC_080389.1:13746540-13746554promoter 内 194-208 bp + 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 13750347-13751267(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCCTTCTTATCCTA
SmilChr01G001213 Chr01 NC_080387.1:24347157-24347171promoter 内 132-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 24351026-24356447(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTACACCTTATCTTT
SmilChr01G006061 Chr01 NC_080387.1:76056708-76056722promoter 内 12-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 76048442-76052733(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGGACCGC
SmilChr02G003430 Chr02 NC_080388.1:55520244-55520258promoter 内 12-26 bp + 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 55524233-55529275(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTACACCTTATCCGA
SmilChr01G000560 Chr01 NC_080387.1:11658524-11658538promoter 内 3788-3802 bp + 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 5 11649337-11658325(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATGATAAGGATAAC
SmilChr01G004075 Chr01 NC_080387.1:59194768-59194782promoter 内 2860-2874 bp - 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 59195909-59201102(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGATAAGAATAAA
SmilChr02G001572 Chr02 NC_080388.1:29145549-29145563promoter 内 1165-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 29148385-29153062(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTCTTCTTATCCAT
SmilChr01G005000 Chr01 NC_080387.1:68045774-68045788promoter 内 281-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 4 68049494-68051092(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGATAAGAATAAA
SmilChr03G000148 Chr03 NC_080389.1:1621644-1621658promoter 内 3708-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 1621937-1625847(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGAGTTGG
SmilChr03G000933 Chr03 NC_080389.1:10635628-10635642promoter 内 3392-3406 bp + 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 10631938-10635033(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAGGCG
SmilChr02G002178 Chr02 NC_080388.1:39007244-39007258promoter 内 3186-3200 bp + 801 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 39003123-39006443(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGATATTT
SmilChr02G004495 Chr02 NC_080388.1:67448414-67448428promoter 内 2996-3010 bp - 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 67449419-67455324(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAATGTTATA
SmilChr01G002450 Chr01 NC_080387.1:42093142-42093156promoter 内 1823-1837 bp + 2164 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 42095320-42108801(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATCTCCTTATCCCT
SmilChr03G000032 Chr03 NC_080389.1:405622-405636promoter 内 777-791 bp + 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 399639-402412(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGGAACCT
SmilChr02G000357 Chr02 NC_080388.1:4606493-4606507promoter 内 597-611 bp - 3390 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 4601080-4603103(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGATTCCTTATCCGC
SmilChr01G000746 Chr01 NC_080387.1:16506568-16506582promoter 内 526-540 bp - 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 16510043-16513220(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGGTATTC
SmilChr02G000239 Chr02 NC_080388.1:3103694-3103708promoter 内 107-121 bp + 3880 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 3 3099708-3099814(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATGATAAGGAGTAG
SmilChr02G000161 Chr02 NC_080388.1:2110401-2110415promoter 内 3929-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 2107167-2110343(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAAATCCTTATCATA
SmilChr01G001345 Chr01 NC_080387.1:26705394-26705408promoter 内 3827-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 26705568-26708801(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGAAAAGA
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SmilChr02G004842 Chr02 NC_080388.1:70546179-70546193promoter 内 3342-3356 bp + 645 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 70546838-70550264(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTTCTTATCCAT
SmilChr01G002228 Chr01 NC_080387.1:38750503-38750517promoter 内 3117-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 38746336-38749633(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTATTCTTATCCCA
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SmilChr03G001318 Chr03 NC_080389.1:15454962-15454976promoter 内 2616-2630 bp - 1371 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 15452950-15453591(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACACACCTTATCTAT
SmilChr01G005787 Chr01 NC_080387.1:73951533-73951547promoter 内 2506-2520 bp + 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 73953028-73956878(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTTCTTATCCAT
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46057895-46057909promoter 内 2433-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 46051009-46056341(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCGGATAAGGTTAGT
SmilChr03G001280 Chr03 NC_080389.1:14986823-14986837promoter 内 2347-2361 bp + 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.2/ 100 2 14981267-14985183(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAATGTAGGT