靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。
下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。
| 转录因子 ID | Family | Motifs | 候选靶基因 | 候选位点 | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00592 |
8519 | 9901 | 查靶基因 | |
| ARR-B | 1MP00010 |
8344 | 9778 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00059 |
8333 | 9940 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00296 |
8304 | 9873 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00114 |
8151 | 9897 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00408 |
8149 | 9902 | 查靶基因 | |
| Nin-like | 1MP00449 |
8096 | 9453 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00209 |
8083 | 9910 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00627 |
8075 | 9835 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00450 |
8044 | 9901 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00558 |
8044 | 9762 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00096 |
8019 | 9914 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00476 |
7981 | 9904 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00221 |
7965 | 9903 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00069 |
7882 | 9917 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00406 |
7839 | 9917 | 查靶基因 | |
| TALE | 1MP00670 |
7758 | 9906 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00555 |
7648 | 9805 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00021 |
7629 | 9812 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00132 |
7583 | 9926 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00609 |
7575 | 9941 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00529 |
7559 | 9247 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00510 |
7526 | 9799 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00058 |
7440 | 9855 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00303 |
7416 | 9868 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00565 |
7412 | 9785 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00026 |
7408 | 9854 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00071 |
7408 | 9764 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00033 |
7406 | 9827 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00074 |
7396 | 9969 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00216 |
7342 | 9832 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00539 |
7338 | 9848 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00574 |
7302 | 9846 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00464 |
7299 | 9864 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00315 |
7291 | 9567 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00525 |
7235 | 9838 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00171 |
7182 | 9833 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00506 |
7173 | 9818 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00272 |
7172 | 9889 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00184 |
7147 | 9840 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00647 |
7133 | 9953 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00485 |
7130 | 8059 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00134 |
7078 | 8676 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00312 |
7006 | 8490 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00564 |
6984 | 9893 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00022 |
6959 | 9720 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00040 |
6920 | 9919 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00151 |
6907 | 9976 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00455 |
6900 | 9792 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00482 |
6899 | 8940 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00291 |
6894 | 9321 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00307 |
6893 | 9755 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00195 |
6878 | 9832 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00388 |
6870 | 9774 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00318 |
6849 | 9413 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00633 |
6833 | 8026 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00308 |
6805 | 9826 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00082 |
6784 | 9435 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00080 |
6766 | 9850 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00028 |
6764 | 9024 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00191 |
6736 | 9690 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00081 |
6729 | 9942 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00500 |
6697 | 9681 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00452 |
6671 | 7783 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00531 |
6663 | 9784 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00200 |
6661 | 9930 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00034 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00660 |
6653 | 9929 | 查靶基因 | |
| MYB | 1MP00055 |
6638 | 9685 | 查靶基因 | |
| SBP | 1MP00634 |
6619 | 7771 | 查靶基因 | |
| bHLH | 1MP00035 |
6618 | 9903 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00568 |
6611 | 9696 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00039 |
6610 | 9936 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00284 |
6552 | 9774 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00422 |
6535 | 9791 | 查靶基因 | |
| ARF | 1MP00153 |
6534 | 9706 | 查靶基因 | |
| YABBY | 1MP00620 |
6504 | 9844 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00169 |
6498 | 7295 | 查靶基因 | |
| G2-like | 1MP00252 |
6478 | 9780 | 查靶基因 | |
| NAC | 1MP00108 |
6458 | 9810 | 查靶基因 | |
| TCP | 1MP00062 |
6454 | 7249 | 查靶基因 | |
| RAV | 1MP00024 |
6450 | 9853 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00167 |
6439 | 9756 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00416 |
6433 | 9716 | 查靶基因 | |
| C2H2 | 1MP00608 |
6398 | 9817 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00240 |
6368 | 9978 | 查靶基因 | |
| MYB_related | 1MP00607 |
6362 | 9718 | 查靶基因 | |
| Dof | 1MP00402 |
6278 | 9875 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00409 |
6252 | 8429 | 查靶基因 | |
| GRAS | 1MP00611 |
6232 | 9807 | 查靶基因 | |
| bZIP | 1MP00648 |
6170 | 9939 | 查靶基因 | |
| ERF | 1MP00120 |
6144 | 7514 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00251 |
6140 | 9713 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00077 |
6125 | 9815 | 查靶基因 | |
| GATA | 1MP00130 |
6015 | 9821 | 查靶基因 | |
| MIKC_MADS | 1MP00508 |
5979 | 7481 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00260 |
5932 | 9706 | 查靶基因 | |
| HD-ZIP | 1MP00013 |
5927 | 9712 | 查靶基因 | |
| WRKY | 1MP00299 |
5919 | 9699 | 查靶基因 |
输入: SmilChr01G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90
| TF ID | 新 Gene ID | 家族 | Protein | Motif | 共识序列 |
|---|---|---|---|---|---|
SMil_00007215-RA_Salv |
SmilChr01G003955 |
WRKY | XP_057779712.1 |
MP00450 |
AGCGTTGACTTTTT |
9901 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 69 / 161 下载 TSV
| 靶基因 | 染色体 | 最佳结合位点 | 链方向 | 靶基因上游距离 | 结合可能性 | 启动子命中位点 | 基因区间 | TF | Motif | 匹配序列 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SmilChr08G000115 |
Chr08 | NC_080394.1:722646-722659promoter 内 3713-3726 bp |
- | 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 717236-722371(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATCTTTGACTTTAG |
SmilChr02G003668 |
Chr02 | NC_080388.1:58072388-58072401promoter 内 3712-3725 bp |
- | 276 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 58067179-58072112(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr06G002097 |
Chr06 | NC_080392.1:27913310-27913323promoter 内 3685-3698 bp |
+ | 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 27906980-27913007(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAATAT |
SmilChr08G000116 |
Chr08 | NC_080394.1:722646-722659promoter 内 3617-3630 bp |
- | 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 723030-725755(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
CTAAAGTCAAAGAT |
SmilChr03G003123 |
Chr03 | NC_080389.1:48412352-48412365promoter 内 3589-3602 bp |
- | 399 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 48410416-48411953(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATCTTTGACTTTAG |
SmilChr03G003244 |
Chr03 | NC_080389.1:50334417-50334430promoter 内 3588-3601 bp |
- | 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 50331753-50334017(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GAATTTGACTTTTT |
SmilChr03G000231 |
Chr03 | NC_080389.1:2747825-2747838promoter 内 3585-3598 bp |
- | 403 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 2745107-2747422(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr02G005558 |
Chr02 | NC_080388.1:75536814-75536827promoter 内 3497-3510 bp |
+ | 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 75534486-75536323(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAACAT |
SmilChr03G004246 |
Chr03 | NC_080389.1:60964063-60964076promoter 内 3477-3490 bp |
- | 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 60963097-60963552(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr01G002380 |
Chr01 | NC_080387.1:41001931-41001944promoter 内 3473-3486 bp |
- | 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 41002459-41005081(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAACAT |
SmilChr03G004168 |
Chr03 | NC_080389.1:60440232-60440245promoter 内 3473-3486 bp |
+ | 515 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 60438161-60439717(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ACCAAGTCAACGAG |
SmilChr01G001183 |
Chr01 | NC_080387.1:23896358-23896371promoter 内 3427-3440 bp |
- | 561 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 23890170-23895797(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr04G000413 |
Chr04 | NC_080390.1:4327587-4327600promoter 内 3392-3405 bp |
+ | 596 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 4328196-4338998(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AGGGTTGACTTACT |
SmilChr01G005716 |
Chr01 | NC_080387.1:73365539-73365552promoter 内 3322-3335 bp |
+ | 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 73366218-73368088(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GCCGTTGACATTTA |
SmilChr02G005559 |
Chr02 | NC_080388.1:75536814-75536827promoter 内 3245-3258 bp |
+ | 743 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 75537570-75540144(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATGTTTGACTTTTT |
SmilChr04G003819 |
Chr04 | NC_080390.1:54337672-54337685promoter 内 3181-3194 bp |
+ | 807 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 54338492-54342182(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATCTTTGACTTTAG |
SmilChr03G004247 |
Chr03 | NC_080389.1:60964063-60964076promoter 内 3160-3173 bp |
- | 828 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 60964904-60965829(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAATAT |
SmilChr05G001077 |
Chr05 | NC_080391.1:8959879-8959892promoter 内 3091-3104 bp |
- | 897 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 8956587-8958982(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATGTTTGACTTTTT |
SmilChr03G001856 |
Chr03 | NC_080389.1:25588033-25588046promoter 内 3090-3103 bp |
+ | 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 25588944-25589594(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
CCCTTTGACTTTAG |
SmilChr03G003482 |
Chr03 | NC_080389.1:53379493-53379506promoter 内 3005-3018 bp |
- | 983 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 53375085-53378510(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AGCGTTGACTCTCC |
SmilChr07G002518 |
Chr07 | NC_080393.1:23859009-23859022promoter 内 2997-3010 bp |
+ | 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 23860013-23860782(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr07G002436 |
Chr07 | NC_080393.1:22776322-22776335promoter 内 2992-3005 bp |
+ | 996 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 22777331-22778311(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATGTTTGACTTTTT |
SmilChr06G000782 |
Chr06 | NC_080392.1:7324121-7324134promoter 内 2943-2956 bp |
+ | 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 7320730-7323076(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAATAT |
SmilChr05G000052 |
Chr05 | NC_080391.1:245878-245891promoter 内 2933-2946 bp |
+ | 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 246946-248099(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GAGTTTGACTTTTT |
SmilChr01G006022 |
Chr01 | NC_080387.1:75806748-75806761promoter 内 2932-2945 bp |
- | 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 75800542-75805692(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TTTGTTGACTTTGA |
SmilChr05G000224 |
Chr05 | NC_080391.1:1756244-1756257promoter 内 2885-2898 bp |
+ | 1103 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 1752819-1755141(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TAAAAGTCAAACCT |
SmilChr04G000521 |
Chr04 | NC_080390.1:5746249-5746262promoter 内 2877-2890 bp |
- | 1111 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 5738820-5745138(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GAGTTTGACTTTTT |
SmilChr06G001284 |
Chr06 | NC_080392.1:13421959-13421972promoter 内 2793-2806 bp |
+ | 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 13423167-13425705(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TTTGTTGACTTTGA |
SmilChr03G002472 |
Chr03 | NC_080389.1:39180962-39180975promoter 内 2598-2611 bp |
- | 1390 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 39182365-39183194(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TAAAAGTCAAATCT |
SmilChr01G004018 |
Chr01 | NC_080387.1:58569118-58569131promoter 内 2568-2581 bp |
+ | 1420 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 58570551-58571947(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TTCGTTGACCTTCA |
SmilChr04G004170 |
Chr04 | NC_080390.1:56341697-56341710promoter 内 2567-2580 bp |
- | 1421 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 56343131-56349827(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TGAAGGTCAACGAA |
SmilChr01G004392 |
Chr01 | NC_080387.1:62094744-62094757promoter 内 2551-2564 bp |
+ | 1437 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 62091011-62093307(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAATTC |
SmilChr06G002187 |
Chr06 | NC_080392.1:30248674-30248687promoter 内 2452-2465 bp |
+ | 1536 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 30250223-30251270(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr06G002885 |
Chr06 | NC_080392.1:41680942-41680955promoter 内 2416-2429 bp |
- | 1572 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 41677201-41679370(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GACGTTGACTTGCG |
SmilChr04G000522 |
Chr04 | NC_080390.1:5746249-5746262promoter 内 2406-2419 bp |
- | 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 5747844-5748431(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAACTC |
SmilChr01G003121 |
Chr01 | NC_080387.1:50035253-50035266promoter 内 2381-2394 bp |
+ | 1607 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 50031791-50033646(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TATAAGTCAACTAC |
SmilChr02G005344 |
Chr02 | NC_080388.1:74265291-74265304promoter 内 2356-2369 bp |
- | 1632 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 74257641-74263659(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GAATTTGACTTTTT |
SmilChr06G001283 |
Chr06 | NC_080392.1:13421959-13421972promoter 内 2179-2192 bp |
+ | 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 13418809-13420150(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TCAAAGTCAACAAA |
SmilChr02G001621 |
Chr02 | NC_080388.1:30151843-30151856promoter 内 2112-2125 bp |
- | 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 30153732-30155286(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TGAAAGTCAACAAG |
SmilChr01G003074 |
Chr01 | NC_080387.1:49577912-49577925promoter 内 2073-2086 bp |
+ | 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 49579840-49584264(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
CTTGTTGACTTTCA |
SmilChr06G000039 |
Chr06 | NC_080392.1:326669-326682promoter 内 2037-2050 bp |
+ | 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 328633-334006(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GAATTTGACTTTTT |
SmilChr05G001028 |
Chr05 | NC_080391.1:8435162-8435175promoter 内 2015-2028 bp |
- | 1973 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 8430870-8433189(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
GAATTTGACTTTTT |
SmilChr02G004183 |
Chr02 | NC_080388.1:64152783-64152796promoter 内 2002-2015 bp |
+ | 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 64148736-64150797(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAATAT |
SmilChr02G002071 |
Chr02 | NC_080388.1:37294683-37294696promoter 内 2000-2013 bp |
- | 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 37296684-37298030(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TAAAAGTCAAATCT |
SmilChr06G000171 |
Chr06 | NC_080392.1:1190841-1190854promoter 内 1868-1881 bp |
+ | 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 1180107-1188721(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AAAAAGTCAAACAT |
SmilChr05G002073 |
Chr05 | NC_080391.1:21622380-21622393promoter 内 1809-1822 bp |
+ | 2179 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 21624572-21626842(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATATTTGACTTTTT |
SmilChr05G000111 |
Chr05 | NC_080391.1:730203-730216promoter 内 1725-1738 bp |
+ | 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 732479-733183(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
AGCATTGACTTTTG |
SmilChr01G005784 |
Chr01 | NC_080387.1:73940291-73940304promoter 内 1657-1670 bp |
+ | 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 73937889-73937960(-) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
ATCAAGTCAACGCT |
SmilChr02G000405 |
Chr02 | NC_080388.1:5015146-5015159promoter 内 1618-1631 bp |
+ | 2370 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 5017529-5022524(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TTCGTTGACTTAAT |
SmilChr07G000053 |
Chr07 | NC_080393.1:228475-228488promoter 内 1617-1630 bp |
- | 2371 bp 位于靶基因 TSS 上游 | 92.5/ 100 | 1 | 230859-231567(+) |
SMil_00007215-RA_Salv |
MP00450 |
TGAAAGTCAAAGGA |