转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 67 / 143 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000638 Chr06 NC_080392.1:5643758-5643769promoter 内 574-585 bp + 3416 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 5647185-5648867(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTAAT
SmilChr04G000954 Chr04 NC_080390.1:12620055-12620066promoter 内 549-560 bp - 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 12623507-12626374(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAC
SmilChr06G002088 Chr06 NC_080392.1:27587836-27587847promoter 内 486-497 bp + 3504 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 27591351-27591989(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCAA
SmilChr04G000919 Chr04 NC_080390.1:11955092-11955103promoter 内 477-488 bp - 3513 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 11958616-11961442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAC
SmilChr02G004639 Chr02 NC_080388.1:68835968-68835979promoter 内 459-470 bp - 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 68839510-68851822(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCGA
SmilChr03G002979 Chr03 NC_080389.1:46629505-46629516promoter 内 292-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 46624053-46625807(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCAA
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8378834-8378845promoter 内 134-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATT
SmilChr06G002865 Chr06 NC_080392.1:41479850-41479861promoter 内 78-89 bp + 3912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 41474897-41475938(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCTC
SmilChr01G002073 Chr01 NC_080387.1:36637587-36637598promoter 内 45-56 bp + 3945 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 36630279-36633642(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAAA
SmilChr05G003680 Chr05 NC_080391.1:49854652-49854663promoter 内 24-35 bp + 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 49858629-49865914(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGTC
SmilChr06G001633 Chr06 NC_080392.1:18307639-18307650promoter 内 6-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.1/ 100 1 18302279-18303655(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAC
SmilChr05G003414 Chr05 NC_080391.1:45360748-45360759promoter 内 2292-2303 bp - 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 45356841-45359050(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr06G002907 Chr06 NC_080392.1:41868308-41868319promoter 内 2150-2161 bp - 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 41870159-41872040(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr05G003415 Chr05 NC_080391.1:45360748-45360759promoter 内 80-91 bp - 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 4 45364669-45371631(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr02G002658 Chr02 NC_080388.1:46012231-46012242promoter 内 2706-2717 bp - 1284 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 46013526-46016442(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCTC
SmilChr04G004034 Chr04 NC_080390.1:55583760-55583771promoter 内 1635-1646 bp + 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 55586126-55590610(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGGT
SmilChr06G001627 Chr06 NC_080392.1:18194405-18194416promoter 内 1365-1376 bp + 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 18197041-18204258(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr06G002976 Chr06 NC_080392.1:42590302-42590313promoter 内 1187-1198 bp + 2803 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 42584882-42587499(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAA
SmilChr03G003353 Chr03 NC_080389.1:51856197-51856208promoter 内 943-954 bp + 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 51859255-51861492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTAAG
SmilChr08G001998 Chr08 NC_080394.1:17730671-17730682promoter 内 609-620 bp - 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 17724478-17727290(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGAG
SmilChr02G003040 Chr02 NC_080388.1:51142912-51142923promoter 内 540-551 bp - 3450 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 3 51146373-51148060(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGT
SmilChr02G003143 Chr02 NC_080388.1:52440311-52440322promoter 内 3972-3983 bp + 18 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 52439416-52440293(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGT
SmilChr07G001640 Chr07 NC_080393.1:13834469-13834480promoter 内 3869-3880 bp - 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 13834601-13837969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGT
SmilChr04G000148 Chr04 NC_080390.1:1296964-1296975promoter 内 3713-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 1297252-1299763(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr04G001202 Chr04 NC_080390.1:18448756-18448767promoter 内 3711-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 18449046-18454667(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGG
SmilChr05G001822 Chr05 NC_080391.1:18243934-18243945promoter 内 3625-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 18238806-18243569(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCAA
SmilChr06G002906 Chr06 NC_080392.1:41862761-41862772promoter 内 3508-3519 bp + 482 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 41858253-41862279(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr06G003281 Chr06 NC_080392.1:45366989-45367000promoter 内 3228-3239 bp + 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 45361222-45366227(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTAGT
SmilChr05G004273 Chr05 NC_080391.1:56539550-56539561promoter 内 3098-3109 bp - 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56540453-56541265(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAA
SmilChr01G000485 Chr01 NC_080387.1:9923659-9923670promoter 内 2745-2756 bp - 1245 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 9924915-9928587(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr05G004238 Chr05 NC_080391.1:56204320-56204331promoter 内 2713-2724 bp - 1277 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 56201389-56203043(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTT
SmilChr07G001639 Chr07 NC_080393.1:13834469-13834480promoter 内 2662-2673 bp - 1328 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 13829470-13833141(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTT
SmilChr07G002705 Chr07 NC_080393.1:26415352-26415363promoter 内 2597-2608 bp + 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 26416756-26418358(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAT
SmilChr06G000955 Chr06 NC_080392.1:9200712-9200723promoter 内 2348-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 9202365-9204734(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCTT
SmilChr02G004445 Chr02 NC_080388.1:66807362-66807373promoter 内 2338-2349 bp + 1652 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 66804618-66805710(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAA
SmilChr06G000442 Chr06 NC_080392.1:3614288-3614299promoter 内 2330-2341 bp + 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3610290-3612628(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCAA
SmilChr03G000203 Chr03 NC_080389.1:2296662-2296673promoter 内 2324-2335 bp - 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 2298339-2302432(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGT
SmilChr08G000026 Chr08 NC_080394.1:180794-180805promoter 内 2276-2287 bp + 1714 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 175840-179080(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTAGT
SmilChr07G002003 Chr07 NC_080393.1:17767911-17767922promoter 内 2090-2101 bp - 1900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 17761598-17766011(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr02G001273 Chr02 NC_080388.1:23300534-23300545promoter 内 2079-2090 bp + 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 23295339-23298623(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCTC
SmilChr04G000802 Chr04 NC_080390.1:9894478-9894489promoter 内 2014-2025 bp - 1976 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 9890790-9892502(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTT
SmilChr03G004572 Chr03 NC_080389.1:63620746-63620757promoter 内 1983-1994 bp - 2007 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 63622764-63625818(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAAA
SmilChr06G000444 Chr06 NC_080392.1:3614288-3614299promoter 内 1802-1813 bp + 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3616487-3616558(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAT
SmilChr07G000754 Chr07 NC_080393.1:5308847-5308858promoter 内 1781-1792 bp - 2209 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 5311067-5314307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGAGCTGTCCA
SmilChr06G000445 Chr06 NC_080392.1:3614288-3614299promoter 内 1617-1628 bp + 2373 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 3616672-3616743(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTAAT
SmilChr01G005017 Chr01 NC_080387.1:68172422-68172433promoter 内 1436-1447 bp - 2554 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 68167299-68169868(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTT
SmilChr08G003354 Chr08 NC_080394.1:34953162-34953173promoter 内 699-710 bp + 3291 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 34947150-34949871(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAGCTGTCTT
SmilChr01G001417 Chr01 NC_080387.1:27759550-27759561promoter 内 483-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 27755515-27756043(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTCTG
SmilChr04G000801 Chr04 NC_080390.1:9894478-9894489promoter 内 332-343 bp - 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 9889715-9890820(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTT
SmilChr06G003218 Chr06 NC_080392.1:44946301-44946312promoter 内 273-284 bp + 3717 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.0/ 100 2 44950029-44952565(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGTT