转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 80 / 136 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003658 Chr08 NC_080394.1:40323700-40323710promoter 内 226-236 bp - 3765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 40327475-40328453(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr05G001015 Chr05 NC_080391.1:8319702-8319712promoter 内 166-176 bp - 3825 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 8313665-8315877(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCAGG
SmilChr03G003871 Chr03 NC_080389.1:57810825-57810835promoter 内 165-175 bp + 3826 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 57804682-57806999(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGAC
SmilChr01G002648 Chr01 NC_080387.1:44810706-44810716promoter 内 162-172 bp - 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 44802533-44806877(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr01G002252 Chr01 NC_080387.1:39154195-39154205promoter 内 145-155 bp - 3846 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 39158051-39158855(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr07G000559 Chr07 NC_080393.1:3844490-3844500promoter 内 116-126 bp - 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 3848375-3849466(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr08G000388 Chr08 NC_080394.1:2728214-2728224promoter 内 85-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 2720012-2724308(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGC
SmilChr08G001316 Chr08 NC_080394.1:10517574-10517584promoter 内 81-91 bp + 3910 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 10521494-10524582(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGGC
SmilChr02G003555 Chr02 NC_080388.1:56733275-56733285promoter 内 63-73 bp + 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56728232-56729347(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCTGCTGAGCT
SmilChr03G002501 Chr03 NC_080389.1:39837954-39837964promoter 内 52-62 bp + 3939 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 39841903-39857654(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTC
SmilChr06G003060 Chr06 NC_080392.1:43494161-43494171promoter 内 26-36 bp + 3965 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 43487282-43490196(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr02G004088 Chr02 NC_080388.1:63168266-63168276promoter 内 20-30 bp + 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 63161852-63164295(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr02G005018 Chr02 NC_080388.1:71961493-71961503promoter 内 12-22 bp - 3979 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 71955985-71957514(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACC
SmilChr01G001927 Chr01 NC_080387.1:34417526-34417536promoter 内 3-13 bp - 3988 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 34412044-34413538(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGTCAGCGCC
SmilChr08G004709 Chr08 NC_080394.1:56529785-56529795promoter 内 1-11 bp + 3990 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.4/ 100 1 56519209-56525795(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCT
SmilChr03G001972 Chr03 NC_080389.1:28414825-28414835promoter 内 2871-2881 bp + 1120 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 28415955-28416551(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCG
SmilChr03G002461 Chr03 NC_080389.1:38976951-38976961promoter 内 2724-2734 bp + 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 38967393-38975684(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr02G003841 Chr02 NC_080388.1:60133655-60133665promoter 内 2184-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 60135472-60136046(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr07G000231 Chr07 NC_080393.1:1495405-1495415promoter 内 1179-1189 bp + 2812 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 1498227-1502313(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
SmilChr01G003896 Chr01 NC_080387.1:57241687-57241697promoter 内 860-870 bp + 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 57244828-57245883(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCACAGCGCG
SmilChr01G004734 Chr01 NC_080387.1:65521182-65521192promoter 内 532-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 65513431-65517723(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCG
SmilChr05G004333 Chr05 NC_080391.1:57016071-57016081promoter 内 402-412 bp - 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 57019670-57023424(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGGC
SmilChr02G000073 Chr02 NC_080388.1:916988-916998promoter 内 380-390 bp + 3611 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 2 920609-921277(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCACAGCGCG
SmilChr08G000986 Chr08 NC_080394.1:7391021-7391031promoter 内 3923-3933 bp - 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7391099-7393209(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGT
SmilChr08G001029 Chr08 NC_080394.1:7819637-7819647promoter 内 3848-3858 bp - 143 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 7819790-7821764(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGT
SmilChr04G003165 Chr04 NC_080390.1:48264943-48264953promoter 内 3831-3841 bp + 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 48265113-48266952(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAC
SmilChr08G003069 Chr08 NC_080394.1:30880286-30880296promoter 内 3641-3651 bp - 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 30876369-30879936(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCA
SmilChr02G005040 Chr02 NC_080388.1:72130794-72130804promoter 内 3542-3552 bp + 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 72131253-72136802(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGTA
SmilChr02G005309 Chr02 NC_080388.1:73995161-73995171promoter 内 3409-3419 bp - 582 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 73995753-73997638(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGT
SmilChr03G002953 Chr03 NC_080389.1:46248499-46248509promoter 内 3369-3379 bp + 622 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 46249131-46253973(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr02G003935 Chr02 NC_080388.1:61416909-61416919promoter 内 3354-3364 bp + 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 61412549-61416272(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGGT
SmilChr07G000536 Chr07 NC_080393.1:3716810-3716820promoter 内 3307-3317 bp + 684 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3715181-3716126(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr03G003967 Chr03 NC_080389.1:58723232-58723242promoter 内 3304-3314 bp - 687 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 58720553-58722545(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACTTCAGCGCG
SmilChr02G005427 Chr02 NC_080388.1:74723351-74723361promoter 内 3173-3183 bp - 818 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 74724179-74724652(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCGGCTGAGCC
SmilChr02G001777 Chr02 NC_080388.1:32545527-32545537promoter 内 3080-3090 bp - 911 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 32538679-32544616(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTTCAGCGCA
SmilChr02G004455 Chr02 NC_080388.1:66950443-66950453promoter 内 2980-2990 bp + 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 66940716-66949432(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCGCTGAACC
SmilChr05G004113 Chr05 NC_080391.1:54976212-54976222promoter 内 2922-2932 bp + 1069 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 54977291-54977857(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr04G003138 Chr04 NC_080390.1:47963151-47963161promoter 内 2779-2789 bp + 1212 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 47964373-47973384(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
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SmilChr07G000133 Chr07 NC_080393.1:787035-787045promoter 内 2736-2746 bp - 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 788300-789816(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr02G001744 Chr02 NC_080388.1:32029347-32029357promoter 内 2709-2719 bp + 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 32030639-32044341(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr02G005109 Chr02 NC_080388.1:72600256-72600266promoter 内 2576-2586 bp - 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 72597857-72598841(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT
SmilChr02G005426 Chr02 NC_080388.1:74723351-74723361promoter 内 2493-2503 bp - 1498 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 74721224-74721853(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCGA
SmilChr02G001973 Chr02 NC_080388.1:35709498-35709508promoter 内 2440-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 35711059-35711140(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCACA
SmilChr03G002233 Chr03 NC_080389.1:35240310-35240320promoter 内 2415-2425 bp + 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 35236852-35238734(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGT
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SmilChr03G003968 Chr03 NC_080389.1:58723232-58723242promoter 内 2282-2292 bp - 1709 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 58724951-58735781(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGT
SmilChr01G004324 Chr01 NC_080387.1:61400832-61400842promoter 内 2248-2258 bp - 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 61402585-61404376(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr07G000535 Chr07 NC_080393.1:3716810-3716820promoter 内 2248-2258 bp + 1743 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 3714267-3715067(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGT
SmilChr07G003994 Chr07 NC_080393.1:51003572-51003582promoter 内 2240-2250 bp - 1751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.3/ 100 1 50998222-51001821(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGTT