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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007215-RA_Salv SmilChr01G003955 WRKY XP_057779712.1 MP00450 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 79 / 161 下载 TSV

上一页 79 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005760 Chr01 NC_080387.1:73704629-73704642promoter 内 1142-1155 bp - 2846 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 73700573-73701783(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGTTTTGACTTTTG
SmilChr03G004725 Chr03 NC_080389.1:64443000-64443013promoter 内 1125-1138 bp - 2863 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 64445876-64448146(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGAATGTCAACGGC
SmilChr04G002832 Chr04 NC_080390.1:44428822-44428835promoter 内 1122-1135 bp - 2866 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44431701-44440901(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGGAAGTCAACTTT
SmilChr05G002594 Chr05 NC_080391.1:29175319-29175332promoter 内 1085-1098 bp - 2903 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 29167972-29172416(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TATGTTGACTTTCC
SmilChr07G003770 Chr07 NC_080393.1:46113085-46113098promoter 内 931-944 bp - 3057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 46106794-46110028(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GATGTTGACTTCTT
SmilChr03G003675 Chr03 NC_080389.1:55581028-55581041promoter 内 863-876 bp + 3125 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 55584166-55587978(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TATGTTGACTTTCC
SmilChr07G001524 Chr07 NC_080393.1:12227705-12227718promoter 内 800-813 bp + 3188 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 12230906-12255744(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAGTTGACTTATT
SmilChr05G002868 Chr05 NC_080391.1:34326686-34326699promoter 内 775-788 bp - 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 34329912-34333083(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGAAGTCAACATC
SmilChr01G003899 Chr01 NC_080387.1:57277283-57277296promoter 内 697-710 bp + 3291 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 57280587-57285754(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTATTTGACTTTTA
SmilChr07G004156 Chr07 NC_080393.1:53407636-53407649promoter 内 618-631 bp + 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 53403196-53404266(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GCAGAGTCAACGCA
SmilChr07G003599 Chr07 NC_080393.1:42074308-42074321promoter 内 612-625 bp - 3376 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 42067351-42070932(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTCGTTGACATTGT
SmilChr01G002039 Chr01 NC_080387.1:36049808-36049821promoter 内 520-533 bp + 3468 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 36053289-36056257(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACCTTTGACTTTAA
SmilChr06G002336 Chr06 NC_080392.1:33897115-33897128promoter 内 353-366 bp - 3635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 33900763-33916362(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAATAGTCAACTGC
SmilChr06G003168 Chr06 NC_080392.1:44637934-44637947promoter 内 336-349 bp - 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 44631217-44634282(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCATTTGACTTTTG
SmilChr01G000667 Chr01 NC_080387.1:14826890-14826903promoter 内 202-215 bp + 3786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 14820548-14823104(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGAGGTCAACGGA
SmilChr05G003326 Chr05 NC_080391.1:43622467-43622480promoter 内 121-134 bp - 3867 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 1 43626347-43628769(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAACAC
SmilChr01G003660 Chr01 NC_080387.1:55026346-55026359promoter 内 3071-3084 bp + 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 3 55020547-55025429(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATTAAGTCAACCCC
SmilChr02G002119 Chr02 NC_080388.1:37953622-37953635promoter 内 3811-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 37953812-37955934(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGGTTTGACTTTCG
SmilChr03G000102 Chr03 NC_080389.1:1136386-1136399promoter 内 3809-3822 bp + 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 1136578-1142278(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAGTTGACTTCTC
SmilChr07G004592 Chr07 NC_080393.1:58721853-58721866promoter 内 3626-3639 bp + 362 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 58719919-58721491(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAGAAGTCAACTTG
SmilChr07G000312 Chr07 NC_080393.1:2091122-2091135promoter 内 3390-3403 bp - 598 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 2091733-2097108(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAATGT
SmilChr06G001607 Chr06 NC_080392.1:17906313-17906326promoter 内 3172-3185 bp - 816 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 17907142-17909770(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAACATA
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SmilChr05G003095 Chr05 NC_080391.1:39337807-39337820promoter 内 984-997 bp + 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 39340824-39341303(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCCGTTGACTCTGG
SmilChr04G002582 Chr04 NC_080390.1:41203811-41203824promoter 内 709-722 bp + 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 41207103-41210873(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGAGTTGACTTCAA
SmilChr07G000235 Chr07 NC_080393.1:1520961-1520974promoter 内 416-429 bp + 3572 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 1524546-1530969(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GGATTTGACTTTCC
SmilChr01G000826 Chr01 NC_080387.1:17805325-17805338promoter 内 366-379 bp + 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 17795788-17801703(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACAAAGTCAAATAC
SmilChr03G003315 Chr03 NC_080389.1:51393716-51393729promoter 内 363-376 bp + 3625 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 51397354-51400647(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GCTGTTGACTTCTA
SmilChr01G003724 Chr01 NC_080387.1:55562162-55562175promoter 内 220-233 bp + 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 2 55553418-55558394(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGGAAGTCAACCGT
SmilChr02G000585 Chr02 NC_080388.1:8421742-8421755promoter 内 3966-3979 bp + 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8421777-8425584(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGTTTGACTTTTT
SmilChr01G004669 Chr01 NC_080387.1:64793161-64793174promoter 内 3919-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 64792241-64793092(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGAAGTCAAAGTC
SmilChr07G003049 Chr07 NC_080393.1:31796058-31796071promoter 内 3913-3926 bp + 75 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 31791809-31795983(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAGAGGTCAACGCA
SmilChr01G002501 Chr01 NC_080387.1:42847795-42847808promoter 内 3831-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 42844910-42847638(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CTGTTTGACTTTTG
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SmilChr01G005403 Chr01 NC_080387.1:71295665-71295678promoter 内 3818-3831 bp - 170 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 71295848-71297322(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTAAAGTCAAAGCA
SmilChr01G001445 Chr01 NC_080387.1:28144275-28144288promoter 内 3704-3717 bp - 284 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 28144572-28148054(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAATGGC
SmilChr04G001855 Chr04 NC_080390.1:30188251-30188264promoter 内 3700-3713 bp - 288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 30186711-30187963(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATCGTTGACATTTC
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SmilChr06G000860 Chr06 NC_080392.1:8127376-8127389promoter 内 3619-3632 bp + 369 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 8127758-8135321(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGCTTTGACTTTAA
SmilChr06G002079 Chr06 NC_080392.1:27406435-27406448promoter 内 3492-3505 bp + 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 27406944-27409455(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GCCATTGACTTTTC
SmilChr01G000589 Chr01 NC_080387.1:12816352-12816365promoter 内 3477-3490 bp - 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 12816876-12820859(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGAAGTCAAAGGG
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SmilChr01G001964 Chr01 NC_080387.1:34972045-34972058promoter 内 3240-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 34969412-34971297(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACATTTGACTTTTA
SmilChr07G002467 Chr07 NC_080393.1:23215495-23215508promoter 内 3217-3230 bp - 771 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 23216279-23217963(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AACAAGTCAACTAC
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SmilChr06G003035 Chr06 NC_080392.1:43153454-43153467promoter 内 3156-3169 bp + 832 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 43149679-43152622(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAACTT
SmilChr02G002700 Chr02 NC_080388.1:46802612-46802625promoter 内 3113-3126 bp - 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.0/ 100 1 46797249-46801737(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GTATTTGACTTTGT