转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 42 / 139 下载 TSV

上一页 42 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G003424 Chr03 NC_080389.1:52574877-52574888promoter 内 769-780 bp + 3221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 52560603-52571656(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAACA
SmilChr03G000847 Chr03 NC_080389.1:9664333-9664344promoter 内 753-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9654315-9661096(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr02G004239 Chr02 NC_080388.1:64589403-64589414promoter 内 714-725 bp - 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 64586055-64586127(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr01G005651 Chr01 NC_080387.1:72893706-72893717promoter 内 599-610 bp - 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72889589-72890315(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCACGACGTGGC
SmilChr01G005510 Chr01 NC_080387.1:71947223-71947234promoter 内 516-527 bp + 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71950708-71954175(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGTTGACGTGGA
SmilChr03G004618 Chr03 NC_080389.1:63884637-63884648promoter 内 194-205 bp - 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 63880094-63880841(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGATGACGTGGA
SmilChr01G002305 Chr01 NC_080387.1:39949642-39949653promoter 内 34-45 bp - 3956 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 39941461-39945686(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GAGCGACGTGGC
SmilChr05G000245 Chr05 NC_080391.1:1884200-1884211promoter 内 16-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 1875483-1880226(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCATCA
SmilChr03G002097 Chr03 NC_080389.1:32419519-32419530promoter 内 2488-2499 bp + 1502 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 32421032-32421138(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACACGTGGC
SmilChr02G004756 Chr02 NC_080388.1:69742380-69742391promoter 内 2432-2443 bp - 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 69738659-69740822(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGTC
SmilChr02G003363 Chr02 NC_080388.1:54757103-54757114promoter 内 2361-2372 bp - 1629 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 54753719-54755474(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGTGACGTGAC
SmilChr05G000111 Chr05 NC_080391.1:728862-728873promoter 内 384-395 bp + 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 732479-733183(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGTGACGTGAC
SmilChr02G000440 Chr02 NC_080388.1:5722463-5722474promoter 内 2392-2403 bp - 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5720759-5720865(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACACGTGGC
SmilChr03G004756 Chr03 NC_080389.1:64658233-64658244promoter 内 2391-2402 bp + 1599 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 64659843-64659949(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACACGTGGC
SmilChr03G001952 Chr03 NC_080389.1:27894169-27894180promoter 内 2342-2353 bp + 1648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27895828-27895934(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACACGTGGC
SmilChr04G000295 Chr04 NC_080390.1:2750625-2750636promoter 内 2006-2017 bp - 1984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2752620-2753694(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTGGA
SmilChr03G000460 Chr03 NC_080389.1:4914536-4914547promoter 内 1342-1353 bp - 2648 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4908545-4911888(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGTGACGTGTC
SmilChr04G000294 Chr04 NC_080390.1:2750625-2750636promoter 内 339-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 2738606-2746974(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACACGTGGC
SmilChr02G000709 Chr02 NC_080388.1:11436762-11436773promoter 内 3790-3801 bp - 200 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 11436973-11442426(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTT
SmilChr04G000974 Chr04 NC_080390.1:13064311-13064322promoter 内 3675-3686 bp - 315 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 13064637-13065659(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCGCCA
SmilChr03G002630 Chr03 NC_080389.1:41752228-41752239promoter 内 844-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 4 41755385-41756770(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTT
SmilChr02G001525 Chr02 NC_080388.1:28381023-28381034promoter 内 3932-3943 bp + 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 28381092-28381587(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCAGACGTGGG
SmilChr02G003242 Chr02 NC_080388.1:53699014-53699025promoter 内 3313-3324 bp - 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 53699702-53702986(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCGTCA
SmilChr01G001389 Chr01 NC_080387.1:27298092-27298103promoter 内 2933-2944 bp + 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 27294933-27297035(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTT
SmilChr04G001245 Chr04 NC_080390.1:19581491-19581502promoter 内 1923-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 19583569-19584777(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCAGACGTGGG
SmilChr02G005071 Chr02 NC_080388.1:72372616-72372627promoter 内 1671-1682 bp + 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 72374946-72376675(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGGCGACGTGGT
SmilChr01G002550 Chr01 NC_080387.1:43605729-43605740promoter 内 3978-3989 bp + 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 43605752-43610948(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGCGGC
SmilChr02G003228 Chr02 NC_080388.1:53552763-53552774promoter 内 3674-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 53549063-53552447(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGGA
SmilChr01G001058 Chr01 NC_080387.1:21905063-21905074promoter 内 3416-3427 bp - 574 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 21905648-21907081(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCGCGTCAGCC
SmilChr03G001963 Chr03 NC_080389.1:28129070-28129081promoter 内 3152-3163 bp + 838 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 28123369-28128232(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTT
SmilChr05G000348 Chr05 NC_080391.1:2613977-2613988promoter 内 2972-2983 bp + 1018 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 2615006-2617026(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGGA
SmilChr02G001825 Chr02 NC_080388.1:33284519-33284530promoter 内 2760-2771 bp + 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 33281548-33283289(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTT
SmilChr03G002678 Chr03 NC_080389.1:42535207-42535218promoter 内 2652-2663 bp + 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 42531654-42533869(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCCGCG
SmilChr01G006014 Chr01 NC_080387.1:75728988-75728999promoter 内 1827-1838 bp - 2163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 75731162-75732955(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTT
SmilChr04G000774 Chr04 NC_080390.1:9498694-9498705promoter 内 1797-1808 bp + 2193 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 9494444-9496501(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGGT
SmilChr01G004248 Chr01 NC_080387.1:60786711-60786722promoter 内 1332-1343 bp - 2658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 60783001-60784053(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGGT
SmilChr02G001174 Chr02 NC_080388.1:21547485-21547496promoter 内 1188-1199 bp + 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 21550298-21552936(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGGT
SmilChr02G003916 Chr02 NC_080388.1:61254569-61254580promoter 内 1063-1074 bp + 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 61250076-61251642(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGTCT
SmilChr02G004745 Chr02 NC_080388.1:69659754-69659765promoter 内 696-707 bp + 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 69663059-69666520(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGGA
SmilChr04G001333 Chr04 NC_080390.1:21524214-21524225promoter 内 398-409 bp + 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 21527817-21535119(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGCTGACGCGGC
SmilChr02G001592 Chr02 NC_080388.1:29695553-29695564promoter 内 332-343 bp + 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 29688601-29691895(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTT
SmilChr02G000540 Chr02 NC_080388.1:7432779-7432790promoter 内 281-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 7436499-7439737(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTT
SmilChr02G004278 Chr02 NC_080388.1:64972471-64972482promoter 内 209-220 bp + 3781 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 64976263-64976652(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGGA
SmilChr02G001372 Chr02 NC_080388.1:25968650-25968661promoter 内 12-23 bp + 3978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 25961839-25964672(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCAGTT
SmilChr02G001661 Chr02 NC_080388.1:30836431-30836442promoter 内 3951-3962 bp - 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 30836481-30838937(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGGT
SmilChr03G000845 Chr03 NC_080389.1:9649540-9649551promoter 内 3918-3929 bp - 72 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 9637415-9649468(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACTGACGTGGA
SmilChr01G004529 Chr01 NC_080387.1:63481715-63481726promoter 内 3757-3768 bp + 233 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 63481959-63483387(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ATCTGACGTGGA
SmilChr02G003885 Chr02 NC_080388.1:60917195-60917206promoter 内 3723-3734 bp - 267 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 60917473-60924780(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGAT
SmilChr03G002436 Chr03 NC_080389.1:38686254-38686265promoter 内 3631-3642 bp + 359 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 38684669-38685895(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCCACGTCTGGT
SmilChr01G002468 Chr01 NC_080387.1:42401419-42401430promoter 内 3579-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 1 42401841-42404048(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCAGTT