转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004114; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00012717-RA_Salv SmilChr01G004114 WRKY XP_057781125.1 MP00284 AAAAGTCAACG

可能结合的靶基因

9774 个结合位点 6552 个候选靶基因 第 8 / 132 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003579 Chr02 NC_080388.1:56960635-56960645promoter 内 2423-2433 bp - 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 56962213-56966574(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTATT
SmilChr01G002879 Chr01 NC_080387.1:47397900-47397910promoter 内 2287-2297 bp - 1704 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 47394962-47396196(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AATAGTCAACG
SmilChr02G001637 Chr02 NC_080388.1:30375640-30375650promoter 内 2041-2051 bp - 1950 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 30377600-30380213(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTAT
SmilChr02G002705 Chr02 NC_080388.1:46907578-46907588promoter 内 1906-1916 bp - 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46898764-46905493(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AATAGTCAACG
SmilChr01G000812 Chr01 NC_080387.1:17542590-17542600promoter 内 1530-1540 bp - 2461 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 17538360-17540129(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 ATAAGTCAACG
SmilChr02G002176 Chr02 NC_080388.1:38987115-38987125promoter 内 1061-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 38980129-38984185(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTAT
SmilChr03G001549 Chr03 NC_080389.1:19542630-19542640promoter 内 506-516 bp - 3485 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 19536479-19539145(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 ATAAGTCAACG
SmilChr02G003577 Chr02 NC_080388.1:56943832-56943842promoter 内 488-498 bp + 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 56939348-56940329(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTAT
SmilChr02G000646 Chr02 NC_080388.1:9760111-9760121promoter 内 428-438 bp - 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 9763684-9767184(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTATT
SmilChr02G001204 Chr02 NC_080388.1:22201393-22201403promoter 内 2211-2221 bp + 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 6 22198792-22199613(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G003543 Chr01 NC_080387.1:54017897-54017907promoter 内 3434-3444 bp - 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 54014397-54017340(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGAAGTCAACG
SmilChr01G005301 Chr01 NC_080387.1:70295628-70295638promoter 内 1263-1273 bp - 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 70298366-70299252(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G002699 Chr01 NC_080387.1:45257553-45257563promoter 内 290-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 45261264-45263971(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G004444 Chr01 NC_080387.1:62557781-62557791promoter 内 2612-2622 bp + 1379 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 62559170-62565033(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGAAGTCAACG
SmilChr01G004443 Chr01 NC_080387.1:62557781-62557791promoter 内 2271-2281 bp + 1720 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 62554906-62556061(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G004788 Chr01 NC_080387.1:66105253-66105263promoter 内 1847-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 66107407-66110445(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr03G001601 Chr03 NC_080389.1:20334464-20334474promoter 内 3334-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 20335131-20336309(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGAAGTCAACG
SmilChr01G001035 Chr01 NC_080387.1:21501548-21501558promoter 内 2650-2660 bp + 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 21502899-21503822(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGAAGTCAACG
SmilChr02G003522 Chr02 NC_080388.1:56393475-56393485promoter 内 1897-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56395579-56397687(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G004793 Chr01 NC_080387.1:66164504-66164514promoter 内 1847-1857 bp - 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 66166658-66169694(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr02G005231 Chr02 NC_080388.1:73510641-73510651promoter 内 1625-1635 bp + 2366 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 73504800-73508275(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr02G001292 Chr02 NC_080388.1:23748112-23748122promoter 内 1610-1620 bp + 2381 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 23739913-23745731(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr02G000085 Chr02 NC_080388.1:1120128-1120138promoter 内 1568-1578 bp - 2423 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1122561-1123919(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr02G000619 Chr02 NC_080388.1:9065798-9065808promoter 内 1469-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 9068330-9069128(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G004789 Chr01 NC_080387.1:66112223-66112233promoter 内 577-587 bp - 3414 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 66115647-66117585(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CGTTGACTTCG
SmilChr01G004931 Chr01 NC_080387.1:67364899-67364909promoter 内 2248-2258 bp - 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 67366652-67368209(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr02G001608 Chr02 NC_080388.1:29948924-29948934promoter 内 1578-1588 bp + 2413 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 4 29944973-29946511(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr01G004238 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 3776-3786 bp + 215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 60710545-60711123(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr01G004237 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 3230-3240 bp + 761 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 60709018-60709559(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr01G004236 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 2776-2786 bp + 1215 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 60708292-60709105(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr01G004239 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 2302-2312 bp + 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 60712019-60715266(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr01G004235 Chr01 NC_080387.1:60710320-60710330promoter 内 1753-1763 bp + 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 60707062-60708082(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr03G001147 Chr03 NC_080389.1:13227495-13227505promoter 内 1062-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 13222908-13224566(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr01G000670 Chr01 NC_080387.1:14835934-14835944promoter 内 3795-3805 bp - 196 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 14835325-14835738(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr01G000548 Chr01 NC_080387.1:11346964-11346974promoter 内 3787-3797 bp + 204 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 11347178-11347583(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr02G001011 Chr02 NC_080388.1:17863738-17863748promoter 内 3432-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17864307-17865524(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr02G004025 Chr02 NC_080388.1:62533892-62533902promoter 内 2470-2480 bp + 1521 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 62535423-62536604(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr02G002278 Chr02 NC_080388.1:40266621-40266631promoter 内 2155-2165 bp - 1836 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 40268467-40269588(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr01G003147 Chr01 NC_080387.1:50288951-50288961promoter 内 2118-2128 bp - 1873 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50283121-50287078(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr03G000817 Chr03 NC_080389.1:9341190-9341200promoter 内 2085-2095 bp + 1906 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 9336319-9339284(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr03G000176 Chr03 NC_080389.1:1908936-1908946promoter 内 2074-2084 bp + 1917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 1903647-1907019(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr02G001555 Chr02 NC_080388.1:28855780-28855790promoter 内 1999-2009 bp + 1992 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 28857782-28868220(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr02G004304 Chr02 NC_080388.1:65421704-65421714promoter 内 1403-1413 bp + 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 65424302-65430699(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr02G004753 Chr02 NC_080388.1:69724308-69724318promoter 内 871-881 bp + 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 69727438-69727509(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr02G004754 Chr02 NC_080388.1:69724308-69724318promoter 内 681-691 bp + 3310 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 69727628-69728425(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr03G000177 Chr03 NC_080389.1:1911772-1911782promoter 内 633-643 bp + 3358 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 1915140-1916637(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 CAAAGTCAACT
SmilChr01G002907 Chr01 NC_080387.1:47788577-47788587promoter 内 340-350 bp - 3651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 47792238-47793432(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr03G001441 Chr03 NC_080389.1:17149552-17149562promoter 内 41-51 bp + 3950 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 17144939-17145602(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr03G001498 Chr03 NC_080389.1:18316670-18316680promoter 内 3788-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 18313625-18316467(-) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG
SmilChr01G000998 Chr01 NC_080387.1:21016187-21016197promoter 内 3760-3770 bp - 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21016428-21018133(+) SMil_00012717-RA_Salv MP00284 AGTTGACTTTG