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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 60 / 142 下载 TSV

上一页 60 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G001775 Chr05 NC_080391.1:17466897-17466911promoter 内 2778-2792 bp - 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 17468120-17471720(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGGGGGTAGGTAAA
SmilChr03G001131 Chr03 NC_080389.1:13059291-13059305promoter 内 2723-2737 bp + 1264 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 13060569-13065688(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTACCTACCCCCAA
SmilChr07G004709 Chr07 NC_080393.1:59951232-59951246promoter 内 2698-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 59952535-59954965(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACTACCTACCTCACT
SmilChr06G000877 Chr06 NC_080392.1:8297698-8297712promoter 内 2474-2488 bp + 1513 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8294575-8296185(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGGGTGGTAGGTATT
SmilChr04G001671 Chr04 NC_080390.1:27655333-27655347promoter 内 2458-2472 bp + 1529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27656876-27668710(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CATAACTACCACAAC
SmilChr05G000681 Chr05 NC_080391.1:5183665-5183679promoter 内 2435-2449 bp - 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5185231-5185303(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGTAGGTAGGTAGA
SmilChr07G001921 Chr07 NC_080393.1:16619941-16619955promoter 内 2384-2398 bp + 1603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 16617308-16618338(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAGTAGGTAGGTAGA
SmilChr04G000180 Chr04 NC_080390.1:1592557-1592571promoter 内 2352-2366 bp + 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 1594206-1597812(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACTACCTACCAGCAA
SmilChr01G005036 Chr01 NC_080387.1:68305806-68305820promoter 内 2338-2352 bp - 1649 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68298512-68304157(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCGTGGT
SmilChr01G005037 Chr01 NC_080387.1:68305806-68305820promoter 内 2307-2321 bp - 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 68307500-68325829(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACGGTAGGTAGG
SmilChr07G002393 Chr07 NC_080393.1:22303282-22303296promoter 内 2292-2306 bp + 1695 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 22304991-22315170(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGCACCTACTCCCTC
SmilChr01G003356 Chr01 NC_080387.1:52302073-52302087promoter 内 2232-2246 bp - 1755 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52303842-52304849(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTGAAGTAGGTGGG
SmilChr05G001012 Chr05 NC_080391.1:8306116-8306130promoter 内 2224-2238 bp + 1763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8302989-8304353(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTTGGGTAGGTGAC
SmilChr01G003875 Chr01 NC_080387.1:57021907-57021921promoter 内 2168-2182 bp + 1819 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 57023740-57024237(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGTACCTACCCCTCT
SmilChr04G002396 Chr04 NC_080390.1:38475058-38475072promoter 内 2113-2127 bp - 1874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38476946-38483560(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CAATTGGTAGGTAGG
SmilChr07G000454 Chr07 NC_080393.1:3208876-3208890promoter 内 1946-1960 bp + 2041 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 3202805-3206835(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTGCAGGTAGGTGAA
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SmilChr05G002490 Chr05 NC_080391.1:27565473-27565487promoter 内 1694-1708 bp + 2293 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27562330-27563180(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGCTGGTAGGTAGT
SmilChr07G001821 Chr07 NC_080393.1:15709030-15709044promoter 内 1645-1659 bp - 2342 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 15711386-15713948(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGAAGTTAGGTGGA
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SmilChr08G000668 Chr08 NC_080394.1:4960720-4960734promoter 内 1540-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4955486-4958273(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACGCTGGTAGGTAGT
SmilChr05G000682 Chr05 NC_080391.1:5183665-5183679promoter 内 1527-1541 bp - 2460 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 5186139-5191450(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAGTAGGTAGGTAGA
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SmilChr08G001172 Chr08 NC_080394.1:9371787-9371801promoter 内 1503-1517 bp - 2484 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 9374285-9376736(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATTTGGTAGGTGAA
SmilChr01G002079 Chr01 NC_080387.1:36739920-36739934promoter 内 1450-1464 bp - 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36742471-36743140(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGCTGGTAGGTAGT
SmilChr04G002212 Chr04 NC_080390.1:35799235-35799249promoter 内 1395-1409 bp + 2592 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 35793103-35796643(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTTGTTAGGTGGA
SmilChr04G002234 Chr04 NC_080390.1:36060661-36060675promoter 内 1393-1407 bp + 2594 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36054519-36058067(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTTGTTAGGTGGA
SmilChr03G003779 Chr03 NC_080389.1:56925062-56925076promoter 内 1308-1322 bp + 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 56927755-56927828(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCAACTACCACAAA
SmilChr03G002326 Chr03 NC_080389.1:36618793-36618807promoter 内 1295-1309 bp - 2692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 36621499-36622803(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTTGTTAGGTGGA
SmilChr02G003216 Chr02 NC_080388.1:53340730-53340744promoter 内 1196-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 53334951-53337939(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACAACTACCACGCT
SmilChr02G001376 Chr02 NC_080388.1:26027719-26027733promoter 内 1191-1205 bp - 2796 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 26030529-26038866(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTTGTTAGGTGGA
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SmilChr05G001633 Chr05 NC_080391.1:15265050-15265064promoter 内 1086-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 15258696-15262149(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTGAGGTAGGTATA
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SmilChr07G002069 Chr07 NC_080393.1:18818130-18818144promoter 内 890-904 bp - 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 18814278-18815033(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTACCAACCACCAA
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SmilChr06G002357 Chr06 NC_080392.1:34367847-34367861promoter 内 697-711 bp - 3290 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 34371151-34375376(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTGGAGTAGGTGAG