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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004579; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010264-RA_Salv SmilChr01G004579 MYB XP_057787263.1 MP00132 CTTTTCCAACCACCTTTTC

可能结合的靶基因

9926 个结合位点 7583 个候选靶基因 第 53 / 152 下载 TSV

上一页 53 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001577 Chr03 NC_080389.1:19942786-19942804promoter 内 266-284 bp - 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 19930203-19939069(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TAACCACAACCACCACTTG
SmilChr01G001594 Chr01 NC_080387.1:30005193-30005211promoter 内 227-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 30008967-30010165(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCTCCCCAACCAAAGCCTC
SmilChr02G000358 Chr02 NC_080388.1:4612079-4612097promoter 内 198-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4615882-4618242(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTGGGGTGGTTGGCTCGC
SmilChr03G004726 Chr03 NC_080389.1:64455127-64455145promoter 内 96-114 bp - 3887 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64448037-64451240(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATCCTCAACCACAAAATC
SmilChr02G005480 Chr02 NC_080388.1:75016254-75016272promoter 内 170-188 bp - 3813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 4 75009909-75012441(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCTCCACCACCTCCAC
SmilChr03G003116 Chr03 NC_080389.1:48288090-48288108promoter 内 2679-2697 bp - 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 48289412-48291694(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GGTTGGGTGGTTGCAGTGG
SmilChr03G002386 Chr03 NC_080389.1:37772718-37772736promoter 内 2326-2344 bp + 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 37774393-37777132(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAACTTCAACCACCCACTG
SmilChr05G001012 Chr05 NC_080391.1:8306120-8306138promoter 内 2216-2234 bp + 1767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 3 8302989-8304353(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCCAATGTGGTTGGGTAGG
SmilChr04G001854 Chr04 NC_080390.1:30184416-30184434promoter 内 3729-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 30184688-30186658(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTGTTGGTGGTTGGCAGAA
SmilChr01G004128 Chr01 NC_080387.1:59804845-59804863promoter 内 3666-3684 bp + 317 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 59803567-59804528(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTAAGGTGGGTGGCCGAG
SmilChr03G004584 Chr03 NC_080389.1:63688892-63688910promoter 内 3618-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 63689275-63692718(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAGAATGTGGTTGGTTACG
SmilChr04G002991 Chr04 NC_080390.1:46340140-46340158promoter 内 2910-2928 bp + 1073 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 46341231-46342816(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACCCTCCACCACCTCTGC
SmilChr01G004803 Chr01 NC_080387.1:66242153-66242171promoter 内 2845-2863 bp + 1138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 66237564-66241015(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTCGAGTTGGTTGGCATAG
SmilChr04G000999 Chr04 NC_080390.1:13847050-13847068promoter 内 2678-2696 bp - 1305 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 13848373-13849597(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAGTGGGTGGTTGAAGTTT
SmilChr01G003494 Chr01 NC_080387.1:53548394-53548412promoter 内 2352-2370 bp - 1631 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 53541977-53546763(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAAATCCAACCACCAAATT
SmilChr04G000233 Chr04 NC_080390.1:2075646-2075664promoter 内 1892-1910 bp + 2091 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 2072752-2073555(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTCGAAGTGGTTGGTTTTG
SmilChr01G001500 Chr01 NC_080387.1:28858192-28858210promoter 内 1373-1391 bp + 2610 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 28851143-28855582(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTTAATGTGGTTGGCGAAG
SmilChr01G004290 Chr01 NC_080387.1:61095889-61095907promoter 内 1226-1244 bp - 2757 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 61098664-61100306(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GAAGAAGTGGTTGGTTTGA
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SmilChr04G003225 Chr04 NC_080390.1:49065915-49065933promoter 内 1030-1048 bp - 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 49060583-49062962(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACCCTCCACCACCTCTGC
SmilChr04G002992 Chr04 NC_080390.1:46340140-46340158promoter 内 1024-1042 bp + 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 46343117-46345491(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CACCCTCCACCACCTCTGC
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SmilChr02G004328 Chr02 NC_080388.1:65558657-65558675promoter 内 684-702 bp - 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 65561974-65565788(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTCATTGTGGTTGAAGATG
SmilChr01G003889 Chr01 NC_080387.1:57201363-57201381promoter 内 415-433 bp + 3568 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 57204949-57209344(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTATCCAACTACCTTTTA
SmilChr02G001051 Chr02 NC_080388.1:18749082-18749100promoter 内 347-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 18741084-18745446(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CAGCCCTAACCACCTTTTT
SmilChr01G004409 Chr01 NC_080387.1:62181777-62181795promoter 内 38-56 bp - 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 2 62185740-62186561(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TCTCAAGTGGTTGAAGAAG
SmilChr02G000541 Chr02 NC_080388.1:7452824-7452842promoter 内 3854-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 7452971-7461152(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTGAAGTGGTTGACGGGC
SmilChr03G002760 Chr03 NC_080389.1:43882727-43882745promoter 内 3697-3715 bp + 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 43880518-43882441(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATAGTGTTGGTTGGGAATT
SmilChr02G002364 Chr02 NC_080388.1:41419605-41419623promoter 内 3637-3655 bp - 346 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 41417183-41419259(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AGATTCCAACCACATATAC
SmilChr02G001274 Chr02 NC_080388.1:23377102-23377120promoter 内 3585-3603 bp + 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 23377518-23380899(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCACCCCAACCAACCTTCA
SmilChr04G000911 Chr04 NC_080390.1:11858060-11858078promoter 内 3568-3586 bp + 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 11855592-11857645(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 AAAAAGGTAGTTGAGTGTA
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SmilChr02G004732 Chr02 NC_080388.1:69562592-69562610promoter 内 3117-3135 bp - 866 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 69555676-69561726(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CATCTGCAACCACTTATTT
SmilChr02G002279 Chr02 NC_080388.1:40282042-40282060promoter 内 3110-3128 bp - 873 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 40280312-40281169(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 CCAGATCAACCACCTCTTG
SmilChr03G000443 Chr03 NC_080389.1:4760690-4760708promoter 内 3072-3090 bp + 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 4750249-4759779(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 GTTGGAGTGGTTGAAGTTT
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SmilChr04G001772 Chr04 NC_080390.1:29121744-29121762promoter 内 3000-3018 bp - 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 29122745-29126625(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATTGGGGTGGTTGGCCTTG
SmilChr04G000236 Chr04 NC_080390.1:2105449-2105467promoter 内 2973-2991 bp + 1010 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 2106477-2108504(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTCTGCCAACCACTTTTAA
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SmilChr05G002690 Chr05 NC_080391.1:30621337-30621355promoter 内 2848-2866 bp + 1135 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 30622490-30627947(+) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 TTCTGCCAACCACCAACTA
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SmilChr01G005968 Chr01 NC_080387.1:75381927-75381945promoter 内 2004-2022 bp - 1979 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.5/ 100 1 75378514-75379948(-) SMil_00010264-RA_Salv MP00132 ATCCACCAACCACCATACA