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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 54 / 149 下载 TSV

上一页 54 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001229 Chr03 NC_080389.1:14169209-14169223promoter 内 3793-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 14169417-14173721(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATCTTATCCTTTTT
SmilChr02G000483 Chr02 NC_080388.1:6600210-6600224promoter 内 3723-3737 bp - 264 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 6600488-6602111(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTTTGGATAAAGAA
SmilChr03G003817 Chr03 NC_080389.1:57232578-57232592promoter 内 3674-3688 bp - 313 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 57232905-57233327(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTGTGGATAATGTG
SmilChr03G001408 Chr03 NC_080389.1:16715245-16715259promoter 内 3631-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 16715615-16718826(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CAACTTATCCATTAG
SmilChr01G005897 Chr01 NC_080387.1:74885961-74885975promoter 内 3617-3631 bp + 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 74881056-74885591(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTATGGATAAAATA
SmilChr01G003226 Chr01 NC_080387.1:51033768-51033782promoter 内 3609-3623 bp + 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 51030576-51033390(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAATGGATAATACT
SmilChr01G005766 Chr01 NC_080387.1:73749005-73749019promoter 内 3594-3608 bp + 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 73749412-73754693(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACTCTTATCCAAACG
SmilChr01G001444 Chr01 NC_080387.1:28138239-28138253promoter 内 3548-3562 bp - 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 28136280-28137800(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCTTAATC
SmilChr04G000158 Chr04 NC_080390.1:1382597-1382611promoter 内 3375-3389 bp + 612 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1379306-1381985(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAATTGGATAAAATA
SmilChr01G000611 Chr01 NC_080387.1:13503157-13503171promoter 内 3366-3380 bp - 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 13499187-13502536(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCTCATC
SmilChr01G003429 Chr01 NC_080387.1:52941997-52942011promoter 内 3236-3250 bp + 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 52942762-52943529(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCTTAATC
SmilChr03G004275 Chr03 NC_080389.1:61203958-61203972promoter 内 3185-3199 bp - 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 61201250-61203156(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGGCTTATCCAATCT
SmilChr01G001313 Chr01 NC_080387.1:26110401-26110415promoter 内 3182-3196 bp + 805 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 26102816-26109596(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGTATGGATAAAATT
SmilChr01G001299 Chr01 NC_080387.1:25858655-25858669promoter 内 3144-3158 bp + 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 25859512-25865599(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCAAATA
SmilChr03G002151 Chr03 NC_080389.1:33458795-33458809promoter 内 3142-3156 bp + 845 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 33449488-33457950(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATAAGGATAAGACA
SmilChr03G000862 Chr03 NC_080389.1:9834120-9834134promoter 内 3112-3126 bp + 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9835009-9836011(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCTTTATCCACTAC
SmilChr04G004134 Chr04 NC_080390.1:56154881-56154895promoter 内 3044-3058 bp + 943 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56152353-56153938(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATAATAAT
SmilChr01G004786 Chr01 NC_080387.1:66083985-66083999promoter 内 3039-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 66084947-66086132(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCTTTATCCACTAC
SmilChr02G002729 Chr02 NC_080388.1:47207395-47207409promoter 内 2857-2871 bp - 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 47205786-47206265(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAGATTATCCATTTA
SmilChr01G002854 Chr01 NC_080387.1:47129640-47129654promoter 内 2833-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 47126960-47128486(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCACAAG
SmilChr04G001974 Chr04 NC_080390.1:31973574-31973588promoter 内 2830-2844 bp - 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31972311-31972417(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCTCATC
SmilChr03G004096 Chr03 NC_080389.1:59828909-59828923promoter 内 2794-2808 bp + 1193 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 59830116-59832213(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCTCATC
SmilChr04G001360 Chr04 NC_080390.1:22079821-22079835promoter 内 2790-2804 bp - 1197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 22081032-22087702(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAGTAGATAAGGTG
SmilChr01G005898 Chr01 NC_080387.1:74885961-74885975promoter 内 2778-2792 bp + 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 74887184-74896636(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTTATCCATAAA
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SmilChr02G001986 Chr02 NC_080388.1:35819873-35819887promoter 内 2692-2706 bp - 1295 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 35818472-35818578(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCTCATC
SmilChr03G003474 Chr03 NC_080389.1:53267969-53267983promoter 内 2640-2654 bp + 1347 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53269330-53273731(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTCTTATCCTTATG
SmilChr02G000151 Chr02 NC_080388.1:1991185-1991199promoter 内 2635-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1992551-1995058(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGATTGGATAATATT
SmilChr02G002133 Chr02 NC_080388.1:38388290-38388304promoter 内 2634-2648 bp + 1353 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 38384804-38386937(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATGGATAAAGAA
SmilChr02G004155 Chr02 NC_080388.1:63871993-63872007promoter 内 2633-2647 bp - 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63869128-63870639(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCTTTATCCACTAC
SmilChr02G005432 Chr02 NC_080388.1:74748216-74748230promoter 内 2609-2623 bp + 1378 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 74742249-74746838(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATGGATAAAATA
SmilChr01G005144 Chr01 NC_080387.1:69250581-69250595promoter 内 2600-2614 bp + 1387 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 69234499-69249194(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTGGATAAGTTG
SmilChr02G005252 Chr02 NC_080388.1:73657033-73657047promoter 内 2547-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 73654315-73655593(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTAAGATAAGGAT
SmilChr01G003121 Chr01 NC_080387.1:50035127-50035141promoter 内 2506-2520 bp - 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 50031791-50033646(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTTATCCACATT
SmilChr02G000725 Chr02 NC_080388.1:11786907-11786921promoter 内 2347-2361 bp + 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 11784668-11785267(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GCTATGGATAATATT
SmilChr01G002875 Chr01 NC_080387.1:47347300-47347314promoter 内 2326-2340 bp + 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 47343786-47345639(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAATGGATAAAGCA
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SmilChr01G004815 Chr01 NC_080387.1:66339172-66339186promoter 内 2273-2287 bp + 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 66340900-66342508(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTTATCCATATA
SmilChr02G001985 Chr02 NC_080388.1:35819873-35819887promoter 内 2202-2216 bp - 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 35807037-35818088(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTCTTATCCTCATC
SmilChr01G000484 Chr01 NC_080387.1:9916898-9916912promoter 内 2080-2094 bp + 1907 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9918819-9919442(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTCTTATCCTTATG
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SmilChr01G004522 Chr01 NC_080387.1:63348057-63348071promoter 内 1976-1990 bp - 2011 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63342734-63346046(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCTTTATCCACTAC
SmilChr01G004188 Chr01 NC_080387.1:60305174-60305188promoter 内 1943-1957 bp + 2044 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60307232-60320496(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCAAAAA
SmilChr03G004712 Chr03 NC_080389.1:64377000-64377014promoter 内 1937-1951 bp - 2050 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 64372608-64374950(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCTTTATCCACTAC
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SmilChr03G002915 Chr03 NC_080389.1:45903129-45903143promoter 内 1825-1839 bp - 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 45905305-45905967(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTAAGATAAGGAT
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SmilChr04G004135 Chr04 NC_080390.1:56154881-56154895promoter 内 1787-1801 bp + 2200 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56157095-56162754(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCATATT