转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000162; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008183-RA_Salv SmilChr04G000162 MYB XP_057807467.1 MP00134 TCCACCTACCACCAC

可能结合的靶基因

8676 个结合位点 7078 个候选靶基因 第 61 / 142 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001538 Chr01 NC_080387.1:29393680-29393694promoter 内 692-706 bp + 3295 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 29396989-29398368(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCCCATG
SmilChr08G000594 Chr08 NC_080394.1:4421188-4421202promoter 内 690-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 4424499-4426574(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GCTACCTACCGCTAA
SmilChr04G001345 Chr04 NC_080390.1:21817637-21817651promoter 内 662-676 bp + 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 21811613-21814312(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGCTCGGTAGGTGAA
SmilChr07G000139 Chr07 NC_080393.1:837149-837163promoter 内 643-657 bp - 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 831120-833805(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TACACCTACCACGAG
SmilChr08G004284 Chr08 NC_080394.1:52489368-52489382promoter 内 576-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 52482008-52485957(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CGATCGGTAGGTGCA
SmilChr03G001810 Chr03 NC_080389.1:24714455-24714469promoter 内 546-560 bp - 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 24703512-24711014(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACAACTACCACAGT
SmilChr08G003875 Chr08 NC_080394.1:45907114-45907128promoter 内 524-538 bp - 3463 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 45910591-45911382(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AAAGGGGTAGGTGAA
SmilChr04G002993 Chr04 NC_080390.1:46345205-46345219promoter 内 502-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46348704-46355265(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACGGCAGTAGGTGAG
SmilChr04G001546 Chr04 NC_080390.1:25575358-25575372promoter 内 485-499 bp - 3502 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 25570353-25571856(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACTACCTACCAGCAA
SmilChr03G001541 Chr03 NC_080389.1:19316383-19316397promoter 内 357-371 bp + 3630 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 19308598-19312753(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTTGTTAGGTGGA
SmilChr08G001140 Chr08 NC_080394.1:8992557-8992571promoter 内 355-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 8984938-8988925(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGCACCTACCACAAG
SmilChr08G001850 Chr08 NC_080394.1:15878965-15878979promoter 内 316-330 bp - 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 15882650-15888983(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGCTGGTAGGTAGT
SmilChr07G003530 Chr07 NC_080393.1:40571928-40571942promoter 内 239-253 bp - 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 40575690-40576590(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTGTCGTTAGGTGGT
SmilChr07G002771 Chr07 NC_080393.1:27577374-27577388promoter 内 229-243 bp - 3758 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27570522-27573616(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTTACCTACCTAAAC
SmilChr02G004463 Chr02 NC_080388.1:67057257-67057271promoter 内 223-237 bp + 3764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 67049021-67053493(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTAGAGGTAGGTAGA
SmilChr01G001855 Chr01 NC_080387.1:33502790-33502804promoter 内 204-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 33497684-33499007(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTTACCTACCCCACC
SmilChr07G001499 Chr07 NC_080393.1:11908999-11909013promoter 内 201-215 bp - 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11912799-11920804(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AGGATGGTAGGTGTC
SmilChr03G002968 Chr03 NC_080389.1:46457625-46457639promoter 内 197-211 bp - 3790 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 46461429-46465359(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATGTTGTTAGGTGGA
SmilChr02G003360 Chr02 NC_080388.1:54734336-54734350promoter 内 186-200 bp - 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 54738151-54742587(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGAAGGTAGGTAGT
SmilChr08G001048 Chr08 NC_080394.1:7986593-7986607promoter 内 177-191 bp - 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7990417-7993338(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGCGGCAGGTGGA
SmilChr02G001259 Chr02 NC_080388.1:23096033-23096047promoter 内 118-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 23089378-23092164(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TCCACCTAACAACAT
SmilChr08G001010 Chr08 NC_080394.1:7587118-7587132promoter 内 63-77 bp - 3924 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 7591056-7594182(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GAGGCGGCAGGTGGA
SmilChr01G002476 Chr01 NC_080387.1:42500104-42500118promoter 内 750-764 bp + 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 4 42503355-42505763(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCGTGGA
SmilChr05G002608 Chr05 NC_080391.1:29324122-29324136promoter 内 2992-3006 bp + 995 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 3 29325131-29327694(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CCTACCTACCGTGGA
SmilChr08G002281 Chr08 NC_080394.1:21217150-21217164promoter 内 3777-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 21215773-21216940(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGTGTGTTAGGTGGC
SmilChr01G001135 Chr01 NC_080387.1:23130280-23130294promoter 内 3760-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 23125739-23130053(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GGTAAGGTAGGTGAT
SmilChr07G002964 Chr07 NC_080393.1:30122020-30122034promoter 内 3507-3521 bp + 480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 30122514-30124392(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCTTGGC
SmilChr01G005421 Chr01 NC_080387.1:71402987-71403001promoter 内 3361-3375 bp + 626 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 71403627-71407525(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACTAACCACCACCAA
SmilChr03G003006 Chr03 NC_080389.1:46895359-46895373promoter 内 3336-3350 bp + 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 46896024-46896674(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCACTAG
SmilChr05G003429 Chr05 NC_080391.1:45527797-45527811promoter 内 3261-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 45524163-45527071(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TAGCGGGTAGGTGAA
SmilChr01G005420 Chr01 NC_080387.1:71402987-71403001promoter 内 3127-3141 bp + 860 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 71399457-71402127(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTGGTGGTGGTTAGT
SmilChr08G003412 Chr08 NC_080394.1:36140622-36140636promoter 内 2816-2830 bp - 1171 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 36137833-36139451(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCATATT
SmilChr03G003858 Chr03 NC_080389.1:57671673-57671687promoter 内 2677-2691 bp + 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 57672997-57674764(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCATATT
SmilChr08G000226 Chr08 NC_080394.1:1527115-1527129promoter 内 2606-2620 bp - 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 1520372-1525734(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CTCACCCGCCACCAC
SmilChr02G002417 Chr02 NC_080388.1:42172398-42172412promoter 内 2284-2298 bp - 1703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 42158821-42170695(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCCACTT
SmilChr02G004328 Chr02 NC_080388.1:65559851-65559865promoter 内 1878-1892 bp - 2109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 65561974-65565788(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 AATATGGTAGGTGAA
SmilChr04G003653 Chr04 NC_080390.1:53009930-53009944promoter 内 1848-1862 bp - 2139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 53012083-53016707(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 GTAGAGGTAGGTGTT
SmilChr02G001562 Chr02 NC_080388.1:28890861-28890875promoter 内 1829-1843 bp + 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 28893033-28895362(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATCACCTACCATCAT
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SmilChr03G002180 Chr03 NC_080389.1:33886023-33886037promoter 内 636-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 33889388-33890394(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ATAGTGGTAGTTGGC
SmilChr02G003457 Chr02 NC_080388.1:55860096-55860110promoter 内 626-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 55863471-55868477(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACAGTGGTAGTTGGC
SmilChr01G003647 Chr01 NC_080387.1:54945824-54945838promoter 内 182-196 bp + 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 2 54949643-54949781(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACCATTGT
SmilChr07G001714 Chr07 NC_080393.1:14562772-14562786promoter 内 3982-3996 bp + 5 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14551315-14562767(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TGACTGGTAGGTGTA
SmilChr04G000996 Chr04 NC_080390.1:13788669-13788683promoter 内 3964-3978 bp - 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 13787298-13788646(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACTACAAC
SmilChr04G001011 Chr04 NC_080390.1:14101024-14101038promoter 内 3963-3977 bp - 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 14099664-14101000(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACTACAAC
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SmilChr08G001367 Chr08 NC_080394.1:10899649-10899663promoter 内 3899-3913 bp + 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 10899751-10900731(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 CACACCTACCATATA
SmilChr03G002891 Chr03 NC_080389.1:45597493-45597507promoter 内 3849-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45593903-45597355(-) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 ACCACCTACCCAACT
SmilChr07G001078 Chr07 NC_080393.1:7915347-7915361promoter 内 3837-3851 bp + 150 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 7915511-7918256(+) SMil_00008183-RA_Salv MP00134 TTCACCTACCATATT