转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 42 / 143 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G003030 Chr05 NC_080391.1:37913390-37913401promoter 内 1365-1376 bp - 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37916026-37918649(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGA
SmilChr03G003963 Chr03 NC_080389.1:58673980-58673991promoter 内 1264-1275 bp - 2726 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 58676717-58685649(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAA
SmilChr07G002914 Chr07 NC_080393.1:29539315-29539326promoter 内 1234-1245 bp + 2756 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 29532505-29536559(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAC
SmilChr03G002368 Chr03 NC_080389.1:37319474-37319485promoter 内 1136-1147 bp + 2854 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37315730-37316620(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAC
SmilChr07G004476 Chr07 NC_080393.1:57313230-57313241promoter 内 1056-1067 bp + 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 57308048-57310296(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAA
SmilChr07G002913 Chr07 NC_080393.1:29529826-29529837promoter 内 991-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 29522730-29526827(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAC
SmilChr07G002915 Chr07 NC_080393.1:29549250-29549261promoter 内 891-902 bp + 3099 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 29541950-29546151(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAC
SmilChr07G004053 Chr07 NC_080393.1:51847335-51847346promoter 内 788-799 bp + 3202 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 51850548-51853059(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGG
SmilChr01G000534 Chr01 NC_080387.1:10861843-10861854promoter 内 682-693 bp + 3308 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 10865162-10868704(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTG
SmilChr07G003114 Chr07 NC_080393.1:33015502-33015513promoter 内 363-374 bp + 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 33019140-33021828(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAGG
SmilChr02G002670 Chr02 NC_080388.1:46277381-46277392promoter 内 326-337 bp - 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46281056-46282147(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAA
SmilChr07G002937 Chr07 NC_080393.1:29744585-29744596promoter 内 185-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 29748401-29752422(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTG
SmilChr03G004523 Chr03 NC_080389.1:63283154-63283165promoter 内 149-160 bp + 3841 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 63287006-63289063(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATG
SmilChr03G000861 Chr03 NC_080389.1:9823557-9823568promoter 内 100-111 bp + 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 9827458-9829853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAA
SmilChr07G002421 Chr07 NC_080393.1:22546395-22546406promoter 内 50-61 bp + 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 22550346-22551014(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTG
SmilChr01G002853 Chr01 NC_080387.1:47124395-47124406promoter 内 3041-3052 bp + 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 4 47120611-47123446(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAA
SmilChr06G000011 Chr06 NC_080392.1:198490-198501promoter 内 3523-3534 bp - 467 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 198968-211177(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr03G003605 Chr03 NC_080389.1:54697697-54697708promoter 内 3140-3151 bp - 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 54698558-54702926(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTAAT
SmilChr06G000993 Chr06 NC_080392.1:9809832-9809843promoter 内 3120-3131 bp - 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 9810713-9813662(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr01G001092 Chr01 NC_080387.1:22375914-22375925promoter 内 2270-2281 bp - 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 22371515-22374194(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCTG
SmilChr07G000291 Chr07 NC_080393.1:1881648-1881659promoter 内 1732-1743 bp - 2258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 1883917-1884622(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCGT
SmilChr03G004524 Chr03 NC_080389.1:63294756-63294767promoter 内 1326-1337 bp + 2664 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 63289198-63292092(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAA
SmilChr07G003609 Chr07 NC_080393.1:42332427-42332438promoter 内 1263-1274 bp - 2727 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 3 42335165-42336310(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAA
SmilChr06G002782 Chr06 NC_080392.1:40501011-40501022promoter 内 3919-3930 bp - 71 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 40501093-40503339(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAA
SmilChr08G001836 Chr08 NC_080394.1:15743579-15743590promoter 内 3570-3581 bp - 420 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 15739813-15743159(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATT
SmilChr08G002728 Chr08 NC_080394.1:26926717-26926728promoter 内 3491-3502 bp + 499 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 26927227-26930078(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTG
SmilChr02G005408 Chr02 NC_080388.1:74591670-74591681promoter 内 3476-3487 bp + 514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 74592195-74595504(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr06G002781 Chr06 NC_080392.1:40501011-40501022promoter 内 3413-3424 bp - 577 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 40499076-40500434(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr02G001169 Chr02 NC_080388.1:21445024-21445035promoter 内 3348-3359 bp + 642 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 21445677-21452087(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCGT
SmilChr01G004539 Chr01 NC_080387.1:63537295-63537306promoter 内 3295-3306 bp + 695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 63538001-63539758(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATG
SmilChr03G003897 Chr03 NC_080389.1:58058079-58058090promoter 内 3200-3211 bp - 790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 58058880-58058953(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAA
SmilChr04G001431 Chr04 NC_080390.1:23345840-23345851promoter 内 3175-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 23343883-23345025(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAG
SmilChr02G003396 Chr02 NC_080388.1:55084346-55084357promoter 内 3174-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 55085173-55089489(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAGC
SmilChr04G002725 Chr04 NC_080390.1:42860514-42860525promoter 内 2994-3005 bp + 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 42853277-42859518(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAA
SmilChr08G003553 Chr08 NC_080394.1:38163653-38163664promoter 内 2940-2951 bp - 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 38164714-38168442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAAG
SmilChr08G000441 Chr08 NC_080394.1:3161137-3161148promoter 内 2862-2873 bp - 1128 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 3159140-3160009(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGT
SmilChr06G002251 Chr06 NC_080392.1:31933507-31933518promoter 内 2456-2467 bp + 1534 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 31929138-31931973(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATAGCTGTCAT
SmilChr05G002191 Chr05 NC_080391.1:23401414-23401425promoter 内 2429-2440 bp + 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 23402986-23409109(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTA
SmilChr02G005283 Chr02 NC_080388.1:73869771-73869782promoter 内 2312-2323 bp - 1678 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 73866389-73868093(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTACAGCTGTT
SmilChr02G001901 Chr02 NC_080388.1:34311015-34311026promoter 内 2207-2218 bp - 1783 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 34308094-34309232(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTGGT
SmilChr02G005418 Chr02 NC_080388.1:74642052-74642063promoter 内 2087-2098 bp + 1903 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 74637606-74640149(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAAA
SmilChr07G001262 Chr07 NC_080393.1:9711453-9711464promoter 内 1887-1898 bp - 2103 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 9707670-9709350(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTA
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SmilChr01G001211 Chr01 NC_080387.1:24340590-24340601promoter 内 1276-1287 bp - 2714 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 24343315-24345554(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGC
SmilChr01G001807 Chr01 NC_080387.1:33006022-33006033promoter 内 1178-1189 bp - 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 32999788-33003210(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTA
SmilChr05G001547 Chr05 NC_080391.1:14167153-14167164promoter 内 1118-1129 bp - 2872 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 14161465-14164281(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGGT
SmilChr02G001716 Chr02 NC_080388.1:31607668-31607679promoter 内 1058-1069 bp - 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 31598685-31604736(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGACAGCTCGT
SmilChr06G000862 Chr06 NC_080392.1:8144546-8144557promoter 内 1041-1052 bp + 2949 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 8147506-8150073(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATG
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SmilChr02G005552 Chr02 NC_080388.1:75492420-75492431promoter 内 862-873 bp - 3128 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 2 75495559-75498044(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGC