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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 47 / 148 下载 TSV

上一页 47 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002694 Chr05 NC_080391.1:30681061-30681074promoter 内 3407-3420 bp + 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 30681655-30683720(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTAGCCTCACGTGG
SmilChr05G000580 Chr05 NC_080391.1:4365872-4365885promoter 内 3318-3331 bp + 670 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4366555-4369647(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr04G000096 Chr04 NC_080390.1:871248-871261promoter 内 3313-3326 bp + 675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 871936-875416(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr06G000562 Chr06 NC_080392.1:4800502-4800515promoter 内 3289-3302 bp + 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 4787554-4799803(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr05G002458 Chr05 NC_080391.1:27117309-27117322promoter 内 3242-3255 bp - 746 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27118068-27119384(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr04G002258 Chr04 NC_080390.1:36536040-36536053promoter 内 3092-3105 bp - 896 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 36536949-36540965(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACATACG
SmilChr05G001331 Chr05 NC_080391.1:11604128-11604141promoter 内 3061-3074 bp + 927 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 11601139-11603201(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr08G000906 Chr08 NC_080394.1:6701536-6701549promoter 内 3023-3036 bp + 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6702514-6703481(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGG
SmilChr07G004201 Chr07 NC_080393.1:54092893-54092906promoter 内 3016-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 54090843-54091921(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGG
SmilChr05G002630 Chr05 NC_080391.1:29662794-29662807promoter 内 3013-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 29663782-29665604(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr05G003083 Chr05 NC_080391.1:39019219-39019232promoter 内 3013-3026 bp - 975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 39020207-39022077(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr05G002873 Chr05 NC_080391.1:34403627-34403640promoter 内 3010-3023 bp + 978 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 34404618-34405483(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGG
SmilChr03G001798 Chr03 NC_080389.1:24601799-24601812promoter 内 2969-2982 bp - 1019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 24598375-24600780(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G000476 Chr02 NC_080388.1:6553210-6553223promoter 内 2960-2973 bp - 1028 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 6554251-6560125(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr04G002741 Chr04 NC_080390.1:43075863-43075876promoter 内 2945-2958 bp + 1043 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 43074041-43074820(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr06G002114 Chr06 NC_080392.1:28260562-28260575promoter 内 2941-2954 bp - 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28261622-28263081(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACATT
SmilChr02G003673 Chr02 NC_080388.1:58106271-58106284promoter 内 2862-2875 bp - 1126 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 58104390-58105145(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGG
SmilChr08G000990 Chr08 NC_080394.1:7434682-7434695promoter 内 2861-2874 bp - 1127 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 7432750-7433555(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGAATCACGTGG
SmilChr07G000122 Chr07 NC_080393.1:704805-704818promoter 内 2790-2803 bp - 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 701916-703607(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCCAGGCACGTGG
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SmilChr01G005585 Chr01 NC_080387.1:72536340-72536353promoter 内 2650-2663 bp - 1338 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72537691-72539146(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCGAAC
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SmilChr07G000785 Chr07 NC_080393.1:5523806-5523819promoter 内 2489-2502 bp - 1499 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5525318-5527099(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr03G001377 Chr03 NC_080389.1:16301027-16301040promoter 内 2449-2462 bp + 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 16302579-16304191(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr05G002457 Chr05 NC_080391.1:27117309-27117322promoter 内 2416-2429 bp - 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 27114622-27115737(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr05G002101 Chr05 NC_080391.1:21980991-21981004promoter 内 2386-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 21977822-21979389(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr04G002719 Chr04 NC_080390.1:42822166-42822179promoter 内 2367-2380 bp - 1621 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 42823800-42826927(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATCGCA
SmilChr05G000747 Chr05 NC_080391.1:5766657-5766670promoter 内 2339-2352 bp - 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5761428-5765008(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr03G001382 Chr03 NC_080389.1:16353994-16354007promoter 内 2228-2241 bp + 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 16350583-16352234(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGACCAC
SmilChr02G004999 Chr02 NC_080388.1:71814723-71814736promoter 内 2224-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71810471-71812959(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGGAGCT
SmilChr06G001330 Chr06 NC_080392.1:13807032-13807045promoter 内 2221-2234 bp + 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 13802924-13805265(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr01G000533 Chr01 NC_080387.1:10862964-10862977promoter 内 2216-2229 bp + 1772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 10857613-10861192(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCCATC
SmilChr02G003620 Chr02 NC_080388.1:57498021-57498034promoter 内 2151-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 57494061-57496184(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACCCATC
SmilChr04G000803 Chr04 NC_080390.1:9890805-9890818promoter 内 2128-2141 bp - 1860 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 9892678-9895327(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTCTCC
SmilChr03G001495 Chr03 NC_080389.1:18244272-18244285promoter 内 2121-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 18238920-18242405(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCGAAC
SmilChr08G000390 Chr08 NC_080394.1:2737125-2737138promoter 内 2119-2132 bp + 1869 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 2731599-2735256(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr01G005790 Chr01 NC_080387.1:73993973-73993986promoter 内 2118-2131 bp - 1870 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 73995856-73999624(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGCCCAG
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SmilChr04G001733 Chr04 NC_080390.1:28561275-28561288promoter 内 2035-2048 bp + 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 28563241-28566927(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
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SmilChr01G004891 Chr01 NC_080387.1:66980992-66981005promoter 内 1791-1804 bp + 2197 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 66977992-66978795(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACCACT
SmilChr01G005828 Chr01 NC_080387.1:74275567-74275580promoter 内 1777-1790 bp + 2211 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 74277791-74324746(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGTACACGTGG
SmilChr02G005140 Chr02 NC_080388.1:72821608-72821621promoter 内 1761-1774 bp + 2227 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 72823848-72828130(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGATTCACGTGG
SmilChr01G003792 Chr01 NC_080387.1:56322268-56322281promoter 内 1693-1706 bp - 2295 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 56324576-56332760(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTCTCC
SmilChr06G003182 Chr06 NC_080392.1:44734946-44734959promoter 内 1548-1561 bp + 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 44737399-44741846(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGGAACACGTGG