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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 57 / 134 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001327 Chr03 NC_080389.1:15530810-15530822promoter 内 2798-2810 bp + 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 15527280-15529619(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAATAAC
SmilChr01G004415 Chr01 NC_080387.1:62297061-62297073promoter 内 2775-2787 bp + 1214 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 62298287-62300829(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr01G006101 Chr01 NC_080387.1:76518120-76518132promoter 内 2711-2723 bp + 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 76519410-76520333(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr02G003715 Chr02 NC_080388.1:58756228-58756240promoter 内 2634-2646 bp - 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58752554-58754873(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATGCTGATAAGG
SmilChr03G001932 Chr03 NC_080389.1:27146109-27146121promoter 内 2555-2567 bp - 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 27141191-27144675(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAAGGATAAGA
SmilChr02G003927 Chr02 NC_080388.1:61344630-61344642promoter 内 2526-2538 bp + 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 61346105-61348946(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTCTGGATAAGC
SmilChr01G005924 Chr01 NC_080387.1:75044459-75044471promoter 内 2510-2522 bp + 1479 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 75045950-75047871(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTCGTGGATAAGA
SmilChr01G001224 Chr01 NC_080387.1:24527136-24527148promoter 内 2401-2413 bp - 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 24524688-24525548(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAAAAGGATAAGT
SmilChr02G004452 Chr02 NC_080388.1:66883821-66883833promoter 内 2295-2307 bp + 1694 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 66877644-66882127(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCACACT
SmilChr01G006167 Chr01 NC_080387.1:77162113-77162125promoter 内 2048-2060 bp - 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 77164066-77165735(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAATAAC
SmilChr01G001368 Chr01 NC_080387.1:27035417-27035429promoter 内 1933-1945 bp - 2056 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 27037485-27040166(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCTATAC
SmilChr01G005446 Chr01 NC_080387.1:71552716-71552728promoter 内 1853-1865 bp - 2136 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 71546333-71550580(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATCAGGATAAGC
SmilChr01G004558 Chr01 NC_080387.1:63668762-63668774promoter 内 1845-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 63670918-63672419(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTACAAGATAAGG
SmilChr02G003834 Chr02 NC_080388.1:60027531-60027543promoter 内 1798-1810 bp + 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 60029734-60031099(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATCAGGATAAGC
SmilChr01G003312 Chr01 NC_080387.1:51830541-51830553promoter 内 1766-1778 bp + 2223 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 51832776-51833922(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATATGGATAATG
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SmilChr02G003590 Chr02 NC_080388.1:57111491-57111503promoter 内 1700-1712 bp - 2289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 57113792-57116892(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTAAGTC
SmilChr01G006099 Chr01 NC_080387.1:76481848-76481860promoter 内 1695-1707 bp - 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 76484154-76486020(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAAATG
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SmilChr01G004003 Chr01 NC_080387.1:58428276-58428288promoter 内 1644-1656 bp + 2345 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 58430633-58431337(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATAATGATAAGG
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SmilChr02G000022 Chr02 NC_080388.1:186815-186827promoter 内 1468-1480 bp + 2521 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 183631-184294(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAAAAT
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SmilChr01G005927 Chr01 NC_080387.1:75072999-75073011promoter 内 946-958 bp - 3043 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 75064532-75069956(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATCCGGATAAGC
SmilChr01G003846 Chr01 NC_080387.1:56780018-56780030promoter 内 823-835 bp + 3166 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 56773403-56776852(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCAACAG
SmilChr03G000351 Chr03 NC_080389.1:3932125-3932137promoter 内 819-831 bp + 3170 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 3935307-3936363(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr01G003052 Chr01 NC_080387.1:49475445-49475457promoter 内 794-806 bp + 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 49470488-49472250(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCATCAC
SmilChr01G000561 Chr01 NC_080387.1:11664972-11664984promoter 内 789-801 bp + 3200 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 11661023-11661772(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATCTAC
SmilChr02G005141 Chr02 NC_080388.1:72825473-72825485promoter 内 340-352 bp - 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 72829134-72829556(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTCAGG
SmilChr02G004531 Chr02 NC_080388.1:67888975-67888987promoter 内 220-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 67880377-67885206(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATAATGATAAGG
SmilChr02G000911 Chr02 NC_080388.1:15760369-15760381promoter 内 185-197 bp - 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 2 15751612-15756565(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTAAGGATAAGA
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SmilChr03G002433 Chr03 NC_080389.1:38630328-38630340promoter 内 3769-3781 bp + 220 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 38630560-38633258(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr01G002617 Chr01 NC_080387.1:44455132-44455144promoter 内 3710-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 44448117-44454853(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTTGGATAAGT
SmilChr03G000570 Chr03 NC_080389.1:6212924-6212936promoter 内 3675-3687 bp - 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 6213250-6216729(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTCAACC
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SmilChr03G002224 Chr03 NC_080389.1:35061673-35061685promoter 内 3541-3553 bp - 448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 35062133-35067198(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCATCATT
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SmilChr01G005260 Chr01 NC_080387.1:70083863-70083875promoter 内 3479-3491 bp + 510 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 70084385-70087913(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AGGTTGGATAAGG
SmilChr01G001198 Chr01 NC_080387.1:24130210-24130222promoter 内 3422-3434 bp - 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 24128820-24129643(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTTGGGATAAGA
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SmilChr02G003062 Chr02 NC_080388.1:51456940-51456952promoter 内 3237-3249 bp - 752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.6/ 100 1 51457704-51459502(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAATAAC
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