转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G002147; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004577-RA_Salv SmilChr07G002147 MYB XP_057774045.1 MP00500 AATATGGATAAGG

可能结合的靶基因

9681 个结合位点 6697 个候选靶基因 第 72 / 134 下载 TSV

上一页 72 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001026 Chr01 NC_080387.1:21416033-21416045promoter 内 445-457 bp + 3544 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 21412190-21412489(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAATAA
SmilChr02G001025 Chr02 NC_080388.1:18161315-18161327promoter 内 298-310 bp - 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 18157552-18157624(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGAGAGGATAAGT
SmilChr01G004619 Chr01 NC_080387.1:64201687-64201699promoter 内 204-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 64205484-64206311(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCATTTG
SmilChr03G000024 Chr03 NC_080389.1:368282-368294promoter 内 155-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 363541-364448(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTGTGGATAACA
SmilChr01G004499 Chr01 NC_080387.1:63093070-63093082promoter 内 62-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63088160-63089143(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TTATTGGATAAGT
SmilChr02G002392 Chr02 NC_080388.1:41833245-41833257promoter 内 3579-3591 bp + 410 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 4 41831477-41832835(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATAAT
SmilChr01G002623 Chr01 NC_080387.1:44503848-44503860promoter 内 3616-3628 bp - 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 44504233-44507820(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCTAGCG
SmilChr01G001061 Chr01 NC_080387.1:21924147-21924159promoter 内 3400-3412 bp - 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 21924748-21926213(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCGATA
SmilChr02G001068 Chr02 NC_080388.1:18995289-18995301promoter 内 3020-3032 bp - 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 18992446-18994320(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTGAGGATAAGC
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46057900-46057912promoter 内 2430-2442 bp - 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 46051009-46056341(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTCCGGATAAGG
SmilChr02G005546 Chr02 NC_080388.1:75457485-75457497promoter 内 2429-2441 bp - 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 75453517-75455925(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAATG
SmilChr02G003761 Chr02 NC_080388.1:59286837-59286849promoter 内 969-981 bp - 3020 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 3 59289869-59293995(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACTTATCCAGATA
SmilChr01G005570 Chr01 NC_080387.1:72475086-72475098promoter 内 3895-3907 bp - 94 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 72475192-72477490(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATTATCCATATC
SmilChr01G000798 Chr01 NC_080387.1:17239845-17239857promoter 内 3850-3862 bp + 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 17237048-17239706(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATGT
SmilChr01G001648 Chr01 NC_080387.1:30540932-30540944promoter 内 3188-3200 bp - 801 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 30538737-30540131(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATCGGATAAGC
SmilChr02G005142 Chr02 NC_080388.1:72833235-72833247promoter 内 3044-3056 bp + 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 72830020-72832290(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCAAGA
SmilChr02G000831 Chr02 NC_080388.1:14091416-14091428promoter 内 2735-2747 bp - 1254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 14087237-14090162(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GGATTGGATAATG
SmilChr01G000732 Chr01 NC_080387.1:16289562-16289574promoter 内 2475-2487 bp - 1514 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 16287167-16288048(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATATGGATGAGG
SmilChr02G000203 Chr02 NC_080388.1:2620890-2620902promoter 内 2400-2412 bp - 1589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 2622491-2625144(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCTTTTGT
SmilChr02G002500 Chr02 NC_080388.1:43452555-43452567promoter 内 2108-2120 bp - 1881 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 43449618-43450674(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TATCTGGATAAGT
SmilChr01G005721 Chr01 NC_080387.1:73386525-73386537promoter 内 2033-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 73388493-73389101(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AAGATAGATAAGG
SmilChr01G003445 Chr01 NC_080387.1:53019666-53019678promoter 内 1962-1974 bp + 2027 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 53021705-53025410(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTATGGATAACA
SmilChr01G003506 Chr01 NC_080387.1:53636877-53636889promoter 内 1688-1700 bp + 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 53639190-53642825(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATTATGGATAACA
SmilChr01G001835 Chr01 NC_080387.1:33289579-33289591promoter 内 1599-1611 bp - 2390 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 33283408-33287189(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ATCCAGGATAAGG
SmilChr02G000832 Chr02 NC_080388.1:14091416-14091428promoter 内 1549-1561 bp - 2440 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 14093868-14096579(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCAATCC
SmilChr01G000144 Chr01 NC_080387.1:2435412-2435424promoter 内 1518-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 2432032-2432941(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GTGAAAGATAAGG
SmilChr01G001481 Chr01 NC_080387.1:28587399-28587411promoter 内 1405-1417 bp + 2584 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 28589995-28591016(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 AATTTTGATAAGG
SmilChr02G005547 Chr02 NC_080388.1:75457485-75457497promoter 内 1400-1412 bp - 2589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 75460086-75462745(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCAATTA
SmilChr03G000771 Chr03 NC_080389.1:8806538-8806550promoter 内 1388-1400 bp - 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 8809151-8810054(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCAAGCC
SmilChr02G000053 Chr02 NC_080388.1:709607-709619promoter 内 1322-1334 bp + 2667 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 700214-706940(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCAAATA
SmilChr01G001129 Chr01 NC_080387.1:22958309-22958321promoter 内 1219-1231 bp - 2770 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 22961091-22964830(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCCAACA
SmilChr01G000797 Chr01 NC_080387.1:17239845-17239857promoter 内 1176-1188 bp + 2813 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 17235549-17237032(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTATGT
SmilChr03G000819 Chr03 NC_080389.1:9392490-9392502promoter 内 1168-1180 bp - 2821 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 9386835-9389669(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATGAGATAAGG
SmilChr02G004804 Chr02 NC_080388.1:70224761-70224773promoter 内 323-335 bp - 3666 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 70217075-70221095(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAATG
SmilChr01G005979 Chr01 NC_080387.1:75454744-75454756promoter 内 291-303 bp - 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 75445761-75451046(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CGCTAGGATAAGG
SmilChr01G005080 Chr01 NC_080387.1:68667278-68667290promoter 内 201-213 bp - 3788 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 68671078-68671149(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCCCAAGA
SmilChr02G004340 Chr02 NC_080388.1:65640948-65640960promoter 内 92-104 bp + 3897 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 2 65644857-65647214(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAATG
SmilChr03G000481 Chr03 NC_080389.1:5122487-5122499promoter 内 3982-3994 bp - 7 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 5118033-5122480(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAATGAGATAAGG
SmilChr03G001692 Chr03 NC_080389.1:22436804-22436816promoter 内 3958-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 22432963-22436773(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CAACCAGATAAGG
SmilChr02G001973 Chr02 NC_080388.1:35710997-35711009promoter 内 3939-3951 bp - 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 35711059-35711140(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CATTATCCAGTTC
SmilChr02G003479 Chr02 NC_080388.1:56081007-56081019promoter 内 3850-3862 bp - 139 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 56081158-56081237(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TCTTATCCTACAC
SmilChr02G004806 Chr02 NC_080388.1:70230879-70230891promoter 内 3803-3815 bp - 186 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 70225492-70230693(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TAATTGGATAATG
SmilChr02G004993 Chr02 NC_080388.1:71784792-71784804promoter 内 3764-3776 bp - 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 71782204-71784567(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATATGGATAATA
SmilChr01G005922 Chr01 NC_080387.1:75039141-75039153promoter 内 3752-3764 bp + 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 75037416-75038904(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 CCTTATCAATTTT
SmilChr02G000556 Chr02 NC_080388.1:7839634-7839646promoter 内 3718-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 7833404-7839363(-) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 TGTTATCCATATG
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SmilChr01G003030 Chr01 NC_080387.1:49350340-49350352promoter 内 3658-3670 bp + 331 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 49350683-49353052(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 ACAAAAGATAAGG
SmilChr02G004219 Chr02 NC_080388.1:64405807-64405819promoter 内 3542-3554 bp + 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.9/ 100 1 64406266-64407022(+) SMil_00004577-RA_Salv MP00500 GATATGGATAATA
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