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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G000949; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003681-RA_Salv SmilChr02G000949 bZIP XP_057795176.1 MP00318 TGCCACGTCAGCATT

可能结合的靶基因

9413 个结合位点 6849 个候选靶基因 第 71 / 137 下载 TSV

上一页 71 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003902 Chr02 NC_080388.1:61110118-61110132promoter 内 3124-3138 bp + 863 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 61110995-61114315(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAATATT
SmilChr05G000414 Chr05 NC_080391.1:3132770-3132784promoter 内 3070-3084 bp - 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3133701-3136439(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTGCTGACGTGGGA
SmilChr05G003785 Chr05 NC_080391.1:51169881-51169895promoter 内 3056-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51170826-51173667(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATCCACGTCGGCATA
SmilChr03G004647 Chr03 NC_080389.1:64024193-64024207promoter 内 2927-2941 bp - 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64020398-64023133(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTCATCGAG
SmilChr08G000536 Chr08 NC_080394.1:3901055-3901069promoter 内 2857-2871 bp + 1130 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3899042-3899925(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AACGCAGACGTGGAA
SmilChr03G003364 Chr03 NC_080389.1:51987593-51987607promoter 内 2840-2854 bp - 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51988754-51991630(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAAAATCACGTGGCA
SmilChr01G003401 Chr01 NC_080387.1:52712098-52712112promoter 内 2763-2777 bp + 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 52709186-52710874(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCATCCTACGTGGCA
SmilChr06G003148 Chr06 NC_080392.1:44506066-44506080promoter 内 2663-2677 bp + 1324 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44502839-44504742(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GTTAGAGACGTGGCG
SmilChr03G001539 Chr03 NC_080389.1:19303605-19303619promoter 内 2636-2650 bp + 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19296365-19302254(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CATTCTGACGTGGAG
SmilChr05G000392 Chr05 NC_080391.1:2953879-2953893promoter 内 2587-2601 bp - 1400 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2955293-2956192(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGTGCTGACGTGGAT
SmilChr01G003403 Chr01 NC_080387.1:52712098-52712112promoter 内 2477-2491 bp + 1510 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 52713622-52717399(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTAGGATGA
SmilChr03G001930 Chr03 NC_080389.1:27096437-27096451promoter 内 2444-2458 bp + 1543 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 27097994-27106553(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAATTCC
SmilChr03G004434 Chr03 NC_080389.1:62472173-62472187promoter 内 2306-2320 bp - 1681 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 62473868-62474935(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGAGCTGACGTGTAA
SmilChr05G002610 Chr05 NC_080391.1:29356955-29356969promoter 内 2259-2273 bp - 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 29358697-29365128(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AAATTCGACGTGGCG
SmilChr08G001783 Chr08 NC_080394.1:15031135-15031149promoter 内 2159-2173 bp + 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 15032977-15036647(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGACGTGA
SmilChr01G005345 Chr01 NC_080387.1:70678804-70678818promoter 内 2150-2164 bp + 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 70672390-70676967(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GATGATTACGTGGCT
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SmilChr04G003698 Chr04 NC_080390.1:53348196-53348210promoter 内 2095-2109 bp - 1892 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 53350102-53352148(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGAAATGACGTGGCG
SmilChr01G000149 Chr01 NC_080387.1:2552904-2552918promoter 内 2065-2079 bp + 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2554840-2563158(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTATTCCTC
SmilChr01G003745 Chr01 NC_080387.1:55791303-55791317promoter 内 1869-1883 bp - 2118 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55786099-55789185(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTACACGTCAGCTTT
SmilChr08G000080 Chr08 NC_080394.1:461084-461098promoter 内 1633-1647 bp + 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 463452-466888(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAATTTC
SmilChr05G000508 Chr05 NC_080391.1:3930689-3930703promoter 内 1603-1617 bp - 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3933087-3933249(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCGTCCACGTGGCG
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SmilChr01G003746 Chr01 NC_080387.1:55791303-55791317promoter 内 1496-1510 bp - 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55786538-55788812(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TTACACGTCAGCTTT
SmilChr02G000193 Chr02 NC_080388.1:2410050-2410064promoter 内 1280-1294 bp - 2707 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2412771-2413870(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GACGTTGACGTGGCT
SmilChr04G002100 Chr04 NC_080390.1:33895623-33895637promoter 内 1206-1220 bp + 2781 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33892421-33892842(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CATGCTGACGTGGAT
SmilChr01G002459 Chr01 NC_080387.1:42227834-42227848promoter 内 1176-1190 bp + 2811 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 42230659-42233117(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTCACGA
SmilChr01G000638 Chr01 NC_080387.1:14358061-14358075promoter 内 998-1012 bp + 2989 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 14361064-14363497(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGTTATCT
SmilChr03G001200 Chr03 NC_080389.1:13835800-13835814promoter 内 953-967 bp + 3034 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 13838848-13840439(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCATTCCG
SmilChr05G000412 Chr05 NC_080391.1:3132770-3132784promoter 内 826-840 bp - 3161 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 3121589-3129609(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TCCCACGTCAGCAAC
SmilChr04G003465 Chr04 NC_080390.1:51133637-51133651promoter 内 718-732 bp - 3269 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51136920-51144915(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGAAGAGACGTGGCA
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SmilChr02G002844 Chr02 NC_080388.1:48574565-48574579promoter 内 484-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48578082-48580292(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGCCACGTGGGACCT
SmilChr06G000119 Chr06 NC_080392.1:836525-836539promoter 内 448-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 829041-832986(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGCCACGTCAGTCCA
SmilChr08G003314 Chr08 NC_080394.1:34356547-34356561promoter 内 404-418 bp + 3583 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34350241-34352964(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 ATGGGTGACGTGGAC
SmilChr05G003541 Chr05 NC_080391.1:47278534-47278548promoter 内 262-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47282273-47293491(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTTAGCAGC
SmilChr02G001884 Chr02 NC_080388.1:34160140-34160154promoter 内 201-215 bp - 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34163940-34164729(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGGAATGACGTGGCA
SmilChr01G001275 Chr01 NC_080387.1:25490388-25490402promoter 内 178-192 bp - 3809 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25486495-25486579(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTGGAAAGT
SmilChr08G003362 Chr08 NC_080394.1:35106136-35106150promoter 内 6-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 35110131-35114461(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGCCACGTCAATTCC
SmilChr08G004710 Chr08 NC_080394.1:56532897-56532911promoter 内 2308-2322 bp + 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 56528501-56531218(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 TGTGGTGACGTGTAA
SmilChr02G005071 Chr02 NC_080388.1:72372498-72372512promoter 内 1553-1567 bp - 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 72374946-72376675(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 GGGGAAGACGTGGAA
SmilChr08G001355 Chr08 NC_080394.1:10867872-10867886promoter 内 3947-3961 bp + 40 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 10867926-10870769(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGGCGACA
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SmilChr02G003698 Chr02 NC_080388.1:58441158-58441172promoter 内 2594-2608 bp + 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 58442565-58448672(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CGCCACGTGGCGACA
SmilChr05G001786 Chr05 NC_080391.1:17596002-17596016promoter 内 2160-2174 bp + 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 17577998-17594175(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCA
SmilChr02G001275 Chr02 NC_080388.1:23394809-23394823promoter 内 2025-2039 bp - 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 23396785-23397816(+) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 CTATCCTACGTGGCA
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SmilChr05G003609 Chr05 NC_080391.1:48168440-48168454promoter 内 1394-1408 bp + 2593 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 48160703-48165847(-) SMil_00003681-RA_Salv MP00318 AGAGTTGACGTGGAA