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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 67 / 148 下载 TSV

上一页 67 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004539 Chr02 NC_080388.1:67961175-67961188promoter 内 671-684 bp - 3317 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 67964505-67965669(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCGTC
SmilChr05G000848 Chr05 NC_080391.1:6686669-6686682promoter 内 536-549 bp + 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6690134-6693033(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGATACACGTGG
SmilChr05G002449 Chr05 NC_080391.1:27033565-27033578promoter 内 480-493 bp + 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 27037086-27040425(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGATTCACGTGC
SmilChr07G002056 Chr07 NC_080393.1:18696367-18696380promoter 内 317-330 bp + 3671 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18700051-18710246(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCAGTCCACGTGG
SmilChr04G003132 Chr04 NC_080390.1:47914643-47914656promoter 内 274-287 bp - 3714 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 47908485-47910929(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGGTGCACGTGG
SmilChr07G001912 Chr07 NC_080393.1:16529336-16529349promoter 内 167-180 bp - 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 16525443-16525515(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCATTGCACGTGG
SmilChr01G001231 Chr01 NC_080387.1:24732683-24732696promoter 内 92-105 bp + 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 24727627-24728787(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCTCA
SmilChr01G001895 Chr01 NC_080387.1:34057097-34057110promoter 内 55-68 bp - 3933 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 34061043-34062788(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGGTAAA
SmilChr03G004665 Chr03 NC_080389.1:64109362-64109375promoter 内 9-22 bp + 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 64113354-64115424(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAAAACACGTGG
SmilChr01G002598 Chr01 NC_080387.1:44157820-44157833promoter 内 532-545 bp + 3456 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 44146211-44154364(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAGCAG
SmilChr05G001295 Chr05 NC_080391.1:11137133-11137146promoter 内 3981-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 11127563-11137126(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATATGCCACGTGG
SmilChr04G002581 Chr04 NC_080390.1:41178289-41178302promoter 内 3979-3992 bp - 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 41175439-41178280(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGAATCCACGTGG
SmilChr03G004344 Chr03 NC_080389.1:61727923-61727936promoter 内 3935-3948 bp + 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 61727989-61734910(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTAGCCCACGTGG
SmilChr02G004014 Chr02 NC_080388.1:62446981-62446994promoter 内 3844-3857 bp + 144 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 62444752-62446837(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTGGAC
SmilChr01G001636 Chr01 NC_080387.1:30405825-30405838promoter 内 3821-3834 bp - 167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 30406005-30409798(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACGAATT
SmilChr03G004343 Chr03 NC_080389.1:61727923-61727936promoter 内 3535-3548 bp + 453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 61724727-61727470(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGCTAAT
SmilChr05G001483 Chr05 NC_080391.1:13603248-13603261promoter 内 3391-3404 bp - 597 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 13595297-13602651(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGATGTCACGTGT
SmilChr03G002783 Chr03 NC_080389.1:44280141-44280154promoter 内 3031-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 44275773-44279184(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAGTCAT
SmilChr04G000099 Chr04 NC_080390.1:899181-899194promoter 内 2868-2881 bp - 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 900314-904543(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACGGCA
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SmilChr05G001925 Chr05 NC_080391.1:19527745-19527758promoter 内 1220-1233 bp + 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 19521808-19524977(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTTAAA
SmilChr02G000891 Chr02 NC_080388.1:15332103-15332116promoter 内 1106-1119 bp + 2882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 15334998-15339992(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACAACACACGTGG
SmilChr03G003050 Chr03 NC_080389.1:47401016-47401029promoter 内 995-1008 bp + 2993 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 47393487-47398023(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTAACA
SmilChr02G004015 Chr02 NC_080388.1:62446981-62446994promoter 内 238-251 bp + 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 62450744-62453944(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCCAGTCACGTGA
SmilChr04G001955 Chr04 NC_080390.1:31735845-31735858promoter 内 151-164 bp - 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 31739695-31744575(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTTCGCA
SmilChr06G001484 Chr06 NC_080392.1:15821117-15821130promoter 内 99-112 bp + 3889 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 15811774-15817228(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCAGCAG
SmilChr07G002855 Chr07 NC_080393.1:28705016-28705029promoter 内 3987-4000 bp + 1 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 28705030-28706032(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGCACCCACGTGG
SmilChr04G001625 Chr04 NC_080390.1:27012721-27012734promoter 内 3977-3990 bp + 11 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 27012745-27017117(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAATAGCCACGTGG
SmilChr02G003890 Chr02 NC_080388.1:60996475-60996488promoter 内 3951-3964 bp + 37 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60996525-60999185(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAGAACACGTGG
SmilChr01G002885 Chr01 NC_080387.1:47461912-47461925promoter 内 3908-3921 bp + 80 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 47460800-47461832(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCATTG
SmilChr02G002124 Chr02 NC_080388.1:38013148-38013161promoter 内 3891-3904 bp + 97 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38013258-38015255(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTTCCGACACGTGG
SmilChr02G005332 Chr02 NC_080388.1:74155701-74155714promoter 内 3887-3900 bp + 101 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74153415-74155600(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACACAAT
SmilChr03G004588 Chr03 NC_080389.1:63730122-63730135promoter 内 3886-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 63722991-63730020(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAACAGTCACGTGG
SmilChr01G004862 Chr01 NC_080387.1:66763135-66763148promoter 内 3859-3872 bp - 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 66758287-66763006(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTAATTTCACGTGG
SmilChr02G005432 Chr02 NC_080388.1:74746993-74747006promoter 内 3833-3846 bp - 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 74742249-74746838(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGATTCACGTGC
SmilChr02G002360 Chr02 NC_080388.1:41380271-41380284promoter 内 3813-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 41378458-41380096(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGAATCCG
SmilChr02G002889 Chr02 NC_080388.1:49186226-49186239promoter 内 3802-3815 bp - 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 49185492-49186040(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATTAGCGCACGTGG
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SmilChr03G000603 Chr03 NC_080389.1:6681483-6681496promoter 内 3361-3374 bp + 627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 6682123-6685929(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAAAGTCACGTGA
SmilChr04G002365 Chr04 NC_080390.1:38128610-38128623promoter 内 3335-3348 bp - 653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 38129276-38147538(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTGCCA
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SmilChr05G001337 Chr05 NC_080391.1:11772278-11772291promoter 内 3049-3062 bp + 939 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11773230-11788061(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CACGTGTCACGTGT
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SmilChr03G000981 Chr03 NC_080389.1:11082288-11082301promoter 内 2602-2615 bp - 1386 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 11083687-11088021(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCACTACA
SmilChr02G003835 Chr02 NC_080388.1:60042930-60042943promoter 内 2556-2569 bp - 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 1 60033926-60041498(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGATGCACGTGG