转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G003441; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014538-RA_Salv SmilChr07G003441 NAC XP_057773618.1 MP00108 TTAAGTAAT

可能结合的靶基因

9810 个结合位点 6458 个候选靶基因 第 78 / 130 下载 TSV

上一页 78 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000707 Chr02 NC_080388.1:11394115-11394123promoter 内 699-707 bp + 3294 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 11389817-11390821(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G001621 Chr01 NC_080387.1:30309579-30309587promoter 内 694-702 bp - 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 30304066-30306280(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G002607 Chr02 NC_080388.1:45240820-45240828promoter 内 679-687 bp - 3314 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 45236292-45237506(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr02G004402 Chr02 NC_080388.1:66356926-66356934promoter 内 670-678 bp - 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 66353008-66353603(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr01G003681 Chr01 NC_080387.1:55211601-55211609promoter 内 665-673 bp - 3328 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 55214937-55217804(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G000219 Chr01 NC_080387.1:3862209-3862217promoter 内 662-670 bp - 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 3854243-3858878(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr01G004190 Chr01 NC_080387.1:60361643-60361651promoter 内 662-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 60364982-60367666(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAGT
SmilChr02G000679 Chr02 NC_080388.1:10631251-10631259promoter 内 654-662 bp - 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 10634598-10635767(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G004189 Chr01 NC_080387.1:60339873-60339881promoter 内 650-658 bp + 3343 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 60343224-60344979(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr01G001333 Chr01 NC_080387.1:26524356-26524364promoter 内 642-650 bp - 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 26527715-26528434(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G003352 Chr02 NC_080388.1:54715262-54715270promoter 内 642-650 bp + 3351 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 54710558-54711911(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr03G000274 Chr03 NC_080389.1:3124228-3124236promoter 内 578-586 bp + 3415 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 3127651-3128780(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G004207 Chr01 NC_080387.1:60506334-60506342promoter 内 572-580 bp + 3421 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 60509763-60514700(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTAGT
SmilChr01G002326 Chr01 NC_080387.1:40354856-40354864promoter 内 568-576 bp - 3425 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 40345066-40351431(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G002317 Chr01 NC_080387.1:40170496-40170504promoter 内 551-559 bp - 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 40161020-40167054(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G001550 Chr02 NC_080388.1:28786847-28786855promoter 内 549-557 bp + 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 28790299-28792717(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr01G002054 Chr01 NC_080387.1:36334062-36334070promoter 内 536-544 bp + 3457 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 36328002-36330605(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr01G004467 Chr01 NC_080387.1:62762467-62762475promoter 内 526-534 bp - 3467 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 62755636-62759000(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G005224 Chr01 NC_080387.1:69776807-69776815promoter 内 520-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 69780288-69782071(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr02G002119 Chr02 NC_080388.1:37950330-37950338promoter 内 519-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 37953812-37955934(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr02G001830 Chr02 NC_080388.1:33319502-33319510promoter 内 518-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 33311729-33316027(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G000219 Chr02 NC_080388.1:2849736-2849744promoter 内 509-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 2853228-2855703(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G004152 Chr02 NC_080388.1:63823420-63823428promoter 内 499-507 bp + 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 63826922-63832961(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G005529 Chr01 NC_080387.1:72156539-72156547promoter 内 487-495 bp + 3506 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 72149820-72153033(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr02G002904 Chr02 NC_080388.1:49360663-49360671promoter 内 474-482 bp + 3519 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 49351633-49357144(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G005182 Chr01 NC_080387.1:69533400-69533408promoter 内 464-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 69536937-69538900(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr01G004608 Chr01 NC_080387.1:64057878-64057886promoter 内 460-468 bp + 3533 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 64049753-64054345(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G004021 Chr02 NC_080388.1:62502294-62502302promoter 内 454-462 bp - 3539 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 62505841-62511511(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G001507 Chr01 NC_080387.1:28897596-28897604promoter 内 453-461 bp - 3540 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 28901144-28904373(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G001883 Chr01 NC_080387.1:33864177-33864185promoter 内 450-458 bp - 3543 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 33867728-33868929(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTTACTTAA
SmilChr02G000242 Chr02 NC_080388.1:3128805-3128813promoter 内 445-453 bp - 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 3122092-3125257(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TCAAGTAAT
SmilChr02G002663 Chr02 NC_080388.1:46123770-46123778promoter 内 432-440 bp - 3561 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 46127339-46128032(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr02G001702 Chr02 NC_080388.1:31325050-31325058promoter 内 385-393 bp - 3608 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 31328666-31332478(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr02G002954 Chr02 NC_080388.1:50078424-50078432promoter 内 378-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 50082047-50087555(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr03G000101 Chr03 NC_080389.1:1128702-1128710promoter 内 377-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 1122336-1125086(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr03G000338 Chr03 NC_080389.1:3845874-3845882promoter 内 374-382 bp + 3619 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 3839141-3842255(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr01G005323 Chr01 NC_080387.1:70441952-70441960promoter 内 367-375 bp - 3626 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 70445586-70457056(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTAT
SmilChr01G000017 Chr01 NC_080387.1:363990-363998promoter 内 353-361 bp + 3640 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 367638-370713(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTACT
SmilChr01G004718 Chr01 NC_080387.1:65393040-65393048promoter 内 346-354 bp + 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 65386205-65389393(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr01G002478 Chr01 NC_080387.1:42516672-42516680promoter 内 344-352 bp - 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 42520329-42524352(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTCA
SmilChr01G002838 Chr01 NC_080387.1:46966474-46966482promoter 内 342-350 bp + 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 46970133-46971150(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TGAAGTAAT
SmilChr01G000290 Chr01 NC_080387.1:5674936-5674944promoter 内 340-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 5678597-5681222(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G003699 Chr02 NC_080388.1:58451243-58451251promoter 内 326-334 bp - 3667 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 58454918-58457152(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 AGTACTTAA
SmilChr02G005484 Chr02 NC_080388.1:75046526-75046534promoter 内 316-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 75039542-75042849(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr01G000224 Chr01 NC_080387.1:3977204-3977212promoter 内 312-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 3980893-3981438(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ACTACTTAA
SmilChr01G004646 Chr01 NC_080387.1:64522872-64522880promoter 内 310-318 bp - 3683 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 64517654-64519189(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 TTAAGTACT
SmilChr02G003428 Chr02 NC_080388.1:55514364-55514372promoter 内 302-310 bp + 3691 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 55508429-55510673(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATTACTTGA
SmilChr02G002234 Chr02 NC_080388.1:39673846-39673854promoter 内 295-303 bp + 3698 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 39677552-39681626(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT
SmilChr01G004325 Chr01 NC_080387.1:61411540-61411548promoter 内 292-300 bp + 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 61404681-61407839(-) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 AGTACTTAA
SmilChr02G003777 Chr02 NC_080388.1:59443943-59443951promoter 内 288-296 bp + 3705 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.2/ 100 2 59447656-59449556(+) SMil_00014538-RA_Salv MP00108 ATAAGTAAT