转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 8 / 148 下载 TSV

上一页 8 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002140 Chr03 NC_080389.1:33335599-33335612promoter 内 1786-1799 bp - 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 33337814-33343397(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTGCA
SmilChr07G004465 Chr07 NC_080393.1:57234808-57234821promoter 内 1546-1559 bp + 2442 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 57237263-57237814(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCGTGCCACGTGG
SmilChr01G003232 Chr01 NC_080387.1:51092175-51092188promoter 内 3934-3947 bp - 54 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 51088112-51092121(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGAGGACACGTGG
SmilChr02G000268 Chr02 NC_080388.1:3474804-3474817promoter 内 3901-3914 bp + 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 3474904-3475671(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCAGCACACGTGG
SmilChr02G003398 Chr02 NC_080388.1:55120255-55120268promoter 内 3895-3908 bp + 93 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 55120361-55122165(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCACGCCACGTGG
SmilChr07G000474 Chr07 NC_080393.1:3316368-3316381promoter 内 3786-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 3312539-3316166(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCGTGCA
SmilChr07G000475 Chr07 NC_080393.1:3316368-3316381promoter 内 3117-3130 bp + 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 3317252-3324420(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCACGGCACGTGG
SmilChr01G003092 Chr01 NC_080387.1:49734197-49734210promoter 内 3111-3124 bp + 877 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 49735087-49740054(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGTGTCACGTGC
SmilChr04G002327 Chr04 NC_080390.1:37577979-37577992promoter 内 3073-3086 bp + 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 37578907-37584645(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAGCACACGTGG
SmilChr02G003765 Chr02 NC_080388.1:59351523-59351536promoter 内 3015-3028 bp + 973 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 59352509-59353943(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGGGGTCACGTGG
SmilChr02G000269 Chr02 NC_080388.1:3474804-3474817promoter 内 2901-2914 bp + 1087 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 3475904-3479548(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCAGCACACGTGG
SmilChr05G002583 Chr05 NC_080391.1:29049516-29049529promoter 内 2722-2735 bp + 1266 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 29044329-29048250(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCTGCC
SmilChr05G001099 Chr05 NC_080391.1:9151397-9151410promoter 内 2613-2626 bp + 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 9152785-9157046(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTAGGTCACGTGG
SmilChr04G002956 Chr04 NC_080390.1:45902822-45902835promoter 内 2558-2571 bp + 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 45904265-45908564(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCGAGACACGTGG
SmilChr04G000065 Chr04 NC_080390.1:587654-587667promoter 内 2449-2462 bp - 1539 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 589206-590540(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCCCTT
SmilChr04G004179 Chr04 NC_080390.1:56375367-56375380promoter 内 2427-2440 bp + 1561 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 56376941-56383053(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCCGGGCACGTGG
SmilChr06G001740 Chr06 NC_080392.1:20063047-20063060promoter 内 2332-2345 bp - 1656 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 20064716-20066005(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACACTCC
SmilChr02G005434 Chr02 NC_080388.1:74760250-74760263promoter 内 2302-2315 bp - 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 74755413-74758564(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGAAGTCACGTGC
SmilChr02G003375 Chr02 NC_080388.1:54891347-54891360promoter 内 2220-2233 bp + 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 54887308-54889579(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGCTGCC
SmilChr05G004120 Chr05 NC_080391.1:55106004-55106017promoter 内 1957-1970 bp - 2031 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 55108048-55113002(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTGCA
SmilChr04G000889 Chr04 NC_080390.1:11404830-11404843promoter 内 1914-1927 bp + 2074 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 11400353-11402756(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCCTCG
SmilChr06G001739 Chr06 NC_080392.1:20063047-20063060promoter 内 1755-1768 bp - 2233 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 20059744-20060814(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGTGTCACGTGC
SmilChr08G000567 Chr08 NC_080394.1:4111539-4111552promoter 内 1683-1696 bp + 2305 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 4109039-4109234(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCTTCA
SmilChr03G003706 Chr03 NC_080389.1:56004994-56005007promoter 内 909-922 bp + 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 56008086-56008159(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGAGGACACGTGG
SmilChr06G002475 Chr06 NC_080392.1:35584423-35584436promoter 内 349-362 bp + 3639 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 35588075-35590232(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGGTGACACGTGG
SmilChr02G002153 Chr02 NC_080388.1:38747998-38748011promoter 内 3449-3462 bp - 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 38748550-38761334(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGCGTC
SmilChr04G003536 Chr04 NC_080390.1:51724843-51724856promoter 内 3800-3813 bp + 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 51720969-51724655(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTCCG
SmilChr07G000850 Chr07 NC_080393.1:6062686-6062699promoter 内 3516-3529 bp - 472 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 6063171-6068599(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTCCG
SmilChr05G002911 Chr05 NC_080391.1:35080334-35080347promoter 内 3378-3391 bp + 610 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 35080957-35081823(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGGGCCACGTGG
SmilChr02G002967 Chr02 NC_080388.1:50191116-50191129promoter 内 2375-2388 bp + 1613 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 50182192-50189503(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATGCT
SmilChr05G002781 Chr05 NC_080391.1:32495077-32495090promoter 内 166-179 bp - 3822 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 32498912-32501073(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACGAC
SmilChr06G001894 Chr06 NC_080392.1:22680885-22680898promoter 内 3938-3951 bp - 50 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22676724-22680835(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACGCGCCACGTGG
SmilChr07G000995 Chr07 NC_080393.1:7234508-7234521promoter 内 3929-3942 bp + 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 7234580-7238206(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAAGGGCACGTGG
SmilChr04G000055 Chr04 NC_080390.1:488484-488497promoter 内 3900-3913 bp - 88 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 488585-495235(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCCAT
SmilChr08G000286 Chr08 NC_080394.1:1953429-1953442promoter 内 3738-3751 bp + 250 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 1947392-1953179(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTCCAC
SmilChr02G001940 Chr02 NC_080388.1:34948564-34948577promoter 内 3476-3489 bp + 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 34945845-34948052(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCTCCAC
SmilChr04G001892 Chr04 NC_080390.1:30892423-30892436promoter 内 3351-3364 bp - 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 30883867-30891786(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCGCCGCACGTGG
SmilChr06G002775 Chr06 NC_080392.1:40373073-40373086promoter 内 3138-3151 bp + 850 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 40373936-40374934(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGGCGACACGTGG
SmilChr01G006081 Chr01 NC_080387.1:76272425-76272438promoter 内 2955-2968 bp + 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 76273471-76278930(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGGCGACACGTGG
SmilChr04G003537 Chr04 NC_080390.1:51727054-51727067promoter 内 1833-1846 bp - 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 51729222-51732261(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTCCG
SmilChr05G002155 Chr05 NC_080391.1:22757209-22757222promoter 内 1352-1365 bp - 2636 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22753431-22754573(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGTGACACGTGG
SmilChr01G003773 Chr01 NC_080387.1:56114149-56114162promoter 内 1074-1087 bp + 2914 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 56117076-56123250(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGTGACACGTGG
SmilChr07G000994 Chr07 NC_080393.1:7234508-7234521promoter 内 920-933 bp + 3068 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 7230476-7231440(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTTCT
SmilChr03G003119 Chr03 NC_080389.1:48350349-48350362promoter 内 476-489 bp + 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 48353874-48354685(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGTGACACGTGG
SmilChr01G001201 Chr01 NC_080387.1:24210351-24210364promoter 内 221-234 bp - 3767 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 24214131-24217214(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCCAT
SmilChr06G000914 Chr06 NC_080392.1:8664230-8664243promoter 内 3395-3408 bp + 593 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 8664836-8667006(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGGGGCCACGTGG
SmilChr05G003669 Chr05 NC_080391.1:49645352-49645365promoter 内 928-941 bp + 3060 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 49641705-49642292(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCCCAT
SmilChr03G000505 Chr03 NC_080389.1:5451724-5451737promoter 内 921-934 bp + 3067 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 5447638-5448657(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCCCAT
SmilChr06G001800 Chr06 NC_080392.1:21167877-21167890promoter 内 67-80 bp + 3921 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 21171811-21173884(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAGTGACACGTGG
SmilChr01G004850 Chr01 NC_080387.1:66648205-66648218promoter 内 3918-3931 bp + 70 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 66645360-66648135(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCCCAAC