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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G001885; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020124-RA_Salv SmilChr01G001885 WRKY XP_057806790.1 MP00171 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9833 个结合位点 7182 个候选靶基因 第 7 / 144 下载 TSV

上一页 7 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003086 Chr02 NC_080388.1:51752936-51752948promoter 内 2608-2620 bp + 1381 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 51754329-51754979(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAAGTCAACGAA
SmilChr02G000582 Chr02 NC_080388.1:8381009-8381021promoter 内 2309-2321 bp + 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 8382701-8383882(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ACAAGTCAACGCT
SmilChr03G001951 Chr03 NC_080389.1:27829016-27829028promoter 内 2245-2257 bp - 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 27830772-27838316(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGCGTTGACTTGT
SmilChr02G000910 Chr02 NC_080388.1:15747409-15747421promoter 内 1289-1301 bp + 2700 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 15743999-15744709(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 ATCGTTGACTTTA
SmilChr01G003695 Chr01 NC_080387.1:55313376-55313388promoter 内 974-986 bp - 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 55305291-55310361(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TAAGGTCAACGCC
SmilChr02G002967 Chr02 NC_080388.1:50192839-50192851promoter 内 653-665 bp - 3336 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 50182192-50189503(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AGAAGTCAACGAC
SmilChr03G000933 Chr03 NC_080389.1:10636455-10636467promoter 内 2567-2579 bp - 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 10631938-10635033(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTCC
SmilChr02G004627 Chr02 NC_080388.1:68767565-68767577promoter 内 3574-3586 bp - 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 68763865-68767150(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CCAAGTCAACGCT
SmilChr03G003738 Chr03 NC_080389.1:56397067-56397079promoter 内 3516-3528 bp - 473 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 56389572-56396594(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTCC
SmilChr01G000131 Chr01 NC_080387.1:2203862-2203874promoter 内 3213-3225 bp + 776 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 2199994-2203086(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTTTT
SmilChr03G003357 Chr03 NC_080389.1:51908700-51908712promoter 内 3189-3201 bp - 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 51890133-51907900(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTCC
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46888813-46888825promoter 内 2871-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 46882839-46887695(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTTCT
SmilChr01G001459 Chr01 NC_080387.1:28353628-28353640promoter 内 1149-1161 bp + 2840 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 28356480-28359703(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTCC
SmilChr02G004851 Chr02 NC_080388.1:70670497-70670509promoter 内 846-858 bp - 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 70673652-70678006(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTTTT
SmilChr02G002018 Chr02 NC_080388.1:36380445-36380457promoter 内 663-675 bp - 3326 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 36383783-36388678(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTTTT
SmilChr02G002923 Chr02 NC_080388.1:49632033-49632045promoter 内 2414-2426 bp + 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 49629524-49630458(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCGGTTGACTTTG
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SmilChr02G002885 Chr02 NC_080388.1:49163887-49163899promoter 内 1460-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 49159389-49161358(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTCGTTGACTATT
SmilChr02G002975 Chr02 NC_080388.1:50271730-50271742promoter 内 1415-1427 bp - 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50274316-50276218(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTCGTTGACTATT
SmilChr04G000684 Chr04 NC_080390.1:7984174-7984186promoter 内 364-376 bp + 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 7979145-7980549(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGAGTTGACTTTG
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SmilChr01G001682 Chr01 NC_080387.1:31010392-31010404promoter 内 1102-1114 bp + 2887 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 31013291-31016406(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAGAGTCAACGCC
SmilChr01G001680 Chr01 NC_080387.1:31010392-31010404promoter 内 903-915 bp + 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 31005862-31007306(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGCGTTGACTCTG
SmilChr03G000212 Chr03 NC_080389.1:2468500-2468512promoter 内 399-411 bp + 3590 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 2472102-2472657(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AAAAGTCAACTGC
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SmilChr03G003343 Chr03 NC_080389.1:51767698-51767710promoter 内 1717-1729 bp - 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 51757803-51765426(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CAGAGTCAACGCC
SmilChr04G001898 Chr04 NC_080390.1:31006451-31006463promoter 内 1486-1498 bp - 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 31008966-31011243(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GGCGTTGACTCTG
SmilChr03G001503 Chr03 NC_080389.1:18389985-18389997promoter 内 1320-1332 bp + 2669 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 18383325-18387316(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCAGTTGACTTTT
SmilChr04G002782 Chr04 NC_080390.1:43626193-43626205promoter 内 3894-3906 bp - 95 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 43624422-43626098(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AACAGTCAACGCC
SmilChr04G000408 Chr04 NC_080390.1:4260645-4260657promoter 内 3724-3736 bp - 265 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4260922-4284704(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCAGTTGACTTTT
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SmilChr04G000402 Chr04 NC_080390.1:4195143-4195155promoter 内 3118-3130 bp - 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 4196026-4201934(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCAGTTGACTTTT
SmilChr03G001175 Chr03 NC_080389.1:13507595-13507607promoter 内 2933-2945 bp + 1056 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 13505637-13506539(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCAGTTGACTTTT
SmilChr02G003527 Chr02 NC_080388.1:56420880-56420892promoter 内 2632-2644 bp - 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 56422249-56426658(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 CGCGTTGACTATT
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SmilChr01G005661 Chr01 NC_080387.1:72944712-72944724promoter 内 1385-1397 bp + 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 72947328-72949283(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GCAAGTCAACGCC
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SmilChr01G002699 Chr01 NC_080387.1:45257551-45257563promoter 内 288-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 45261264-45263971(+) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 TGCGTTGACTTCG
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SmilChr03G003206 Chr03 NC_080389.1:49607460-49607472promoter 内 1236-1248 bp - 2753 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 49602347-49604707(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GAAGGTCAACGAC
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SmilChr01G003550 Chr01 NC_080387.1:54106496-54106508promoter 内 3635-3647 bp + 354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 54104430-54106142(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 GTCGTTGACCTTC
SmilChr01G002108 Chr01 NC_080387.1:37144995-37145007promoter 内 2944-2956 bp - 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 37141366-37143950(-) SMil_00020124-RA_Salv MP00171 AATAGTCAACGCA