转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 78 / 151 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002410 Chr02 NC_080388.1:42058919-42058931promoter 内 1705-1717 bp + 2284 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 42052869-42056635(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAAAGTAGGTAGT
SmilChr02G004045 Chr02 NC_080388.1:62762496-62762508promoter 内 1697-1709 bp + 2292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62756637-62760204(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAAGTAGGTAGT
SmilChr01G003950 Chr01 NC_080387.1:57876061-57876073promoter 内 1670-1682 bp - 2319 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 57878392-57882862(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGTTTAGGTAAG
SmilChr03G004536 Chr03 NC_080389.1:63395345-63395357promoter 内 1558-1570 bp - 2431 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 63392106-63392914(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTTTG
SmilChr01G004980 Chr01 NC_080387.1:67854218-67854230promoter 内 1509-1521 bp + 2480 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 67848459-67851738(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGTTAGGTAAT
SmilChr05G001950 Chr05 NC_080391.1:19868597-19868609promoter 内 1439-1451 bp - 2550 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 19862415-19866047(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACATAT
SmilChr02G005392 Chr02 NC_080388.1:74537653-74537665promoter 内 1407-1419 bp + 2582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 74532819-74535071(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACGGTAGGTGTG
SmilChr01G000207 Chr01 NC_080387.1:3618066-3618078promoter 内 1346-1358 bp + 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 3611556-3615423(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTTGC
SmilChr01G001441 Chr01 NC_080387.1:28088238-28088250promoter 内 1241-1253 bp + 2748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 28075259-28085490(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTTGC
SmilChr02G001819 Chr02 NC_080388.1:33067123-33067135promoter 内 1143-1155 bp - 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 33060162-33064277(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCTAA
SmilChr03G004241 Chr03 NC_080389.1:60925997-60926009promoter 内 1141-1153 bp + 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 60928857-60931634(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATTGG
SmilChr03G000078 Chr03 NC_080389.1:951230-951242promoter 内 1074-1086 bp + 2915 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 945320-948315(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAATGTAGGTAAA
SmilChr02G004070 Chr02 NC_080388.1:62990578-62990590promoter 内 1063-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 62985067-62987652(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTTAT
SmilChr03G000844 Chr03 NC_080389.1:9635556-9635568promoter 内 1051-1063 bp - 2938 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 9631854-9632618(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAACCTACCTAA
SmilChr01G001123 Chr01 NC_080387.1:22837857-22837869promoter 内 1004-1016 bp + 2985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 22840854-22842220(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACAACT
SmilChr02G004233 Chr02 NC_080388.1:64515560-64515572promoter 内 974-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 64511125-64512545(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTTAA
SmilChr01G000344 Chr01 NC_080387.1:7010972-7010984promoter 内 963-975 bp - 3026 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 7014010-7031591(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAAGTAGGTAAT
SmilChr04G003462 Chr04 NC_080390.1:51092113-51092125promoter 内 786-798 bp + 3203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 51095328-51104879(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATTAG
SmilChr03G002772 Chr03 NC_080389.1:44115368-44115380promoter 内 738-750 bp - 3251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 44118631-44121461(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTATTAGGTAAA
SmilChr04G002021 Chr04 NC_080390.1:32773193-32773205promoter 内 719-731 bp - 3270 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32776475-32777699(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CAATGTAGGTAAA
SmilChr03G002621 Chr03 NC_080389.1:41611364-41611376promoter 内 686-698 bp - 3303 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41602122-41608061(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACATAT
SmilChr02G002399 Chr02 NC_080388.1:41875797-41875809promoter 内 626-638 bp - 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 41879172-41880548(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTAAC
SmilChr04G003956 Chr04 NC_080390.1:55101210-55101222promoter 内 461-473 bp - 3528 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 55104750-55107189(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGTTAGGTAAT
SmilChr01G004614 Chr01 NC_080387.1:64097388-64097400promoter 内 374-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 64089102-64093773(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTACCTACATCT
SmilChr04G000486 Chr04 NC_080390.1:5232166-5232178promoter 内 357-369 bp - 3632 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5235810-5236573(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATATGTAGGTAAA
SmilChr01G001341 Chr01 NC_080387.1:26649471-26649483promoter 内 327-339 bp - 3662 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 26653145-26656117(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATAGTTAGGTAAT
SmilChr01G004834 Chr01 NC_080387.1:66475881-66475893promoter 内 305-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 66466249-66472197(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAACCTACCGCC
SmilChr04G000537 Chr04 NC_080390.1:5961910-5961922promoter 内 217-229 bp - 3772 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 5965694-5971619(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTGGTAGGTGTC
SmilChr01G001775 Chr01 NC_080387.1:32654944-32654956promoter 内 188-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 32658757-32659365(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACATAT
SmilChr01G000107 Chr01 NC_080387.1:1846883-1846895promoter 内 133-145 bp + 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 1850751-1852521(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAACCC
SmilChr03G004237 Chr03 NC_080389.1:60896396-60896408promoter 内 112-124 bp + 3877 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 1 60900285-60905623(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACATAT
SmilChr02G004388 Chr02 NC_080388.1:66244157-66244169promoter 内 3431-3443 bp + 558 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 4 66244727-66248655(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTACCTACCACC
SmilChr03G004403 Chr03 NC_080389.1:62213244-62213256promoter 内 3910-3922 bp - 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 62213335-62217661(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTATG
SmilChr03G000570 Chr03 NC_080389.1:6212081-6212093promoter 内 2832-2844 bp + 1157 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 6213250-6216729(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCGCCTACCTCT
SmilChr03G000907 Chr03 NC_080389.1:10404002-10404014promoter 内 2075-2087 bp + 1914 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 10399492-10402088(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr05G001018 Chr05 NC_080391.1:8335719-8335731promoter 内 1683-1695 bp - 2306 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 3 8338037-8340830(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr04G000967 Chr04 NC_080390.1:12972631-12972643promoter 内 3925-3937 bp + 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 12972707-12973861(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACTGGA
SmilChr03G004397 Chr03 NC_080389.1:62165024-62165036promoter 内 3827-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 62165198-62168913(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTATG
SmilChr04G002016 Chr04 NC_080390.1:32680205-32680217promoter 内 3795-3807 bp - 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 32677657-32680011(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCAAA
SmilChr05G000541 Chr05 NC_080391.1:4146090-4146102promoter 内 3701-3713 bp + 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 4139977-4145802(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CATTGTAGGTAAA
SmilChr02G002158 Chr02 NC_080388.1:38805671-38805683promoter 内 3697-3709 bp - 292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 38804041-38805379(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAAATCT
SmilChr05G000542 Chr05 NC_080391.1:4146090-4146102promoter 内 3687-3699 bp + 302 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 4146404-4153035(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACAATG
SmilChr03G002232 Chr03 NC_080389.1:35219487-35219499promoter 内 3561-3573 bp + 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 35216607-35219059(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGTTGGG
SmilChr01G004351 Chr01 NC_080387.1:61711600-61711612promoter 内 3464-3476 bp - 525 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 61712137-61716762(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr03G002761 Chr03 NC_080389.1:43904620-43904632promoter 内 3419-3431 bp - 570 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 43902231-43904050(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr02G002046 Chr02 NC_080388.1:36865028-36865040promoter 内 3382-3394 bp + 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 36865647-36866610(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GACACCTACCACA
SmilChr01G005383 Chr01 NC_080387.1:71077481-71077493promoter 内 3360-3372 bp + 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 71070234-71076852(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr02G000224 Chr02 NC_080388.1:2904275-2904287promoter 内 3254-3266 bp - 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 2900591-2903540(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCTAA
SmilChr01G005245 Chr01 NC_080387.1:69966316-69966328promoter 内 3181-3193 bp - 808 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 69967136-69969848(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA
SmilChr01G003655 Chr01 NC_080387.1:55000639-55000651promoter 内 3115-3127 bp - 874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 2 55001525-55004715(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTAGGTAGGTGTA