转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004607; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002089-RA_Salv SmilChr02G004607 C2H2 XP_057791470.1 MP00608 AAAAACAGAGCA

可能结合的靶基因

9817 个结合位点 6398 个候选靶基因 第 70 / 128 下载 TSV

上一页 70 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004118 Chr02 NC_080388.1:63468139-63468150promoter 内 710-721 bp + 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63471430-63473427(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGAAACAGAATG
SmilChr02G005080 Chr02 NC_080388.1:72426829-72426840promoter 内 701-712 bp - 3289 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 72430129-72430892(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATTCTGTTTCT
SmilChr01G004554 Chr01 NC_080387.1:63644605-63644616promoter 内 622-633 bp + 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 63638057-63641237(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATTCTGTTTTT
SmilChr02G004765 Chr02 NC_080388.1:69840650-69840661promoter 内 231-242 bp + 3759 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 69834281-69836891(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATTCTGTTTTT
SmilChr03G001417 Chr03 NC_080389.1:16816972-16816983promoter 内 227-238 bp + 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16810959-16813209(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CATTCTGTTTTT
SmilChr03G001691 Chr03 NC_080389.1:22425139-22425150promoter 内 207-218 bp - 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22428933-22429433(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GCTTCTGTTTTC
SmilChr01G002439 Chr01 NC_080387.1:41977207-41977218promoter 内 810-821 bp + 3180 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 41968455-41974027(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTATTT
SmilChr01G000921 Chr01 NC_080387.1:19473497-19473508promoter 内 681-692 bp - 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 19476817-19479987(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTACCT
SmilChr01G004393 Chr01 NC_080387.1:62102175-62102186promoter 内 3867-3878 bp - 123 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62098704-62102052(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCG
SmilChr01G000581 Chr01 NC_080387.1:12297529-12297540promoter 内 3815-3826 bp + 175 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 12292868-12297354(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr01G001573 Chr01 NC_080387.1:29773954-29773965promoter 内 3346-3357 bp - 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 29774609-29781263(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr03G001654 Chr03 NC_080389.1:21501180-21501191promoter 内 3237-3248 bp + 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 21501944-21504123(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTAACAGAGGA
SmilChr02G002895 Chr02 NC_080388.1:49222325-49222336promoter 内 2558-2569 bp + 1432 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 49223768-49231532(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTAAACAGAGGA
SmilChr01G005831 Chr01 NC_080387.1:74319000-74319011promoter 内 2509-2520 bp - 1481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 74320492-74322068(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr02G005101 Chr02 NC_080388.1:72550246-72550257promoter 内 2181-2192 bp - 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 72552066-72559973(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATCT
SmilChr01G006087 Chr01 NC_080387.1:76367725-76367736promoter 内 2084-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 76354954-76365819(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTAC
SmilChr02G002700 Chr02 NC_080388.1:46803735-46803746promoter 内 1992-2003 bp - 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 46797249-46801737(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTAAACAGAGGA
SmilChr02G003674 Chr02 NC_080388.1:58125629-58125640promoter 内 1839-1850 bp - 2151 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 58127791-58131837(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTCTGTATTT
SmilChr02G003840 Chr02 NC_080388.1:60119160-60119171promoter 内 1684-1695 bp + 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 60113846-60116854(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr02G005099 Chr02 NC_080388.1:72550246-72550257promoter 内 1663-1674 bp - 2327 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 72543497-72547919(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGATGCAGAGCA
SmilChr02G000681 Chr02 NC_080388.1:10745158-10745169promoter 内 1131-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 10718197-10742299(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTACCT
SmilChr01G004394 Chr01 NC_080387.1:62102175-62102186promoter 内 1113-1124 bp - 2877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62105063-62109085(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr01G004402 Chr01 NC_080387.1:62133478-62133489promoter 内 942-953 bp + 3048 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 62136537-62138406(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTAACAGAGGA
SmilChr01G000265 Chr01 NC_080387.1:5113856-5113867promoter 内 741-752 bp - 3249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 5117116-5122012(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTACCT
SmilChr03G001411 Chr03 NC_080389.1:16772452-16772463promoter 内 720-731 bp + 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 16775733-16779393(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 GTAAACAGAGGA
SmilChr02G002893 Chr02 NC_080388.1:49222325-49222336promoter 内 76-87 bp + 3914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 49216985-49218411(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTAC
SmilChr01G002223 Chr01 NC_080387.1:38662876-38662887promoter 内 3857-3868 bp - 133 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 38663020-38663538(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTACT
SmilChr01G005838 Chr01 NC_080387.1:74395853-74395864promoter 内 3444-3455 bp + 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 74390692-74395307(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr02G003236 Chr02 NC_080388.1:53635404-53635415promoter 内 3081-3092 bp - 909 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 53636324-53638451(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATCT
SmilChr02G004265 Chr02 NC_080388.1:64860209-64860220promoter 内 3002-3013 bp - 988 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 64847257-64859221(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCG
SmilChr01G000986 Chr01 NC_080387.1:20880488-20880499promoter 内 2806-2817 bp + 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 20874144-20879304(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTACT
SmilChr03G000764 Chr03 NC_080389.1:8736787-8736798promoter 内 2764-2775 bp - 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8738024-8741270(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGCATCT
SmilChr02G003417 Chr02 NC_080388.1:55401429-55401440promoter 内 2633-2644 bp + 1357 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55402797-55406595(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 ATAAACAGAGCG
SmilChr03G001853 Chr03 NC_080389.1:25519449-25519460promoter 内 2624-2635 bp - 1366 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 25513957-25518083(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGTAACAGAGGA
SmilChr02G002604 Chr02 NC_080388.1:45178418-45178429promoter 内 2606-2617 bp - 1384 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 45179813-45182605(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr02G002649 Chr02 NC_080388.1:45899067-45899078promoter 内 2309-2320 bp - 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 45900759-45903568(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr02G004772 Chr02 NC_080388.1:69890406-69890417promoter 内 2272-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 69892135-69895808(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGATGCAGAGCA
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SmilChr02G001733 Chr02 NC_080388.1:31861124-31861135promoter 内 2124-2135 bp - 1866 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 31863001-31863504(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTACCT
SmilChr02G001474 Chr02 NC_080388.1:27526474-27526485promoter 内 2074-2085 bp - 1916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 27518785-27524558(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AAAAACAAAGCG
SmilChr02G001052 Chr02 NC_080388.1:18776639-18776650promoter 内 2012-2023 bp + 1978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 18772030-18774661(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTTAC
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SmilChr01G000591 Chr01 NC_080387.1:12875720-12875731promoter 内 1778-1789 bp + 2212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 12877943-12878883(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGATGCAGAGCA
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SmilChr02G001243 Chr02 NC_080388.1:22820756-22820767promoter 内 1583-1594 bp + 2407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22815321-22818349(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TGCTCTGTACCT
SmilChr01G004809 Chr01 NC_080387.1:66292878-66292889promoter 内 1539-1550 bp - 2451 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66295340-66297444(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 CGCTTTGTTTTT
SmilChr02G004903 Chr02 NC_080388.1:71021365-71021376promoter 内 1271-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 71024095-71025732(+) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 TCCTCTGTTACT
SmilChr01G000443 Chr01 NC_080387.1:9002758-9002769promoter 内 1243-1254 bp - 2747 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 8995181-9000011(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGGTACAGAGCA
SmilChr01G000586 Chr01 NC_080387.1:12670440-12670451promoter 内 1222-1233 bp - 2768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 12667289-12667672(-) SMil_00002089-RA_Salv MP00608 AGATGCAGAGCA