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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 38 / 121 下载 TSV

上一页 38 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G004465 Chr03 NC_080389.1:62721138-62721152promoter 内 2269-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 62715292-62719420(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTAAAATC
SmilChr01G005617 Chr01 NC_080387.1:72678261-72678275promoter 内 2187-2201 bp - 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72673286-72676461(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTACCTAGATCTGGG
SmilChr02G003482 Chr02 NC_080388.1:56097424-56097438promoter 内 2036-2050 bp - 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56095078-56095473(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATATTGGATCTGAA
SmilChr03G002772 Chr03 NC_080389.1:44116597-44116611promoter 内 1967-1981 bp + 2020 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 44118631-44121461(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGCACTAGATCTCAT
SmilChr03G003050 Chr03 NC_080389.1:47400100-47400114promoter 内 1910-1924 bp - 2077 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 47393487-47398023(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAGTTGAGATCTGGG
SmilChr01G003736 Chr01 NC_080387.1:55669612-55669626promoter 内 1780-1794 bp - 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 55671833-55675978(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAAGATCTAGATTT
SmilChr03G001787 Chr03 NC_080389.1:24423397-24423411promoter 内 1673-1687 bp - 2314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24420571-24421083(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATTTTAGATCTGTG
SmilChr04G000568 Chr04 NC_080390.1:6330563-6330577promoter 内 1621-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6332943-6351259(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATTGCAGATCTGCG
SmilChr02G002948 Chr02 NC_080388.1:50011512-50011526promoter 内 1601-1615 bp - 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50013912-50014415(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACCAGATCTAATTTA
SmilChr02G005446 Chr02 NC_080388.1:74824770-74824784promoter 内 1577-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74827194-74828545(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATGACAGATCTGAG
SmilChr01G004898 Chr01 NC_080387.1:67055324-67055338promoter 内 1564-1578 bp - 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 67049549-67052901(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AATATTAGATCTGAT
SmilChr05G001138 Chr05 NC_080391.1:9508582-9508596promoter 内 1547-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9503830-9506142(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCACTAGATCTGGA
SmilChr05G000396 Chr05 NC_080391.1:2978080-2978094promoter 内 1542-1556 bp - 2445 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 2980539-2987090(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCAACTCG
SmilChr02G001830 Chr02 NC_080388.1:33318641-33318655promoter 内 1373-1387 bp - 2614 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 33311729-33316027(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAATCTAGATCTTAT
SmilChr02G004720 Chr02 NC_080388.1:69455546-69455560promoter 内 1340-1354 bp + 2647 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 69449774-69452899(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTATAATT
SmilChr03G000706 Chr03 NC_080389.1:7859009-7859023promoter 内 1247-1261 bp - 2740 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7861763-7864719(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCTAATTTG
SmilChr03G001028 Chr03 NC_080389.1:12003541-12003555promoter 内 1202-1216 bp - 2785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12006340-12007381(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCATTTTT
SmilChr01G003174 Chr01 NC_080387.1:50542908-50542922promoter 内 1146-1160 bp + 2841 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50545763-50553870(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGAGACAGATCTGAT
SmilChr04G002492 Chr04 NC_080390.1:39815998-39816012promoter 内 889-903 bp + 3098 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 39811475-39812900(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGCAGATCTGGCTGC
SmilChr02G002626 Chr02 NC_080388.1:45599341-45599355promoter 内 842-856 bp + 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45602500-45611229(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAACTAGATCTATG
SmilChr01G003944 Chr01 NC_080387.1:57768144-57768158promoter 内 841-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57771304-57775906(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CATAGATCTAGTTCT
SmilChr03G001785 Chr03 NC_080389.1:24423397-24423411promoter 内 805-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24417664-24420215(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATTTTAGATCTGTG
SmilChr01G003462 Chr01 NC_080387.1:53200599-53200613promoter 内 757-771 bp + 3230 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53203843-53208512(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CAAATTAGATCTGAT
SmilChr01G002136 Chr01 NC_080387.1:37341059-37341073promoter 内 621-635 bp - 3366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 37344439-37346896(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATAAGATCTAGATTT
SmilChr02G002625 Chr02 NC_080388.1:45599341-45599355promoter 内 610-624 bp + 3377 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45591927-45595964(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CATAGATCTAGTTCT
SmilChr03G001784 Chr03 NC_080389.1:24418723-24418737promoter 内 603-617 bp - 3384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24405198-24415339(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATTTTAGATCTGTG
SmilChr03G001206 Chr03 NC_080389.1:13912324-13912338promoter 内 602-616 bp + 3385 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13915723-13917553(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACATGCAGATCTGTG
SmilChr01G000545 Chr01 NC_080387.1:11259621-11259635promoter 内 544-558 bp + 3443 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 11263078-11263679(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCCACCAGATCTGTG
SmilChr02G000947 Chr02 NC_080388.1:16487182-16487196promoter 内 481-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16490702-16496248(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAATCTAGATCTTAT
SmilChr01G003207 Chr01 NC_080387.1:50853187-50853201promoter 内 355-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 50856833-50858826(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CATAGATCTAGTTCT
SmilChr01G003943 Chr01 NC_080387.1:57768144-57768158promoter 内 350-364 bp - 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 57763782-57764507(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAACTAGATCTATG
SmilChr01G000476 Chr01 NC_080387.1:9704175-9704189promoter 内 321-335 bp + 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9707855-9708570(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAACTAGATCTATG
SmilChr02G001121 Chr02 NC_080388.1:20212631-20212645promoter 内 256-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20206755-20208900(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCAGCACA
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SmilChr03G001790 Chr03 NC_080389.1:24423397-24423411promoter 内 116-130 bp - 3871 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24427282-24429690(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTAAAATC
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SmilChr04G003666 Chr04 NC_080390.1:53103407-53103421promoter 内 3882-3896 bp + 105 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 53100117-53103302(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGCAGATCTGGGCCG
SmilChr02G002486 Chr02 NC_080388.1:43281388-43281402promoter 内 2741-2755 bp - 1246 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 43282648-43284698(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCAGATCTGTATGT
SmilChr04G003119 Chr04 NC_080390.1:47755559-47755573promoter 内 2739-2753 bp - 1248 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 47756821-47758790(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCCACGCCC
SmilChr05G000818 Chr05 NC_080391.1:6417962-6417976promoter 内 2358-2372 bp - 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 6408083-6416333(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGAACTAGATCTCAT
SmilChr02G004591 Chr02 NC_080388.1:68421067-68421081promoter 内 2280-2294 bp + 1707 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 68405219-68419360(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TCTAGATCTAAAACC
SmilChr01G000884 Chr01 NC_080387.1:18821961-18821975promoter 内 1106-1120 bp - 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 18818467-18819080(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AAAAATAGATCTGGT
SmilChr05G000928 Chr05 NC_080391.1:7417469-7417483promoter 内 913-927 bp - 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 7420557-7422392(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTAGGGTT
SmilChr02G002439 Chr02 NC_080388.1:42593387-42593401promoter 内 873-887 bp - 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 42596515-42599981(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCTGGTCAG
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SmilChr03G000279 Chr03 NC_080389.1:3173801-3173815promoter 内 3879-3893 bp + 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 3171369-3173693(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTTAGATCTAGTCCC