转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 4 / 151 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000674 Chr01 NC_080387.1:14949993-14950005promoter 内 2749-2761 bp + 1240 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 4 14946348-14948753(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGAGGTAGGTGAG
SmilChr01G000403 Chr01 NC_080387.1:8232578-8232590promoter 内 2776-2788 bp + 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 8228936-8231365(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGAGGTAGGTGAG
SmilChr04G002901 Chr04 NC_080390.1:45275834-45275846promoter 内 3917-3929 bp + 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 45275918-45278874(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr03G000911 Chr03 NC_080389.1:10432606-10432618promoter 内 3480-3492 bp + 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 10433127-10435931(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCACC
SmilChr03G001025 Chr03 NC_080389.1:11913634-11913646promoter 内 2170-2182 bp - 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 11910604-11911815(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr01G006198 Chr01 NC_080387.1:77659789-77659801promoter 内 1786-1798 bp + 2203 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 77662004-77666613(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCTAT
SmilChr04G001204 Chr04 NC_080390.1:18594737-18594749promoter 内 1622-1634 bp + 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 18589429-18592370(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTGGA
SmilChr01G001091 Chr01 NC_080387.1:22360925-22360937promoter 内 1505-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 22363421-22371155(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGAGGTAGGTGAG
SmilChr04G001153 Chr04 NC_080390.1:17003173-17003185promoter 内 1440-1452 bp + 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 17005734-17013027(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTCG
SmilChr01G001016 Chr01 NC_080387.1:21332409-21332421promoter 内 1436-1448 bp + 2553 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 21322126-21329856(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGAGGTAGGTGAG
SmilChr02G002042 Chr02 NC_080388.1:36781554-36781566promoter 内 693-705 bp + 3296 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 36773289-36778258(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTGGA
SmilChr02G004162 Chr02 NC_080388.1:63954841-63954853promoter 内 659-671 bp - 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 63947914-63951511(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr01G000364 Chr01 NC_080387.1:7535352-7535364promoter 内 306-318 bp + 3683 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 7539047-7539838(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr04G003073 Chr04 NC_080390.1:47295833-47295845promoter 内 299-311 bp - 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 47288630-47292143(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr01G003433 Chr01 NC_080387.1:52961544-52961556promoter 内 186-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 52954056-52957741(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTAGA
SmilChr02G001378 Chr02 NC_080388.1:26061616-26061628promoter 内 3241-3253 bp + 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 26062376-26064595(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCACC
SmilChr02G003507 Chr02 NC_080388.1:56250902-56250914promoter 内 3157-3169 bp - 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 56251746-56264745(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGGG
SmilChr02G003559 Chr02 NC_080388.1:56753842-56753854promoter 内 3141-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 56754702-56767587(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGGG
SmilChr01G004034 Chr01 NC_080387.1:58769525-58769537promoter 内 3029-3041 bp + 960 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 58770497-58773294(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr02G005316 Chr02 NC_080388.1:74048374-74048386promoter 内 2940-2952 bp - 1049 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 74044426-74047325(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCTTG
SmilChr03G004599 Chr03 NC_080389.1:63790022-63790034promoter 内 2706-2718 bp - 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 63786949-63788739(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCAAT
SmilChr01G004272 Chr01 NC_080387.1:60963627-60963639promoter 内 2335-2347 bp + 1654 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 60965293-60968483(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCAC
SmilChr04G003840 Chr04 NC_080390.1:54423460-54423472promoter 内 2301-2313 bp - 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 54425160-54432024(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTGGA
SmilChr05G001235 Chr05 NC_080391.1:10466370-10466382promoter 内 2280-2292 bp - 1709 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 10468091-10474523(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGAG
SmilChr04G004146 Chr04 NC_080390.1:56204889-56204901promoter 内 2192-2204 bp - 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 56201896-56203092(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCAAT
SmilChr04G004148 Chr04 NC_080390.1:56204889-56204901promoter 内 1702-1714 bp - 2287 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 56207188-56209220(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTGAG
SmilChr01G005024 Chr01 NC_080387.1:68214471-68214483promoter 内 1648-1660 bp - 2341 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 68208685-68212130(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCTTG
SmilChr01G000932 Chr01 NC_080387.1:19758123-19758135promoter 内 119-131 bp + 3870 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 19762005-19765392(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCACC
SmilChr04G003478 Chr04 NC_080390.1:51242429-51242441promoter 内 14-26 bp - 3975 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 51246416-51246990(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTGGGTAGGTGGG
SmilChr01G003227 Chr01 NC_080387.1:51044091-51044103promoter 内 1154-1166 bp + 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 4 51039238-51041256(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTGAC
SmilChr04G004060 Chr04 NC_080390.1:55750851-55750863promoter 内 2669-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 55745870-55749531(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTAC
SmilChr03G001530 Chr03 NC_080389.1:19114987-19114999promoter 内 1767-1779 bp - 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 19111906-19112765(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTAC
SmilChr03G001531 Chr03 NC_080389.1:19119622-19119634promoter 内 1767-1779 bp - 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 19116541-19117400(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTAC
SmilChr02G004093 Chr02 NC_080388.1:63222299-63222311promoter 内 1556-1568 bp + 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 3 63216526-63219866(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTGGC
SmilChr04G000009 Chr04 NC_080390.1:148625-148637promoter 内 3189-3201 bp - 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 149437-150968(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGGGGTAGGTAGG
SmilChr04G001614 Chr04 NC_080390.1:26887753-26887765promoter 内 3136-3148 bp + 853 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 26862887-26886900(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAGGTAGGTGGA
SmilChr02G004029 Chr02 NC_080388.1:62576939-62576951promoter 内 3091-3103 bp - 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 62571706-62576041(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTAC
SmilChr05G000885 Chr05 NC_080391.1:7003893-7003905promoter 内 2087-2099 bp + 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 7005807-7007797(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCCCA
SmilChr03G000170 Chr03 NC_080389.1:1867844-1867856promoter 内 1931-1943 bp - 2058 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 1869914-1872256(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGGGGTAGGTGGG
SmilChr05G000946 Chr05 NC_080391.1:7646202-7646214promoter 内 1752-1764 bp + 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 7648451-7650064(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCCCA
SmilChr01G003540 Chr01 NC_080387.1:54000081-54000093promoter 内 1207-1219 bp - 2782 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 53997176-53997299(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCCCT
SmilChr02G000486 Chr02 NC_080388.1:6627143-6627155promoter 内 1176-1188 bp + 2813 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 6629968-6632943(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTAC
SmilChr01G003539 Chr01 NC_080387.1:54000081-54000093promoter 内 984-996 bp - 3005 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 53996979-53997076(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCCCT
SmilChr01G003538 Chr01 NC_080387.1:54000081-54000093promoter 内 832-844 bp - 3157 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 2 53996803-53996924(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCCCT
SmilChr03G004008 Chr03 NC_080389.1:59086973-59086985promoter 内 3851-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 59087123-59088281(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAGGTAGGTGGA
SmilChr04G002787 Chr04 NC_080390.1:43730603-43730615promoter 内 3579-3591 bp - 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 43725659-43730193(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCAAT
SmilChr04G000505 Chr04 NC_080390.1:5510603-5510615promoter 内 3333-3345 bp - 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 5511271-5516428(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTGGC
SmilChr02G000151 Chr02 NC_080388.1:1991746-1991758promoter 内 3196-3208 bp + 793 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 1992551-1995058(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTCC
SmilChr01G002351 Chr01 NC_080387.1:40650332-40650344promoter 内 3153-3165 bp + 836 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 40644255-40649496(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTGAC
SmilChr02G000071 Chr02 NC_080388.1:900873-900885promoter 内 2994-3006 bp - 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.7/ 100 1 897628-899878(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCTCC