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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 56 / 149 下载 TSV

上一页 56 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004045 Chr02 NC_080388.1:62760352-62760366promoter 内 3839-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 62756637-62760204(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACTCTATCCATAAC
SmilChr03G003270 Chr03 NC_080389.1:50646951-50646965promoter 内 3797-3811 bp + 190 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 50645629-50646761(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAAGTGGATAAAGAA
SmilChr01G002336 Chr01 NC_080387.1:40535121-40535135promoter 内 3738-3752 bp - 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 40535384-40537096(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTATGGATTAGGTT
SmilChr02G000918 Chr02 NC_080388.1:15898541-15898555promoter 内 3589-3603 bp + 398 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 15898953-15902329(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTGTTATCCAAATG
SmilChr04G003835 Chr04 NC_080390.1:54400847-54400861promoter 内 3478-3492 bp - 509 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 54390377-54400338(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCATATCCATTTT
SmilChr01G002284 Chr01 NC_080387.1:39630798-39630812promoter 内 3389-3403 bp - 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 39631410-39633211(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGAGTGGATAAAGTA
SmilChr03G003999 Chr03 NC_080389.1:59034823-59034837promoter 内 3294-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 59031020-59034130(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTTTGGATAAAATT
SmilChr04G002076 Chr04 NC_080390.1:33504034-33504048promoter 内 2937-2951 bp + 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 33505098-33509447(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCACTCA
SmilChr01G003483 Chr01 NC_080387.1:53378200-53378214promoter 内 2811-2825 bp - 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 53379390-53379461(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGAGTGGATAATATT
SmilChr02G000226 Chr02 NC_080388.1:2947857-2947871promoter 内 2690-2704 bp - 1297 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 2945403-2946560(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTTTATCCAAATC
SmilChr02G000227 Chr02 NC_080388.1:2947857-2947871promoter 内 2544-2558 bp - 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 2949314-2950388(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATTTGGATAAAAAT
SmilChr04G000523 Chr04 NC_080390.1:5752124-5752138promoter 内 2443-2457 bp + 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 5753682-5764897(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCAATAT
SmilChr04G003081 Chr04 NC_080390.1:47412161-47412175promoter 内 2436-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 47408398-47410610(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTATGGATAGAGTT
SmilChr04G002401 Chr04 NC_080390.1:38556088-38556102promoter 内 2376-2390 bp + 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 38553610-38554477(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAAATGGATAATTTT
SmilChr01G002056 Chr01 NC_080387.1:36356411-36356425promoter 内 2324-2338 bp + 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 36358088-36359104(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATCCTTATCCGGTTG
SmilChr02G000416 Chr02 NC_080388.1:5299606-5299620promoter 内 1880-1894 bp - 2107 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 5301727-5303520(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAAATGGATAATTTT
SmilChr03G002748 Chr03 NC_080389.1:43669373-43669387promoter 内 1369-1383 bp + 2618 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 43672005-43674888(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CATCTTATCCTCAAG
SmilChr01G003832 Chr01 NC_080387.1:56639272-56639286promoter 内 1364-1378 bp + 2623 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 56641909-56652785(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGACTTATCCAAAAC
SmilChr01G001348 Chr01 NC_080387.1:26748600-26748614promoter 内 1120-1134 bp - 2867 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 26751481-26755073(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGTGGATAATATG
SmilChr01G004968 Chr01 NC_080387.1:67781789-67781803promoter 内 1051-1065 bp + 2936 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 67784739-67791410(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCAAATG
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SmilChr02G000549 Chr02 NC_080388.1:7637881-7637895promoter 内 563-577 bp - 3424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 7641319-7646267(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGAGTGGATAATATT
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SmilChr04G001531 Chr04 NC_080390.1:25235688-25235702promoter 内 3971-3985 bp - 16 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 25235718-25237673(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGAATAGATAAGGTG
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SmilChr04G000723 Chr04 NC_080390.1:8498722-8498736promoter 内 3876-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 8497533-8498611(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CGATTGGATAAGACC
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SmilChr03G001201 Chr03 NC_080389.1:13852179-13852193promoter 内 3731-3745 bp - 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 13852449-13853402(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGTAAAGATAAGGTA
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SmilChr01G005096 Chr01 NC_080387.1:68792687-68792701promoter 内 3273-3287 bp - 714 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 68793415-68797220(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAATTGGATAATATA
SmilChr02G004892 Chr02 NC_080388.1:70961399-70961413promoter 内 3205-3219 bp + 782 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 70959676-70960617(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATGGATAATGAG
SmilChr03G001669 Chr03 NC_080389.1:21714974-21714988promoter 内 3201-3215 bp - 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21712660-21714188(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCAATTT
SmilChr04G003328 Chr04 NC_080390.1:50003875-50003889promoter 内 3168-3182 bp + 819 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 50001144-50003056(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGTTG
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SmilChr02G004268 Chr02 NC_080388.1:64886949-64886963promoter 内 3107-3121 bp - 880 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 64887843-64905621(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GTTTTGGATAAAAAT
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SmilChr03G002216 Chr03 NC_080389.1:34909242-34909256promoter 内 3074-3088 bp + 913 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 34910169-34913099(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAAATTATCCATTTC
SmilChr04G003233 Chr04 NC_080390.1:49153844-49153858promoter 内 3050-3064 bp + 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 49151594-49152907(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAATTGGATAAGTTG