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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 61 / 153 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000867 Chr01 NC_080387.1:18545107-18545116promoter 内 1053-1062 bp + 2939 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 18548055-18550334(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr04G001247 Chr04 NC_080390.1:19628483-19628492promoter 内 1051-1060 bp - 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 19623626-19625542(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr03G001030 Chr03 NC_080389.1:12016326-12016335promoter 内 1033-1042 bp + 2959 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 12012932-12013367(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr04G002891 Chr04 NC_080390.1:45132211-45132220promoter 内 965-974 bp - 3027 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 45128099-45129184(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTC
SmilChr05G000107 Chr05 NC_080391.1:697409-697418promoter 内 923-932 bp + 3069 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 691735-694340(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr02G004918 Chr02 NC_080388.1:71194320-71194329promoter 内 917-926 bp + 3075 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 71197404-71199744(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr05G000846 Chr05 NC_080391.1:6679732-6679741promoter 内 908-917 bp + 3084 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 6682825-6684999(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTC
SmilChr01G000863 Chr01 NC_080387.1:18537435-18537444promoter 内 855-864 bp + 3137 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 18540581-18542632(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr02G002142 Chr02 NC_080388.1:38540170-38540179promoter 内 831-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 38543340-38546017(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GACCCGACAA
SmilChr01G004844 Chr01 NC_080387.1:66581437-66581446promoter 内 797-806 bp - 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 66584641-66588933(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr01G002190 Chr01 NC_080387.1:38047706-38047715promoter 内 780-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 38050927-38053911(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTC
SmilChr04G000421 Chr04 NC_080390.1:4471384-4471393promoter 内 774-783 bp + 3218 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 4474611-4480073(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTC
SmilChr01G001179 Chr01 NC_080387.1:23846985-23846994promoter 内 693-702 bp + 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 23836130-23843686(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGTCCGACAC
SmilChr01G004729 Chr01 NC_080387.1:65467579-65467588promoter 内 598-607 bp + 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 65461649-65464185(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TGTCCGACAC
SmilChr03G001887 Chr03 NC_080389.1:26313400-26313409promoter 内 554-563 bp + 3438 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 26316847-26319373(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTC
SmilChr03G003992 Chr03 NC_080389.1:58962798-58962807promoter 内 521-530 bp - 3471 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 58957357-58959327(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTGTCGGACA
SmilChr04G002775 Chr04 NC_080390.1:43545162-43545171promoter 内 483-492 bp + 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 43540338-43541653(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr01G000864 Chr01 NC_080387.1:18545107-18545116promoter 内 439-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 18540699-18541554(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr01G000866 Chr01 NC_080387.1:18548958-18548967promoter 内 439-448 bp + 3553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 18544550-18545405(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr01G004996 Chr01 NC_080387.1:68015491-68015500promoter 内 417-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 68011492-68011916(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTGTCGGACA
SmilChr04G001418 Chr04 NC_080390.1:23034505-23034514promoter 内 414-423 bp + 3578 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 23030023-23030927(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr01G004633 Chr01 NC_080387.1:64353911-64353920promoter 内 399-408 bp + 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 64357513-64358550(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGTC
SmilChr03G001377 Chr03 NC_080389.1:16298915-16298924promoter 内 337-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 16302579-16304191(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr04G002738 Chr04 NC_080390.1:43057644-43057653promoter 内 297-306 bp - 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 43053877-43053949(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr02G000903 Chr02 NC_080388.1:15571485-15571494promoter 内 278-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 15541002-15567771(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr03G000871 Chr03 NC_080389.1:9894139-9894148promoter 内 273-282 bp + 3719 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 9888327-9890420(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GACCCGACAA
SmilChr02G004280 Chr02 NC_080388.1:64995127-64995136promoter 内 182-191 bp - 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 64989756-64991317(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGA
SmilChr05G000710 Chr05 NC_080391.1:5357953-5357962promoter 内 170-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 5361784-5368384(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr05G000452 Chr05 NC_080391.1:3440386-3440395promoter 内 139-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 3434519-3436533(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr02G000289 Chr02 NC_080388.1:3681614-3681623promoter 内 63-72 bp + 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 3676633-3677685(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TCGCCGACAA
SmilChr03G002844 Chr03 NC_080389.1:45002988-45002997promoter 内 3695-3704 bp - 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 44985445-45002691(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG
SmilChr03G000458 Chr03 NC_080389.1:4884881-4884890promoter 内 3431-3440 bp - 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 4885451-4887397(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
SmilChr04G000323 Chr04 NC_080390.1:2939157-2939166promoter 内 1642-1651 bp + 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 2935453-2936807(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
SmilChr03G002192 Chr03 NC_080389.1:34438409-34438418promoter 内 66-75 bp + 3926 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 34433795-34434483(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
SmilChr02G003040 Chr02 NC_080388.1:51144967-51144976promoter 内 2595-2604 bp + 1397 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 51146373-51148060(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG
SmilChr02G002461 Chr02 NC_080388.1:42917544-42917553promoter 内 1313-1322 bp + 2679 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 42920232-42921125(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG
SmilChr05G001705 Chr05 NC_080391.1:16285147-16285156promoter 内 722-731 bp + 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 16288426-16289947(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG
SmilChr04G003893 Chr04 NC_080390.1:54728676-54728685promoter 内 3876-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 54728801-54730380(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG
SmilChr01G002980 Chr01 NC_080387.1:48739425-48739434promoter 内 3850-3859 bp - 142 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 48734833-48739283(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG
SmilChr03G002394 Chr03 NC_080389.1:37895066-37895075promoter 内 3674-3683 bp + 318 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 37891304-37894748(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
SmilChr04G001490 Chr04 NC_080390.1:24354480-24354489promoter 内 3289-3298 bp + 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 24350011-24353777(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
SmilChr01G001442 Chr01 NC_080387.1:28109738-28109747promoter 内 3250-3259 bp + 742 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 28102489-28108996(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
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SmilChr04G002576 Chr04 NC_080390.1:41116881-41116890promoter 内 2596-2605 bp - 1396 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 41118286-41164029(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CTGCCGACAA
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SmilChr04G001904 Chr04 NC_080390.1:31110713-31110722promoter 内 1542-1551 bp - 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 31107244-31108263(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCAG