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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 68 / 135 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001317 Chr02 NC_080388.1:24486647-24486661promoter 内 539-553 bp + 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 24482259-24483199(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAAGCTTCAC
SmilChr02G000026 Chr02 NC_080388.1:282518-282532promoter 内 518-532 bp - 3469 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 286001-288799(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGATAAGAAAAAA
SmilChr01G001995 Chr01 NC_080387.1:35358978-35358992promoter 内 498-512 bp + 3489 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 35362481-35367022(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTACCCTTATCTAT
SmilChr03G002217 Chr03 NC_080389.1:34929334-34929348promoter 内 437-451 bp - 3550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 34932898-34933236(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGAAGTTA
SmilChr01G003227 Chr01 NC_080387.1:51044864-51044878promoter 内 379-393 bp + 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 51039238-51041256(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGATAAGGTCAGT
SmilChr01G001053 Chr01 NC_080387.1:21870439-21870453promoter 内 276-290 bp - 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 21874164-21877195(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGATAAGAATCAA
SmilChr02G002896 Chr02 NC_080388.1:49236259-49236273promoter 内 254-268 bp - 3733 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 49240006-49243113(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACAGATAAGGAAAGT
SmilChr02G001569 Chr02 NC_080388.1:29108251-29108265promoter 内 244-258 bp + 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29100652-29104508(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGAGATAAGGAAGAA
SmilChr02G005026 Chr02 NC_080388.1:71998793-71998807promoter 内 234-248 bp - 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72002560-72007132(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGGATAAGGAATCT
SmilChr03G000305 Chr03 NC_080389.1:3484484-3484498promoter 内 234-248 bp - 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 3475239-3480731(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACAACCTTATCAGA
SmilChr01G001562 Chr01 NC_080387.1:29641829-29641843promoter 内 205-219 bp + 3782 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 29635032-29638047(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAGTAAA
SmilChr01G000324 Chr01 NC_080387.1:6405421-6405435promoter 内 124-138 bp + 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6409298-6410059(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCGATCTTATCCCA
SmilChr01G002115 Chr01 NC_080387.1:37191390-37191404promoter 内 114-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 37184435-37187517(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGATAAGGTATAT
SmilChr02G005445 Chr02 NC_080388.1:74817434-74817448promoter 内 26-40 bp + 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 74821409-74826421(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCTGTCATTATCCTC
SmilChr02G001490 Chr02 NC_080388.1:27868079-27868093promoter 内 3751-3765 bp - 236 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 7 27864450-27867843(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATTACCCTATCCTC
SmilChr03G002561 Chr03 NC_080389.1:40792575-40792589promoter 内 470-484 bp + 3517 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 5 40796106-40802176(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTATTATTATCCTT
SmilChr03G001452 Chr03 NC_080389.1:17331757-17331771promoter 内 2823-2837 bp - 1164 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 17324997-17330593(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGCTCCTTATCTCC
SmilChr03G002623 Chr03 NC_080389.1:41635131-41635145promoter 内 2190-2204 bp + 1797 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 41630946-41633334(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATAGATAAGGCTTAC
SmilChr03G001944 Chr03 NC_080389.1:27694857-27694871promoter 内 1034-1048 bp + 2953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 27697824-27700724(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AACGACGTTATCCTT
SmilChr01G004945 Chr01 NC_080387.1:67557509-67557523promoter 内 955-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 67552464-67554477(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGGAACCTTATCTGA
SmilChr02G002142 Chr02 NC_080388.1:38539751-38539765promoter 内 412-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 38543340-38546017(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAGGATAACGTCATA
SmilChr02G004699 Chr02 NC_080388.1:69310776-69310790promoter 内 3961-3975 bp - 26 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 69305938-69310750(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTATACCTTATCAAA
SmilChr01G003844 Chr01 NC_080387.1:56766201-56766215promoter 内 3745-3759 bp + 242 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 56766457-56768587(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACTTTCCTTATCAAA
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SmilChr01G004501 Chr01 NC_080387.1:63118152-63118166promoter 内 3294-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 63118859-63119747(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACTTTCCTTATCAAA
SmilChr01G004576 Chr01 NC_080387.1:63806375-63806389promoter 内 3225-3239 bp + 762 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 63798588-63805613(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGGATAAGATAAAA
SmilChr01G005499 Chr01 NC_080387.1:71882454-71882468promoter 内 3096-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 71883359-71887955(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGATAAGGTCATT
SmilChr03G001727 Chr03 NC_080389.1:23222195-23222209promoter 内 2529-2543 bp + 1458 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 23217959-23220737(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGAGAATT
SmilChr01G000238 Chr01 NC_080387.1:4463350-4463364promoter 内 2501-2515 bp - 1486 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 4460922-4461864(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACTTTCCTTATCAAA
SmilChr02G003250 Chr02 NC_080388.1:53773851-53773865promoter 内 2076-2090 bp + 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 53775776-53778754(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCAAGCCTTATCTAA
SmilChr02G001252 Chr02 NC_080388.1:23018355-23018369promoter 内 1818-1832 bp - 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 23020538-23023699(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCGGATAAGGCTTTT
SmilChr03G000703 Chr03 NC_080389.1:7848689-7848703promoter 内 1682-1696 bp + 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 7841878-7846384(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGAGAATT
SmilChr01G002411 Chr01 NC_080387.1:41476472-41476486promoter 内 1668-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 41478805-41478911(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCGGATAAGCATATC
SmilChr03G000523 Chr03 NC_080389.1:5617987-5618001promoter 内 1493-1507 bp + 2494 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 5620495-5621866(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATTTGCTTATCCAT
SmilChr01G001220 Chr01 NC_080387.1:24474824-24474838promoter 内 1166-1180 bp - 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 24477659-24478409(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAAGATGAGGTTAAG
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SmilChr01G001319 Chr01 NC_080387.1:26222114-26222128promoter 内 930-944 bp + 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 26216407-26219057(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGGCAAT
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SmilChr03G002386 Chr03 NC_080389.1:37771050-37771064promoter 内 658-672 bp + 3329 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 37774393-37777132(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACCACCCTTATCCCA
SmilChr01G005144 Chr01 NC_080387.1:69252541-69252555promoter 内 640-654 bp - 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 69234499-69249194(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTTTCCTTATCATT
SmilChr02G003600 Chr02 NC_080388.1:57176804-57176818promoter 内 561-575 bp + 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 57180244-57180920(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATCTTTCTTATCCCA
SmilChr01G000653 Chr01 NC_080387.1:14521458-14521472promoter 内 548-562 bp - 3439 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 14516943-14518019(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CAGCACCTTATCATT
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SmilChr01G005615 Chr01 NC_080387.1:72670288-72670302promoter 内 3609-3623 bp - 378 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 72670680-72671653(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGTTTGAA
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SmilChr02G002949 Chr02 NC_080388.1:50030939-50030953promoter 内 3490-3504 bp - 497 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50029921-50030442(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATGATCTTATCCCA