转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001365; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010780-RA_Salv SmilChr06G001365 SBP XP_057768799.1 MP00307 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9755 个结合位点 6893 个候选靶基因 第 61 / 138 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001153 Chr02 NC_080388.1:21004010-21004020promoter 内 2550-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 20997549-21002569(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GGGGTACGGAA
SmilChr01G004419 Chr01 NC_080387.1:62312150-62312160promoter 内 2479-2489 bp + 1512 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 62313672-62316505(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGACC
SmilChr02G003630 Chr02 NC_080388.1:57643764-57643774promoter 内 2231-2241 bp - 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 57636422-57642004(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTAT
SmilChr01G004346 Chr01 NC_080387.1:61617447-61617457promoter 内 2193-2203 bp - 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 61613125-61615649(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CAGGTACGGAA
SmilChr01G002930 Chr01 NC_080387.1:48089214-48089224promoter 内 2188-2198 bp + 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 48082383-48087411(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CACAGTACAAT
SmilChr01G003602 Chr01 NC_080387.1:54569687-54569697promoter 内 2008-2018 bp + 1983 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 54571680-54573014(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGTG
SmilChr03G000666 Chr03 NC_080389.1:7457697-7457707promoter 内 1847-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 7459851-7462643(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr03G000552 Chr03 NC_080389.1:5972378-5972388promoter 内 1556-1566 bp - 2435 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 5974823-5979533(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTCCGTACCCC
SmilChr01G002938 Chr01 NC_080387.1:48155665-48155675promoter 内 1296-1306 bp + 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 48158370-48164782(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGCA
SmilChr01G002542 Chr01 NC_080387.1:43469805-43469815promoter 内 1232-1242 bp - 2759 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 43472574-43473839(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTCCGTACCTG
SmilChr01G002951 Chr01 NC_080387.1:48397724-48397734promoter 内 1075-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 48389141-48394808(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr02G001198 Chr02 NC_080388.1:22114939-22114949promoter 内 1004-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 22117936-22121739(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr02G004084 Chr02 NC_080388.1:63108870-63108880promoter 内 851-861 bp - 3140 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 63112020-63117061(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr02G005469 Chr02 NC_080388.1:74966164-74966174promoter 内 172-182 bp + 3819 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 2 74969993-74970778(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGTCA
SmilChr02G000982 Chr02 NC_080388.1:17271780-17271790promoter 内 3979-3989 bp + 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 17271802-17274084(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGACC
SmilChr02G005219 Chr02 NC_080388.1:73401949-73401959promoter 内 3799-3809 bp + 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 73402151-73407155(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTAT
SmilChr02G005191 Chr02 NC_080388.1:73199129-73199139promoter 内 3714-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 73199416-73201412(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CACAGTACAAT
SmilChr02G004823 Chr02 NC_080388.1:70339076-70339086promoter 内 3656-3666 bp + 335 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 70334940-70338741(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr01G000181 Chr01 NC_080387.1:3131589-3131599promoter 内 3637-3647 bp - 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 3129296-3131235(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGACC
SmilChr01G002853 Chr01 NC_080387.1:47123807-47123817promoter 内 3630-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 47120611-47123446(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGTG
SmilChr03G003786 Chr03 NC_080389.1:56967490-56967500promoter 内 3443-3453 bp + 548 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 56968048-56969315(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTCGTACGGAG
SmilChr01G000741 Chr01 NC_080387.1:16421349-16421359promoter 内 3427-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 16421923-16422717(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGACC
SmilChr02G000232 Chr02 NC_080388.1:2998571-2998581promoter 内 3403-3413 bp + 588 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 2992261-2997983(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr02G003773 Chr02 NC_080388.1:59430017-59430027promoter 内 3399-3409 bp - 592 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 59430619-59433539(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr01G001797 Chr01 NC_080387.1:32831289-32831299promoter 内 3386-3396 bp + 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 32828472-32830684(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr01G004134 Chr01 NC_080387.1:59856374-59856384promoter 内 3286-3296 bp + 705 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 59857089-59858572(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTAT
SmilChr03G003884 Chr03 NC_080389.1:57921635-57921645promoter 内 3004-3014 bp + 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 57920037-57920648(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr01G002848 Chr01 NC_080387.1:47052105-47052115promoter 内 2879-2889 bp + 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 47053227-47058908(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTTGTACGTAT
SmilChr02G004786 Chr02 NC_080388.1:70020784-70020794promoter 内 2768-2778 bp + 1223 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 70022017-70025989(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGCA
SmilChr03G002132 Chr03 NC_080389.1:33213758-33213768promoter 内 2701-2711 bp - 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 33208351-33212468(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TTCGTACGGAG
SmilChr03G002209 Chr03 NC_080389.1:34816791-34816801promoter 内 2684-2694 bp + 1307 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 34813516-34815484(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CACAGTACAAT
SmilChr02G001995 Chr02 NC_080388.1:36054623-36054633promoter 内 2601-2611 bp - 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 36051445-36053233(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGCA
SmilChr01G005416 Chr01 NC_080387.1:71377613-71377623promoter 内 2578-2588 bp + 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 71373066-71376200(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATACGTACAAA
SmilChr01G000742 Chr01 NC_080387.1:16421349-16421359promoter 内 2551-2561 bp + 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 16422799-16423392(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTTGTACGACC
SmilChr01G004417 Chr01 NC_080387.1:62312150-62312160promoter 内 2435-2445 bp + 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 62306415-62310594(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GGTCGTACAAG
SmilChr03G000022 Chr03 NC_080389.1:355674-355684promoter 内 2366-2376 bp - 1625 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 1 352188-354049(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACTGCA
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