转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G000478; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001018-RA_Salv SmilChr08G000478 GATA XP_057781809.1 MP00130 AGATCTAGATCTGAA

可能结合的靶基因

9821 个结合位点 6015 个候选靶基因 第 57 / 121 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001004 Chr02 NC_080388.1:17726389-17726403promoter 内 918-932 bp - 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 17729472-17730424(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAGTAAC
SmilChr02G002907 Chr02 NC_080388.1:49377988-49378002promoter 内 916-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 49381073-49385561(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACAGATCTAGGTTT
SmilChr05G000733 Chr05 NC_080391.1:5595360-5595374promoter 内 871-885 bp + 3116 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 5588925-5592244(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCAGATCTACATGT
SmilChr01G003890 Chr01 NC_080387.1:57208095-57208109promoter 内 801-815 bp - 3186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 57211295-57212440(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCCAGCAAT
SmilChr03G000832 Chr03 NC_080389.1:9558800-9558814promoter 内 783-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 9548359-9555596(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTATCTAGATCTACT
SmilChr05G000231 Chr05 NC_080391.1:1796022-1796036promoter 内 729-743 bp + 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 1799294-1801668(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TAGACTAGATCTCAG
SmilChr03G001340 Chr03 NC_080389.1:15650060-15650074promoter 内 652-666 bp - 3335 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 15644639-15646725(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAGCTAGATCTTAT
SmilChr02G000027 Chr02 NC_080388.1:286873-286887promoter 内 629-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 290245-293695(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGAGTGAGATCTGAT
SmilChr01G002557 Chr01 NC_080387.1:43703325-43703339promoter 内 576-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 43698739-43699914(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCTATTTAT
SmilChr02G002061 Chr02 NC_080388.1:37127069-37127083promoter 内 522-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 37130548-37136485(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTGAGATCTAATTTT
SmilChr02G000678 Chr02 NC_080388.1:10592803-10592817promoter 内 501-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 10580733-10589317(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AACTGTGGATCTGAT
SmilChr02G000068 Chr02 NC_080388.1:878571-878585promoter 内 484-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 871668-875068(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGAAGTAGATCTGGT
SmilChr05G000934 Chr05 NC_080391.1:7483905-7483919promoter 内 441-455 bp - 3546 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7487465-7489226(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATCAGATCTATTTAT
SmilChr02G003594 Chr02 NC_080388.1:57141871-57141885promoter 内 417-431 bp + 3570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 57145455-57146741(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TAAACTAGATCTCAT
SmilChr03G004152 Chr03 NC_080389.1:60332054-60332068promoter 内 416-430 bp + 3571 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 60327817-60328483(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AGTAGATCTAGAGCT
SmilChr02G003635 Chr02 NC_080388.1:57696449-57696463promoter 内 348-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 57700102-57700797(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTTTTTGGATCTGAC
SmilChr02G000153 Chr02 NC_080388.1:2010184-2010198promoter 内 338-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2013847-2016994(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGAAGTAGATCTGGT
SmilChr01G005140 Chr01 NC_080387.1:69170419-69170433promoter 内 193-207 bp - 3794 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 69174227-69175474(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTAAGATCTAAATTC
SmilChr03G000420 Chr03 NC_080389.1:4572101-4572115promoter 内 191-205 bp - 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 4567390-4568305(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTTACTAGATCTAAG
SmilChr01G002115 Chr01 NC_080387.1:37191315-37191329promoter 内 189-203 bp + 3798 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 37184435-37187517(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ATGAGATCTAATTTT
SmilChr01G001567 Chr01 NC_080387.1:29686986-29687000promoter 内 108-122 bp - 3879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 29680952-29683107(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAATGTAGATCTCAT
SmilChr04G000303 Chr04 NC_080390.1:2799184-2799198promoter 内 5-19 bp - 3982 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 2794178-2795202(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GAAATTAGATCTCGA
SmilChr03G002494 Chr03 NC_080389.1:39719773-39719787promoter 内 1693-1707 bp + 2294 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 7 39722081-39724770(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCAGATGGATCTGAT
SmilChr01G002444 Chr01 NC_080387.1:42024755-42024769promoter 内 1269-1283 bp - 2718 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 42027487-42027560(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TACAGATCTGGAATG
SmilChr04G001363 Chr04 NC_080390.1:22129207-22129221promoter 内 1081-1095 bp - 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 22132127-22133183(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAGGTTA
SmilChr03G000646 Chr03 NC_080389.1:7178450-7178464promoter 内 699-713 bp + 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 7172638-7175162(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCAGATCTGAATAG
SmilChr03G002873 Chr03 NC_080389.1:45410509-45410523promoter 内 616-630 bp - 3371 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 45395002-45407138(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTCCCAGATCTGAG
SmilChr03G004285 Chr03 NC_080389.1:61264393-61264407promoter 内 577-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 61267817-61269613(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCTGACCCG
SmilChr04G000414 Chr04 NC_080390.1:4343741-4343755promoter 内 350-364 bp + 3637 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 3 4339745-4340104(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GTCAGATCCGCTTGT
SmilChr02G000396 Chr02 NC_080388.1:4906007-4906021promoter 内 3980-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 4905569-4906000(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GCTTCTAGATCTAAC
SmilChr01G003277 Chr01 NC_080387.1:51473463-51473477promoter 内 3925-3939 bp - 62 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 51472673-51473401(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TAACCTAGATCTAAG
SmilChr02G000798 Chr02 NC_080388.1:13265228-13265242promoter 内 3665-3679 bp - 322 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 13265564-13268160(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAGGTTA
SmilChr02G004013 Chr02 NC_080388.1:62440020-62440034promoter 内 3642-3656 bp + 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 62438878-62439675(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTAACACC
SmilChr03G003000 Chr03 NC_080389.1:46819406-46819420promoter 内 3568-3582 bp - 419 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46819839-46820705(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAAAGGT
SmilChr02G001932 Chr02 NC_080388.1:34738783-34738797promoter 内 3471-3485 bp + 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 34739313-34740095(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTGCCAGATCTGCA
SmilChr04G001703 Chr04 NC_080390.1:28169208-28169222promoter 内 3392-3406 bp + 595 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 28169817-28170251(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTGCCAGATCTGCA
SmilChr05G000830 Chr05 NC_080391.1:6534629-6534643promoter 内 3288-3302 bp - 699 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 6532277-6533930(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 AACCCTAGATCTGCG
SmilChr01G001682 Chr01 NC_080387.1:31012511-31012525promoter 内 3221-3235 bp + 766 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 31013291-31016406(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GATCCTAGATCTAAG
SmilChr03G001421 Chr03 NC_080389.1:16831481-16831495promoter 内 2892-2906 bp + 1095 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 16832590-16834140(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 GGGCTTAGATCTGTG
SmilChr01G002708 Chr01 NC_080387.1:45345319-45345333promoter 内 2452-2466 bp - 1535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 45346868-45348686(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAGGTTA
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SmilChr02G004012 Chr02 NC_080388.1:62440020-62440034promoter 内 2412-2426 bp + 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 62438104-62438445(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CACAGATCTAACACC
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SmilChr04G002214 Chr04 NC_080390.1:35831788-35831802promoter 内 2010-2024 bp + 1977 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 35829269-35829811(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTCAGATCTGGGAAG
SmilChr03G001623 Chr03 NC_080389.1:20829431-20829445promoter 内 1819-1833 bp + 2168 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 20825715-20827263(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TGCAGATCTGGCAGT
SmilChr03G001624 Chr03 NC_080389.1:20834307-20834321promoter 内 1763-1777 bp + 2224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 20836545-20837898(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 ACTGCCAGATCTGCA
SmilChr02G001107 Chr02 NC_080388.1:19958801-19958815promoter 内 1592-1606 bp - 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 19955708-19956406(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CGTGACAGATCTGAG
SmilChr01G002706 Chr01 NC_080387.1:45345319-45345333promoter 内 1535-1549 bp - 2452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 45324190-45342867(-) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TAACCTAGATCTAAG
SmilChr03G001122 Chr03 NC_080389.1:12916723-12916737promoter 内 1035-1049 bp - 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 12919689-12925466(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 TTCAGATCCATCTGC
SmilChr03G003001 Chr03 NC_080389.1:46819406-46819420promoter 内 1002-1016 bp - 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 2 46822405-46828848(+) SMil_00001018-RA_Salv MP00130 CTTAGATCTAAAGGT